42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4178 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4178  phage related lysozyme  100 
 
 		 96 aa  197  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.579424  normal  0.832729 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3388  lysozyme  47.25 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.836181  hitchhiker  0.000487886 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0702  phage-related lysozyme  40.66 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.513061  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3158  glycoside hydrolase family protein  41.11 
 
 		 417 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0875  Lysozyme  38.54 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.225375  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4258  lysozyme  42.68 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00805915 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1402  phage lysozyme  43 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000103436 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1065  phage lysozyme  43 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000243456 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4784  lysozyme  42.68 
 
 		 148 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.156327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2819  phage lysozyme  43 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.559643  normal  0.149188 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2321  glycoside hydrolase family protein  41.76 
 
 		 341 aa  65.1  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1492  glycoside hydrolase family protein  43.33 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1057  lysozyme  37.78 
 
 		 220 aa  63.9  0.0000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.738881  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1032  putative bacteriophage lysozyme  38.89 
 
 		 205 aa  60.5  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.326117  normal  0.312631 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0240  phage lysozyme  35.56 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0155947  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0631  phage lysozyme  37.36 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000760504  normal  0.0607386 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2043  Lysozyme  39.33 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1735  Lysozyme  39.33 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0740685  normal  0.733452 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5913  glycoside hydrolase family 24  37.63 
 
 		 165 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.160678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1537  hypothetical protein  37.08 
 
 		 583 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0912  lysozyme  36.26 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0580  Lysozyme  34.83 
 
 		 153 aa  52  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4051  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35 
 
 		 267 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1053  lysozyme  36.26 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1178  lysozyme  33.33 
 
 		 164 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1293  glycoside hydrolase family protein  30.49 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.616877  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1312  phage-related lysozyme  34.44 
 
 		 166 aa  47  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5063  lysozyme  35.9 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0693  lysozyme  35.9 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1733  glycoside hydrolase family 24  32 
 
 		 391 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.614452 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0965  glycoside hydrolase family protein  33.64 
 
 		 225 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000238073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0821  glycoside hydrolase family protein  33.64 
 
 		 225 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000529126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1487  phage-related lysozyme  33.33 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0419  phage-related lysozyme  33.33 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1412  glycoside hydrolase family 24  32.47 
 
 		 209 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.249747  normal  0.117742 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1416  glycoside hydrolase family protein  33.77 
 
 		 187 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  0.189394 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1158  phage-related lysozyme  32.22 
 
 		 166 aa  44.3  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.901858  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1690  glycoside hydrolase family 24  32.47 
 
 		 187 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.332829  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0875  glycoside hydrolase family protein  33.73 
 
 		 178 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5743  peptidoglycan-binding LysM  30.1 
 
 		 571 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.538891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2404  glycoside hydrolase family 24  35.29 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4421  glycoside hydrolase family protein  33.71 
 
 		 243 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>