182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2618 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2618  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  100 
 
 
89 aa  175  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368424 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08050  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  60.47 
 
 
90 aa  104  3e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3822  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  56.18 
 
 
92 aa  99  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564526  normal  0.0529395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2486  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  57.89 
 
 
90 aa  85.9  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3235  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  44.94 
 
 
90 aa  78.6  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2408  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  49.38 
 
 
84 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.349074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2124  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  49.37 
 
 
86 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.181961  normal  0.0268244 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4589  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  49.43 
 
 
93 aa  75.5  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3752  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  47.56 
 
 
93 aa  74.3  0.0000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2536  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  50 
 
 
92 aa  73.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2137  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  48.1 
 
 
86 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613834  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2183  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  48.1 
 
 
86 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.195467 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2437  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  44.87 
 
 
97 aa  72.8  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0536  hydrogenase expression/formation protein, HupF/HypC  46.25 
 
 
100 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2706  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  48.15 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2185  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.9 
 
 
99 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.262576 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0470  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.9 
 
 
85 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.503239  normal  0.167546 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4603  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  43.59 
 
 
86 aa  70.1  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0861  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.21 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.339436  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0713  hydrogenase assembly chaperone HypC  43.21 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.487958  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0794  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  46.15 
 
 
82 aa  69.3  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.481869  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1287  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  48.65 
 
 
88 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.917168  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3876  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.59 
 
 
81 aa  68.6  0.00000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1097  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.17 
 
 
89 aa  65.5  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3967  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  41.25 
 
 
81 aa  63.5  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3110  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.46 
 
 
94 aa  63.5  0.0000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.976554  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3208  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.98 
 
 
98 aa  62.8  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1672  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.67 
 
 
86 aa  61.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.968118 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2159  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.51 
 
 
96 aa  61.6  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0703588  normal  0.109109 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3170  hydrogenase 2 accessory protein HypG  41.33 
 
 
82 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1168  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.96 
 
 
77 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.996311  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50460  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  44 
 
 
84 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0945297  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02866  hydrogenase 2 accessory protein  41.33 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0706  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.33 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3276  hydrogenase 2 accessory protein HypG  41.33 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1418  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  44 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3417  hydrogenase 2 accessory protein HypG  41.33 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4302  hydrogenase 2 accessory protein HypG  41.33 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.322153  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02815  hypothetical protein  41.33 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2526  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  48 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.234436  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3458  hydrogenase 2 accessory protein HypG  41.33 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0703  hydrogenase 2 accessory protein HypG  41.33 
 
 
82 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0727  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  38.1 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.267852  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0508  hydrogenase expression/formation protein HypC  39.24 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2042  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.27 
 
 
79 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0653  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  38.1 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3325  hydrogenase 2 accessory protein HypG  41.33 
 
 
82 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.834406  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3390  hydrogenase 2 accessory protein HypG  43.42 
 
 
82 aa  57.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.50292 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3316  hydrogenase 2 accessory protein HypG  43.42 
 
 
82 aa  57.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000211231  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1045  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  38.1 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.247317  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3681  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.8 
 
 
79 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3491  hydrogenase 2 accessory protein HypG  42.11 
 
 
82 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3396  hydrogenase 2 accessory protein HypG  42.11 
 
 
82 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.887296  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3231  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  44.74 
 
 
94 aa  57  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4558  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.46 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0872  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  37.8 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.644778  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2178  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.02 
 
 
80 aa  56.2  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.339954 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0790  hydrogenase assembly chaperone HypC  34.94 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.475375  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1429  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  37.5 
 
 
96 aa  55.1  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.149613  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0641  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.19 
 
 
85 aa  55.5  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.858421  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0307  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  42.25 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.214881  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0575  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.75 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.306359  normal  0.178324 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1091  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  33.33 
 
 
75 aa  54.3  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0263  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.19 
 
 
88 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1343  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.19 
 
 
88 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3760  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.19 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1706  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.33 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.296554 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2813  putative hypC  40.96 
 
 
81 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1882  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.75 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3363  hypothetical protein  35.44 
 
 
96 aa  52.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.16041 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2412  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.75 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0703435  hitchhiker  0.0000250564 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1907  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.75 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0933507  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3445  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.79 
 
 
83 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.526541  normal  0.465123 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1914  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  43.75 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.384554  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0050  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.86 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0199  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1664  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.91 
 
 
78 aa  52  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.473831  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1961  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.46 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1835  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.27 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1901  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  38.24 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000307704 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2026  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.1 
 
 
82 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0932  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  41.27 
 
 
92 aa  52  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.305278  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2742  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.89 
 
 
82 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1951  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.5 
 
 
76 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1283  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  40 
 
 
75 aa  51.2  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.409533 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2016  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.19 
 
 
75 aa  51.6  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1162  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.9 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.181199  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3131  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.11 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2008  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.25 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2162  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.68 
 
 
81 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2490  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.88 
 
 
87 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.228537 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3924  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.84 
 
 
88 aa  50.4  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.377852  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1131  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.72 
 
 
76 aa  50.4  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4098  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.98 
 
 
72 aa  50.1  0.000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0478  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.67 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213434  normal  0.190427 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2092  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.68 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1538  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  40.32 
 
 
62 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000241221  normal  0.093017 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1870  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.68 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1644  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.75 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2447  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.84 
 
 
87 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0458574 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1600  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.13 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>