190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0757 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0757  hypothetical protein  100 
 
 		 57 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154426  normal  0.127771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1388  hypothetical protein  77.19 
 
 		 57 aa  95.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341245 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4062  protein of unknown function DUF343  72.73 
 
 		 58 aa  78.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167292  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2509  hypothetical protein  63.64 
 
 		 58 aa  70.1  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3759  protein of unknown function DUF343  60 
 
 		 58 aa  67.4  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.075008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7603  protein of unknown function DUF343  58.18 
 
 		 57 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0741  hypothetical protein  55.56 
 
 		 68 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0283  hypothetical protein  58.49 
 
 		 60 aa  60.1  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3093  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  59.3  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2274  hypothetical protein  55.56 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00194763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1082  tetraacyldisaccharide-1-P 4-kinase  55.56 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00991384  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0570  hypothetical protein  55.56 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1047  hypothetical protein  55.56 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000350171  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0926  hypothetical protein  55.56 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0134205  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0929  hypothetical protein  55.56 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2152  hypothetical protein  55.56 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0445417  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0750  hypothetical protein  57.41 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112207  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1426  hypothetical protein  57.14 
 
 		 56 aa  58.2  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.425865  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2594  hypothetical protein  55.56 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129771  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2464  hypothetical protein  55.56 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142603 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3844  hypothetical protein  56.6 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4174  hypothetical protein  54.72 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.172558  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5877  hypothetical protein  55.56 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140063  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3197  protein of unknown function DUF343  55.56 
 
 		 67 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.333049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0765  hypothetical protein  55.56 
 
 		 67 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0537  hypothetical protein  55.56 
 
 		 67 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0311  protein of unknown function DUF343  56.6 
 
 		 59 aa  57  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2088  hypothetical protein  51.85 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000436005  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0650  protein of unknown function DUF343  52.73 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1934  hypothetical protein  53.7 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2546  hypothetical protein  53.7 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0641671  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0466  hypothetical protein  47.54 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0490  hypothetical protein  52.73 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.768534  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2570  hypothetical protein  53.7 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522503  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0595  protein of unknown function DUF343  54.72 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1027  hypothetical protein  53.7 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00107826  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3635  hypothetical protein  49.09 
 
 		 57 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.566085  normal  0.472948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3227  hypothetical protein  53.57 
 
 		 56 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1506  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  54.72 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225187  normal  0.166181 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0910  hypothetical protein  51.85 
 
 		 59 aa  54.3  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3207  hypothetical protein  51.85 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232767  normal  0.26354 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2125  hypothetical protein  53.7 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1901  hypothetical protein  52.83 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000321593 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0592  hypothetical protein  50.91 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000872604  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3220  protein of unknown function DUF343  46.3 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1477  hypothetical protein  52.83 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2939  hypothetical protein  53.7 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1512  hypothetical protein  52.83 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1615  hypothetical protein  52.83 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.822901  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3813  hypothetical protein  52.83 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0446374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0534  hypothetical protein  51.85 
 
 		 69 aa  53.5  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  hitchhiker  0.00000763093 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2647  protein of unknown function DUF343  44.44 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0718  protein of unknown function DUF343  50 
 
 		 67 aa  53.5  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.021704  normal  0.638292 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0131  hypothetical protein  46.3 
 
 		 56 aa  52.8  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0194  hypothetical protein  46.3 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14770  hypothetical protein  52.83 
 
 		 61 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3214  protein of unknown function DUF343  52.83 
 
 		 63 aa  52.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0634  hypothetical protein  51.85 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.797017  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2531  hypothetical protein  49.09 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0793629 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2402  protein of unknown function DUF343  49.09 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3709  hypothetical protein  47.17 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1310  hypothetical protein  49.09 
 
 		 70 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404019  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5857  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.768237  normal  0.140959 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2808  protein of unknown function DUF343  49.09 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2153  hypothetical protein  52.83 
 
 		 65 aa  52.8  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.286356  normal  0.313374 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2677  hypothetical protein  50 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4097  protein of unknown function DUF343  47.27 
 
 		 62 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2181  hypothetical protein  52.83 
 
 		 61 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3773  protein of unknown function DUF343  49.09 
 
 		 62 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540183  normal  0.541189 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2346  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2212  hypothetical protein  48.15 
 
 		 140 aa  51.2  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106103  normal  0.265266 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25520  hypothetical protein  52.83 
 
 		 61 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3665  hypothetical protein  46.3 
 
 		 61 aa  51.2  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3156  hypothetical protein  49.06 
 
 		 60 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.733102  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4893  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  54.72 
 
 		 430 aa  51.2  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0959  hypothetical protein  49.06 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2304  hypothetical protein  48.08 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2486  hypothetical protein  47.17 
 
 		 65 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0551102  normal  0.879206 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3047  hypothetical protein  45.45 
 
 		 62 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1855  protein of unknown function DUF343  43.1 
 
 		 63 aa  50.8  0.000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.176655  hitchhiker  0.00737468 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2257  hypothetical protein  44.64 
 
 		 58 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523879  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1374  protein of unknown function DUF343  51.85 
 
 		 64 aa  50.4  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.379618  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0899  hypothetical protein  51.79 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0245559 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1297  acetoacetyl-CoA reductase  49.06 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199005  decreased coverage  0.00515811 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2369  hypothetical protein  43.4 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.77429 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2252  protein of unknown function DUF343  49.06 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.938306 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09130  hypothetical protein  47.46 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0300  hypothetical protein  46.3 
 
 		 65 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222502 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1726  protein of unknown function DUF343  49.06 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0316795  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2043  protein of unknown function DUF343  48.15 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3569  hypothetical protein  52.83 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0331586  hitchhiker  0.00582787 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0266  hypothetical protein  48.15 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.127662  normal  0.479749 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0454  hypothetical protein  46.3 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0661253  normal  0.0911594 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1718  hypothetical protein  47.17 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31010  hypothetical protein  54.24 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.424305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1771  hypothetical protein  48.15 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0270  protein of unknown function DUF343  48.15 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1262  hypothetical protein  47.27 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4167  protein of unknown function DUF343  50 
 
 		 78 aa  48.9  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.182728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0815  protein of unknown function DUF343  42.59 
 
 		 58 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>