166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2257 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2257  hypothetical protein  100 
 
 		 58 aa  117  7e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3227  hypothetical protein  64.29 
 
 		 56 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2346  hypothetical protein  63.16 
 
 		 62 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2647  protein of unknown function DUF343  55.77 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3093  hypothetical protein  53.85 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1262  hypothetical protein  52.63 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0490  hypothetical protein  44.83 
 
 		 60 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.768534  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0650  protein of unknown function DUF343  44.83 
 
 		 60 aa  63.5  0.0000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3635  hypothetical protein  47.17 
 
 		 57 aa  62.8  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.566085  normal  0.472948 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0718  protein of unknown function DUF343  45.61 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.021704  normal  0.638292 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1914  hypothetical protein  48.08 
 
 		 58 aa  63.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.354879  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1506  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  51.85 
 
 		 62 aa  60.8  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225187  normal  0.166181 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3220  protein of unknown function DUF343  51.92 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2694  protein of unknown function DUF343  59.62 
 
 		 56 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2575  hypothetical protein  53.45 
 
 		 70 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.745341  normal  0.0666419 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2789  protein of unknown function DUF343  57.69 
 
 		 56 aa  58.2  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2608  hypothetical protein  57.69 
 
 		 56 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0375272  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0910  hypothetical protein  47.17 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2088  hypothetical protein  45.28 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000436005  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2304  hypothetical protein  52 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0752  hypothetical protein  58.93 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3207  hypothetical protein  45.28 
 
 		 58 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232767  normal  0.26354 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2677  hypothetical protein  47.06 
 
 		 59 aa  53.5  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5857  hypothetical protein  53.57 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.768237  normal  0.140959 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0283  hypothetical protein  44 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14770  hypothetical protein  50.98 
 
 		 61 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0311  protein of unknown function DUF343  44 
 
 		 59 aa  52  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0926  hypothetical protein  46.15 
 
 		 68 aa  50.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0134205  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4062  protein of unknown function DUF343  49.06 
 
 		 58 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167292  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2274  hypothetical protein  46.15 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00194763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1082  tetraacyldisaccharide-1-P 4-kinase  46.15 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00991384  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0570  hypothetical protein  46.15 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1047  hypothetical protein  46.15 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000350171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0929  hypothetical protein  46.15 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2152  hypothetical protein  46.15 
 
 		 68 aa  50.8  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0445417  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0741  hypothetical protein  46.15 
 
 		 68 aa  50.8  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3029  hypothetical protein  46.15 
 
 		 58 aa  50.4  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0757  hypothetical protein  44.64 
 
 		 57 aa  50.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154426  normal  0.127771 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0634  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  50.1  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.797017  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1426  hypothetical protein  51.02 
 
 		 56 aa  50.4  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.425865  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3214  protein of unknown function DUF343  52.17 
 
 		 63 aa  50.1  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0592  hypothetical protein  47.92 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000872604  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3759  protein of unknown function DUF343  46 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.075008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0750  hypothetical protein  46.15 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112207  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0534  hypothetical protein  47.92 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  hitchhiker  0.00000763093 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2824  hypothetical protein  40.74 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0741259 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1772  hypothetical protein  38.6 
 
 		 57 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5877  hypothetical protein  44.23 
 
 		 64 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140063  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0537  hypothetical protein  47.92 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0765  hypothetical protein  47.92 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3197  protein of unknown function DUF343  47.92 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.333049 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2594  hypothetical protein  44.23 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129771  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2464  hypothetical protein  44.23 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142603 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2808  protein of unknown function DUF343  45.83 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4499  protein of unknown function DUF343  47.83 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2402  protein of unknown function DUF343  45.83 
 
 		 62 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213254  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2531  hypothetical protein  45.83 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0793629 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1895  hypothetical protein  52 
 
 		 59 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1884  hypothetical protein  52 
 
 		 59 aa  48.1  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1934  hypothetical protein  42.31 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2546  hypothetical protein  42.31 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0641671  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2570  hypothetical protein  42.31 
 
 		 64 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522503  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0815  protein of unknown function DUF343  44.23 
 
 		 58 aa  48.5  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232843  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2127  hypothetical protein  41.07 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0473913  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7603  protein of unknown function DUF343  48 
 
 		 57 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0194  hypothetical protein  38.78 
 
 		 59 aa  47.4  0.00006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4243  hypothetical protein  40.38 
 
 		 62 aa  47.8  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1310  hypothetical protein  40.35 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404019  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1388  hypothetical protein  44.64 
 
 		 57 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341245 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3844  hypothetical protein  41.51 
 
 		 61 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0131  hypothetical protein  36.73 
 
 		 56 aa  46.2  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1027  hypothetical protein  46 
 
 		 61 aa  47  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00107826  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4297  protein of unknown function DUF343  49.12 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.925532  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1821  hypothetical protein  39.62 
 
 		 58 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.135378  normal  0.937182 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2206  protein of unknown function DUF343  46 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2043  protein of unknown function DUF343  44 
 
 		 60 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2509  hypothetical protein  42.86 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4174  hypothetical protein  39.62 
 
 		 61 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.172558  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1771  hypothetical protein  44 
 
 		 60 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1618  Methyltransferase type 11  45.45 
 
 		 299 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3047  hypothetical protein  40 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2420  hypothetical protein  38.46 
 
 		 59 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2490  hypothetical protein  38.46 
 
 		 59 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0932206  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1101  hypothetical protein  42.86 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2582  hypothetical protein  38.46 
 
 		 59 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.125481 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1922  hypothetical protein  38.18 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.504408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2486  hypothetical protein  44 
 
 		 65 aa  45.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0551102  normal  0.879206 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1436  hypothetical protein  42 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0300  hypothetical protein  39.22 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222502 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3773  protein of unknown function DUF343  38.46 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540183  normal  0.541189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4097  protein of unknown function DUF343  38.46 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1718  hypothetical protein  47.83 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0899  hypothetical protein  49.06 
 
 		 61 aa  45.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0245559 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1374  protein of unknown function DUF343  41.18 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.379618  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1588  hypothetical protein  39.62 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.412057  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1085  hypothetical protein  45.65 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.1669  normal  0.234765 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0902  hypothetical protein  38.89 
 
 		 59 aa  44.7  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0351065  normal  0.893106 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0993  hypothetical protein  45.65 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.638813  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1052  hypothetical protein  45.65 
 
 		 60 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.202264 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3813  hypothetical protein  38.18 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0446374  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>