196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2252 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2252  protein of unknown function DUF343  100 
 
 		 63 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.938306 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2125  hypothetical protein  83.93 
 
 		 61 aa  96.3  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2939  hypothetical protein  67.74 
 
 		 63 aa  87.4  5e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1310  hypothetical protein  69.84 
 
 		 70 aa  85.1  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404019  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1374  protein of unknown function DUF343  73.58 
 
 		 64 aa  83.6  9e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.379618  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2306  hypothetical protein  71.7 
 
 		 60 aa  83.6  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190908  normal  0.12744 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4893  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  72.22 
 
 		 430 aa  83.6  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1553  protein of unknown function DUF343  71.7 
 
 		 60 aa  83.6  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331555  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2212  hypothetical protein  72.22 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106103  normal  0.265266 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2563  hypothetical protein  69.81 
 
 		 60 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0238405  hitchhiker  0.00461164 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0595  protein of unknown function DUF343  73.58 
 
 		 64 aa  81.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3286  hypothetical protein  66.1 
 
 		 64 aa  80.5  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0033  protein of unknown function DUF343  64.91 
 
 		 63 aa  79.7  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0508144  hitchhiker  0.000474909 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0837  hypothetical protein  71.7 
 
 		 68 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00693289 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2181  hypothetical protein  63.64 
 
 		 61 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1863  protein of unknown function DUF343  64.18 
 
 		 69 aa  79  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945421 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4588  hypothetical protein  72.55 
 
 		 66 aa  78.6  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.658837 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2950  hypothetical protein  66.04 
 
 		 60 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25520  hypothetical protein  63.64 
 
 		 61 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1922  hypothetical protein  67.92 
 
 		 60 aa  78.2  0.00000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.504408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0300  hypothetical protein  72.55 
 
 		 65 aa  78.6  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222502 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0487  hypothetical protein  71.7 
 
 		 66 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  hitchhiker  0.000621039 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3270  hypothetical protein  64.81 
 
 		 71 aa  78.2  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.731056  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1613  protein of unknown function DUF343  71.7 
 
 		 66 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2210  protein of unknown function DUF343  71.7 
 
 		 68 aa  77.4  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.451812  normal  0.154545 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3665  hypothetical protein  67.92 
 
 		 61 aa  77.4  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2528  protein of unknown function DUF343  71.7 
 
 		 68 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2731  hypothetical protein  70.37 
 
 		 85 aa  76.6  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.923353  normal  0.0512047 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2253  hypothetical protein  71.7 
 
 		 68 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.160718 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0454  hypothetical protein  62.5 
 
 		 65 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0661253  normal  0.0911594 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0056  hypothetical protein  62.9 
 
 		 61 aa  76.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.825759 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3569  hypothetical protein  64.81 
 
 		 60 aa  76.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0331586  hitchhiker  0.00582787 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4097  protein of unknown function DUF343  66.67 
 
 		 62 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3773  protein of unknown function DUF343  66.67 
 
 		 62 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540183  normal  0.541189 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0194  hypothetical protein  62.96 
 
 		 59 aa  75.5  0.0000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3156  hypothetical protein  66.04 
 
 		 60 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.733102  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0835  hypothetical protein  67.92 
 
 		 64 aa  75.5  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.137665  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0891  hypothetical protein  67.92 
 
 		 64 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.883095  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1726  protein of unknown function DUF343  66.67 
 
 		 72 aa  75.5  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0316795  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0294  hypothetical protein  64.41 
 
 		 65 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0307109 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0266  hypothetical protein  61.54 
 
 		 66 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.127662  normal  0.479749 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0131  hypothetical protein  62.96 
 
 		 56 aa  74.7  0.0000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0075  hypothetical protein  69.81 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0959  hypothetical protein  66.04 
 
 		 67 aa  73.9  0.0000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2369  hypothetical protein  60.66 
 
 		 63 aa  73.6  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.77429 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2896  hypothetical protein  63.93 
 
 		 59 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0949765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3047  hypothetical protein  60.71 
 
 		 62 aa  73.6  0.0000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0424  hypothetical protein  59.02 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0083  hypothetical protein  64.81 
 
 		 65 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1297  acetoacetyl-CoA reductase  64.81 
 
 		 63 aa  72.4  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199005  decreased coverage  0.00515811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0270  protein of unknown function DUF343  69.81 
 
 		 65 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0537  hypothetical protein  66.67 
 
 		 67 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5877  hypothetical protein  66.67 
 
 		 64 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140063  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0765  hypothetical protein  66.67 
 
 		 67 aa  72  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3197  protein of unknown function DUF343  66.67 
 
 		 67 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.333049 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1098  hypothetical protein  61.54 
 
 		 58 aa  72  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.647732  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2594  hypothetical protein  66.67 
 
 		 67 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129771  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2464  hypothetical protein  66.67 
 
 		 67 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142603 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1491  hypothetical protein  62.07 
 
 		 59 aa  70.9  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3709  hypothetical protein  62.71 
 
 		 64 aa  70.9  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0750  hypothetical protein  64.71 
 
 		 64 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112207  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0741  hypothetical protein  66.67 
 
 		 68 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2570  hypothetical protein  64.71 
 
 		 64 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522503  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1934  hypothetical protein  64.71 
 
 		 64 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2546  hypothetical protein  64.71 
 
 		 64 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0641671  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2640  protein of unknown function DUF343  60.38 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0926  hypothetical protein  64.71 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0134205  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2274  hypothetical protein  64.71 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00194763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1082  tetraacyldisaccharide-1-P 4-kinase  64.71 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00991384  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0570  hypothetical protein  64.71 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1047  hypothetical protein  64.71 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000350171  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0141  hypothetical protein  66.04 
 
 		 59 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.282587  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0929  hypothetical protein  64.71 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2152  hypothetical protein  64.71 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0445417  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4243  hypothetical protein  57.41 
 
 		 62 aa  69.3  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1901  hypothetical protein  60.38 
 
 		 61 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000321593 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1512  hypothetical protein  60.38 
 
 		 61 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2509  hypothetical protein  57.41 
 
 		 58 aa  68.9  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0592  hypothetical protein  64.71 
 
 		 67 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000872604  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1027  hypothetical protein  61.82 
 
 		 61 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00107826  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1477  hypothetical protein  60.38 
 
 		 61 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3813  hypothetical protein  60.38 
 
 		 61 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0446374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0534  hypothetical protein  64.71 
 
 		 69 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  hitchhiker  0.00000763093 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4174  hypothetical protein  60.38 
 
 		 61 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.172558  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2088  hypothetical protein  56.6 
 
 		 60 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000436005  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2486  hypothetical protein  57.41 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0551102  normal  0.879206 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3844  hypothetical protein  56.6 
 
 		 61 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14770  hypothetical protein  54.55 
 
 		 61 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2531  hypothetical protein  60.78 
 
 		 62 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0793629 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2402  protein of unknown function DUF343  60.78 
 
 		 62 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2307  protein of unknown function DUF343  54.72 
 
 		 60 aa  66.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.858072  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1101  hypothetical protein  52.83 
 
 		 60 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2808  protein of unknown function DUF343  60.78 
 
 		 62 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1052  hypothetical protein  52.83 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.202264 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0993  hypothetical protein  52.83 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.638813  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1020  hypothetical protein  52.83 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.678169 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1085  hypothetical protein  52.83 
 
 		 60 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.1669  normal  0.234765 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1615  hypothetical protein  56.6 
 
 		 61 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.822901  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2661  hypothetical protein  47.27 
 
 		 60 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.654159  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2572  hypothetical protein  47.27 
 
 		 60 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>