193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4062 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4062  protein of unknown function DUF343  100 
 
 
58 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167292  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1388  hypothetical protein  70.91 
 
 
57 aa  80.9  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0757  hypothetical protein  72.73 
 
 
57 aa  78.6  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154426  normal  0.127771 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3759  protein of unknown function DUF343  66.04 
 
 
58 aa  70.5  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.075008  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2509  hypothetical protein  66.04 
 
 
58 aa  70.5  0.000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1426  hypothetical protein  60.71 
 
 
56 aa  62  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.425865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7603  protein of unknown function DUF343  59.62 
 
 
57 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0283  hypothetical protein  51.79 
 
 
60 aa  61.6  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0750  hypothetical protein  57.69 
 
 
64 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112207  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0741  hypothetical protein  56.6 
 
 
68 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3635  hypothetical protein  50 
 
 
57 aa  60.1  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.566085  normal  0.472948 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2274  hypothetical protein  56.6 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00194763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1082  tetraacyldisaccharide-1-P 4-kinase  56.6 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00991384  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5877  hypothetical protein  54.72 
 
 
64 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140063  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0311  protein of unknown function DUF343  51.79 
 
 
59 aa  59.7  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0765  hypothetical protein  55.77 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3197  protein of unknown function DUF343  55.77 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.333049 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2464  hypothetical protein  55.77 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142603 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2594  hypothetical protein  55.77 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129771  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0910  hypothetical protein  57.69 
 
 
59 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0537  hypothetical protein  55.77 
 
 
67 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199917  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0570  hypothetical protein  56.6 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1047  hypothetical protein  56.6 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000350171  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0926  hypothetical protein  56.6 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0134205  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0929  hypothetical protein  56.6 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2152  hypothetical protein  56.6 
 
 
68 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0445417  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0650  protein of unknown function DUF343  51.85 
 
 
60 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3844  hypothetical protein  56.6 
 
 
61 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0490  hypothetical protein  51.85 
 
 
60 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.768534  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2570  hypothetical protein  53.85 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522503  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1934  hypothetical protein  53.85 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2546  hypothetical protein  53.85 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0641671  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1615  hypothetical protein  53.57 
 
 
61 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.822901  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4174  hypothetical protein  54.72 
 
 
61 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.172558  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3207  hypothetical protein  50 
 
 
58 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232767  normal  0.26354 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0534  hypothetical protein  52.83 
 
 
69 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  hitchhiker  0.00000763093 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0592  hypothetical protein  52.83 
 
 
67 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000872604  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2307  protein of unknown function DUF343  56.6 
 
 
60 aa  57.4  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.858072  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1506  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  54.72 
 
 
62 aa  57.4  0.00000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225187  normal  0.166181 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0466  hypothetical protein  54.1 
 
 
77 aa  57.4  0.00000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0488  protein of unknown function DUF343  48.08 
 
 
61 aa  57  0.00000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2531  hypothetical protein  51.92 
 
 
62 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0793629 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2402  protein of unknown function DUF343  51.92 
 
 
62 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213254  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2808  protein of unknown function DUF343  51.92 
 
 
62 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106746  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1901  hypothetical protein  52.83 
 
 
61 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000321593 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0595  protein of unknown function DUF343  50.91 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2939  hypothetical protein  55.77 
 
 
63 aa  56.2  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1512  hypothetical protein  52.83 
 
 
61 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1477  hypothetical protein  52.83 
 
 
61 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165354  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3220  protein of unknown function DUF343  50.94 
 
 
65 aa  55.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14770  hypothetical protein  52.83 
 
 
61 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2125  hypothetical protein  51.92 
 
 
61 aa  55.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3813  hypothetical protein  52.83 
 
 
61 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0446374  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2677  hypothetical protein  49.06 
 
 
59 aa  55.1  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1262  hypothetical protein  50 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4297  protein of unknown function DUF343  58.18 
 
 
73 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.925532  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0899  hypothetical protein  58.18 
 
 
61 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0245559 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2088  hypothetical protein  49.06 
 
 
60 aa  54.7  0.0000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000436005  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1718  hypothetical protein  52.73 
 
 
60 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0718  protein of unknown function DUF343  47.37 
 
 
67 aa  54.3  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.021704  normal  0.638292 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2043  protein of unknown function DUF343  53.85 
 
 
60 aa  53.5  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1771  hypothetical protein  53.85 
 
 
60 aa  53.5  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2127  hypothetical protein  50 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0473913  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0902  hypothetical protein  51.79 
 
 
59 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0351065  normal  0.893106 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2304  hypothetical protein  54.9 
 
 
87 aa  52.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0634  hypothetical protein  50.91 
 
 
70 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.797017  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2800  hypothetical protein  49.06 
 
 
59 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1052  hypothetical protein  46.43 
 
 
60 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.202264 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2572  hypothetical protein  52.73 
 
 
60 aa  52  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2346  hypothetical protein  54.72 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3093  hypothetical protein  45.28 
 
 
70 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0959  hypothetical protein  47.17 
 
 
67 aa  52.4  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0993  hypothetical protein  46.43 
 
 
60 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.638813  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2661  hypothetical protein  52.73 
 
 
60 aa  52  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.654159  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1020  hypothetical protein  46.43 
 
 
60 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.678169 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2206  protein of unknown function DUF343  50.94 
 
 
60 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25520  hypothetical protein  50.94 
 
 
61 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1739  hypothetical protein  44.64 
 
 
62 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1964  hypothetical protein  52.73 
 
 
60 aa  52  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1085  hypothetical protein  46.43 
 
 
60 aa  52  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.1669  normal  0.234765 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3665  hypothetical protein  50 
 
 
61 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1101  hypothetical protein  46.43 
 
 
60 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2181  hypothetical protein  50.94 
 
 
61 aa  52  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003985  protein ycaR  49.09 
 
 
59 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1772  hypothetical protein  44.44 
 
 
57 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1297  acetoacetyl-CoA reductase  50 
 
 
63 aa  52  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199005  decreased coverage  0.00515811 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2647  protein of unknown function DUF343  49.06 
 
 
66 aa  52  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2486  hypothetical protein  46.15 
 
 
65 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0551102  normal  0.879206 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1559  hypothetical protein  47.17 
 
 
59 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.730399  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2252  protein of unknown function DUF343  48.08 
 
 
63 aa  51.2  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.938306 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0256  hypothetical protein  52.83 
 
 
54 aa  51.6  0.000004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0280343  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3270  hypothetical protein  48.08 
 
 
71 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.731056  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2420  hypothetical protein  47.17 
 
 
59 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2490  hypothetical protein  47.17 
 
 
59 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0932206  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2582  hypothetical protein  47.17 
 
 
59 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.125481 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1310  hypothetical protein  43.64 
 
 
70 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404019  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5857  hypothetical protein  54.39 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.768237  normal  0.140959 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3227  hypothetical protein  52.83 
 
 
56 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01537  hypothetical protein  49.09 
 
 
59 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2257  hypothetical protein  49.06 
 
 
58 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>