156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2137 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2137  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  100 
 
 
86 aa  171  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613834  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2183  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  100 
 
 
86 aa  171  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.195467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2124  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  98.84 
 
 
86 aa  168  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.181961  normal  0.0268244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2408  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  90.91 
 
 
84 aa  139  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.349074 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3822  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  49.35 
 
 
92 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.564526  normal  0.0529395 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2618  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  48.1 
 
 
89 aa  72.8  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.368424 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08050  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  46.75 
 
 
90 aa  67  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2536  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  48.05 
 
 
92 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2486  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  48.05 
 
 
90 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0536  hydrogenase expression/formation protein, HupF/HypC  40 
 
 
100 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3235  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.71 
 
 
90 aa  61.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4603  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  40.79 
 
 
86 aa  60.1  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3231  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.79 
 
 
94 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0470  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.33 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.503239  normal  0.167546 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1429  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  37.68 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.149613  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0794  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.16 
 
 
82 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.481869  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2437  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.24 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3752  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.8 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4589  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  41.38 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3876  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.16 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1287  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.54 
 
 
88 aa  54.3  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.917168  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2706  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  40.26 
 
 
91 aa  54.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1600  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  33.33 
 
 
78 aa  53.5  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1071  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.33 
 
 
93 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61575  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3797  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.16 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.777616 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1946  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1901  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  42.19 
 
 
79 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000307704 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1456  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  35.16 
 
 
90 aa  50.8  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1091  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.92 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50460  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  33.33 
 
 
84 aa  50.8  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0945297  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0973  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.07 
 
 
89 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82669  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4558  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.96 
 
 
90 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3110  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.8 
 
 
94 aa  50.4  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.976554  normal 
 
 
-
 
NC_008036  Sala_3208  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.08 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3402  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.33 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0683  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.24 
 
 
74 aa  49.7  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0478  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  32 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213434  normal  0.190427 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1131  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.27 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3396  hydrogenase 2 accessory protein HypG  39.47 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.887296  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3316  hydrogenase 2 accessory protein HypG  39.47 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000211231  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2042  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.5 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3491  hydrogenase 2 accessory protein HypG  39.47 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1758  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  32.94 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3390  hydrogenase 2 accessory protein HypG  39.47 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.50292 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2185  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.37 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.448638  normal  0.262576 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3325  hydrogenase 2 accessory protein HypG  39.74 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.834406  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3131  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.27 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1664  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.33 
 
 
78 aa  48.9  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.473831  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2178  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.92 
 
 
80 aa  48.5  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.339954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1815  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.47 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2162  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.47 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1162  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.67 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.181199  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2092  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.47 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1870  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  42.47 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2406  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  29.33 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.232176 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1672  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.06 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.968118 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0861  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.23 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.339436  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3980  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  28 
 
 
105 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.943187  normal  0.61085 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0713  hydrogenase assembly chaperone HypC  35.23 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.487958  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0326  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  36.71 
 
 
75 aa  47.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00530973  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3170  hydrogenase 2 accessory protein HypG  38.16 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02866  hydrogenase 2 accessory protein  38.16 
 
 
82 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0706  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.16 
 
 
82 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02815  hypothetical protein  38.16 
 
 
82 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4302  hydrogenase 2 accessory protein HypG  38.16 
 
 
82 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.322153  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3458  hydrogenase 2 accessory protein HypG  38.16 
 
 
82 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0703  hydrogenase 2 accessory protein HypG  38.16 
 
 
82 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1097  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  33.33 
 
 
89 aa  47.4  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3276  hydrogenase 2 accessory protein HypG  38.16 
 
 
82 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3417  hydrogenase 2 accessory protein HypG  38.16 
 
 
82 aa  47.4  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0790  hydrogenase assembly chaperone HypC  35.29 
 
 
93 aa  47  0.00008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.475375  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3681  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  31.17 
 
 
79 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0141  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.21 
 
 
85 aa  47  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0727  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  37.5 
 
 
93 aa  47  0.00009  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.267852  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0653  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  37.5 
 
 
93 aa  47  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2026  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.68 
 
 
82 aa  47  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1418  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.24 
 
 
95 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0641  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  30.56 
 
 
85 aa  46.2  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.858421  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03900  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  27.27 
 
 
71 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3445  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.68 
 
 
83 aa  46.2  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.526541  normal  0.465123 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2140  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  37.66 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.930293  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2135  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  29.33 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.402409  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2016  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  34.62 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0723  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  30.95 
 
 
91 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0558163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2181  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  29.33 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.283402 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1882  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.71 
 
 
81 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2122  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  29.33 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.717614  normal  0.0140851 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1835  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  38.24 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1907  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.71 
 
 
81 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0933507  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1045  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  37.5 
 
 
93 aa  46.2  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.247317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1914  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.71 
 
 
81 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.384554  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2412  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  39.71 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0703435  hitchhiker  0.0000250564 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2594  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  31.03 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1272  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.82 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.444775  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1892  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  35.94 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3967  hydrogenase expression/formation protein (HUPF/HYPC)  32.89 
 
 
81 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1706  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  27.16 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.296554 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2110  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  35.29 
 
 
80 aa  45.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.305152  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0932  hydrogenase assembly chaperone HypC/HupF  34.21 
 
 
92 aa  44.7  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.305278  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2779  hydrogenase assembly chaperone hypC/hupF  31.76 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>