202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3227 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3227  hypothetical protein  100 
 
 		 56 aa  110  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2346  hypothetical protein  69.64 
 
 		 62 aa  84  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2257  hypothetical protein  64.29 
 
 		 58 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523879  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3635  hypothetical protein  62.26 
 
 		 57 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.566085  normal  0.472948 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3220  protein of unknown function DUF343  62.5 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0718  protein of unknown function DUF343  55.77 
 
 		 67 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.021704  normal  0.638292 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1262  hypothetical protein  58.49 
 
 		 65 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1914  hypothetical protein  53.85 
 
 		 58 aa  67  0.00000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.354879  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2304  hypothetical protein  59.62 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2789  protein of unknown function DUF343  65.38 
 
 		 56 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2608  hypothetical protein  65.38 
 
 		 56 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0375272  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2694  protein of unknown function DUF343  63.46 
 
 		 56 aa  63.2  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0650  protein of unknown function DUF343  52.83 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3093  hypothetical protein  53.85 
 
 		 70 aa  62.8  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0490  hypothetical protein  52.83 
 
 		 60 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.768534  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3029  hypothetical protein  53.85 
 
 		 58 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2647  protein of unknown function DUF343  51.92 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2088  hypothetical protein  50.94 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000436005  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14770  hypothetical protein  53.7 
 
 		 61 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2575  hypothetical protein  53.57 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.745341  normal  0.0666419 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0283  hypothetical protein  50 
 
 		 60 aa  58.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1506  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  48.15 
 
 		 62 aa  58.2  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225187  normal  0.166181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4174  hypothetical protein  54.72 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.172558  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3207  hypothetical protein  52.83 
 
 		 58 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232767  normal  0.26354 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0311  protein of unknown function DUF343  50 
 
 		 59 aa  57.8  0.00000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3844  hypothetical protein  52.83 
 
 		 61 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0815  protein of unknown function DUF343  55.77 
 
 		 58 aa  57.4  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232843  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2677  hypothetical protein  50.94 
 
 		 59 aa  57  0.00000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0741  hypothetical protein  53.85 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3214  protein of unknown function DUF343  51.85 
 
 		 63 aa  55.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1772  hypothetical protein  44.64 
 
 		 57 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2808  protein of unknown function DUF343  51.92 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2402  protein of unknown function DUF343  51.92 
 
 		 62 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213254  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1901  hypothetical protein  52.83 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000321593 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2531  hypothetical protein  51.92 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0793629 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2274  hypothetical protein  53.85 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00194763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1082  tetraacyldisaccharide-1-P 4-kinase  53.85 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00991384  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5877  hypothetical protein  53.85 
 
 		 64 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140063  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1512  hypothetical protein  52.83 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2594  hypothetical protein  53.85 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129771  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0570  hypothetical protein  53.85 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1047  hypothetical protein  53.85 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000350171  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2464  hypothetical protein  53.85 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142603 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3813  hypothetical protein  52.83 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0446374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0926  hypothetical protein  53.85 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0134205  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0929  hypothetical protein  53.85 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2152  hypothetical protein  53.85 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0445417  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1477  hypothetical protein  52.83 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0757  hypothetical protein  53.57 
 
 		 57 aa  55.5  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154426  normal  0.127771 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2509  hypothetical protein  50.94 
 
 		 58 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0537  hypothetical protein  53.85 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3197  protein of unknown function DUF343  53.85 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.333049 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0194  hypothetical protein  45.28 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0765  hypothetical protein  53.85 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0534  hypothetical protein  51.92 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  hitchhiker  0.00000763093 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1310  hypothetical protein  49.09 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404019  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3759  protein of unknown function DUF343  54 
 
 		 58 aa  55.1  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.075008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0910  hypothetical protein  49.06 
 
 		 59 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0750  hypothetical protein  51.92 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112207  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0592  hypothetical protein  51.92 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000872604  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2570  hypothetical protein  51.92 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522503  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1934  hypothetical protein  51.92 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2546  hypothetical protein  51.92 
 
 		 64 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0641671  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1027  hypothetical protein  50.94 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00107826  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1374  protein of unknown function DUF343  50.94 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.379618  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2824  hypothetical protein  44.44 
 
 		 60 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0741259 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1615  hypothetical protein  54 
 
 		 61 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.822901  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0300  hypothetical protein  45.45 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222502 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0131  hypothetical protein  43.4 
 
 		 56 aa  53.5  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1821  hypothetical protein  46.3 
 
 		 58 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.135378  normal  0.937182 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2420  hypothetical protein  48.08 
 
 		 59 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2490  hypothetical protein  48.08 
 
 		 59 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0932206  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2582  hypothetical protein  48.08 
 
 		 59 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.125481 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1426  hypothetical protein  50 
 
 		 56 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.425865  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4243  hypothetical protein  48 
 
 		 62 aa  52.8  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3773  protein of unknown function DUF343  50 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540183  normal  0.541189 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3239  hypothetical protein  48.21 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.641232  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4499  protein of unknown function DUF343  53.57 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4097  protein of unknown function DUF343  50 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01858  hypothetical protein  46.43 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126062  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1559  hypothetical protein  45.45 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.730399  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1707  hypothetical protein  46.15 
 
 		 59 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.502492  normal  0.508919 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2800  hypothetical protein  48.08 
 
 		 59 aa  51.6  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0266  hypothetical protein  45.45 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.127662  normal  0.479749 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2672  protein of unknown function DUF343  46.15 
 
 		 59 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0296171  normal  0.0260721 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25520  hypothetical protein  50 
 
 		 61 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2043  protein of unknown function DUF343  42.59 
 
 		 60 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1685  hypothetical protein  46.15 
 
 		 59 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1771  hypothetical protein  42.59 
 
 		 60 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4062  protein of unknown function DUF343  52.83 
 
 		 58 aa  51.6  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167292  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2181  hypothetical protein  50 
 
 		 61 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01537  hypothetical protein  44.44 
 
 		 59 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0294  hypothetical protein  43.64 
 
 		 65 aa  50.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0307109 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2572  hypothetical protein  40.74 
 
 		 60 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0454  hypothetical protein  43.64 
 
 		 65 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0661253  normal  0.0911594 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2661  hypothetical protein  40.74 
 
 		 60 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.654159  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1739  hypothetical protein  48.15 
 
 		 62 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3047  hypothetical protein  46 
 
 		 62 aa  50.8  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1964  hypothetical protein  40.74 
 
 		 60 aa  51.2  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1436  hypothetical protein  44.44 
 
 		 60 aa  51.2  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>