192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1388 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1388  hypothetical protein  100 
 
 		 57 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0757  hypothetical protein  77.19 
 
 		 57 aa  95.1  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154426  normal  0.127771 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4062  protein of unknown function DUF343  70.91 
 
 		 58 aa  80.9  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167292  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3759  protein of unknown function DUF343  69.09 
 
 		 58 aa  77.4  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.075008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2509  hypothetical protein  65.45 
 
 		 58 aa  71.2  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7603  protein of unknown function DUF343  60 
 
 		 57 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3220  protein of unknown function DUF343  51.85 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3093  hypothetical protein  53.7 
 
 		 70 aa  57.8  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2647  protein of unknown function DUF343  53.7 
 
 		 66 aa  57  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0741  hypothetical protein  52.73 
 
 		 68 aa  57  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0750  hypothetical protein  54.55 
 
 		 64 aa  57  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112207  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1426  hypothetical protein  55.36 
 
 		 56 aa  57  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.425865  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2274  hypothetical protein  52.73 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00194763  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2464  hypothetical protein  52.73 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142603 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1082  tetraacyldisaccharide-1-P 4-kinase  52.73 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00991384  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5877  hypothetical protein  52.73 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140063  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2594  hypothetical protein  52.73 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129771  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0570  hypothetical protein  52.73 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1047  hypothetical protein  52.73 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000350171  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0926  hypothetical protein  52.73 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0134205  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0929  hypothetical protein  52.73 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2152  hypothetical protein  52.73 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0445417  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0537  hypothetical protein  52.73 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0765  hypothetical protein  52.73 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1934  hypothetical protein  50.91 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109309  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3270  hypothetical protein  56.6 
 
 		 71 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.731056  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2546  hypothetical protein  50.91 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0641671  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3197  protein of unknown function DUF343  52.73 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.333049 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2125  hypothetical protein  55.56 
 
 		 61 aa  55.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2570  hypothetical protein  50.91 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522503  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0490  hypothetical protein  52.73 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.768534  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0283  hypothetical protein  54.72 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0650  protein of unknown function DUF343  52.73 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2346  hypothetical protein  53.57 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3844  hypothetical protein  54.72 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0595  protein of unknown function DUF343  54.72 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3635  hypothetical protein  49.09 
 
 		 57 aa  54.3  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.566085  normal  0.472948 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4174  hypothetical protein  52.83 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.172558  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0899  hypothetical protein  50 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0245559 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2677  hypothetical protein  53.7 
 
 		 59 aa  53.9  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2088  hypothetical protein  53.7 
 
 		 60 aa  53.5  0.0000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000436005  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0592  hypothetical protein  50.91 
 
 		 67 aa  52.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000872604  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2212  hypothetical protein  51.85 
 
 		 140 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106103  normal  0.265266 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2531  hypothetical protein  49.09 
 
 		 62 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0793629 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0718  protein of unknown function DUF343  51.85 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.021704  normal  0.638292 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0534  hypothetical protein  49.09 
 
 		 69 aa  52  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  hitchhiker  0.00000763093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5857  hypothetical protein  54.39 
 
 		 66 aa  52  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.768237  normal  0.140959 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0311  protein of unknown function DUF343  52.83 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2939  hypothetical protein  51.85 
 
 		 63 aa  52  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0466  hypothetical protein  44.26 
 
 		 77 aa  52  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3047  hypothetical protein  47.27 
 
 		 62 aa  52  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2402  protein of unknown function DUF343  49.09 
 
 		 62 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2808  protein of unknown function DUF343  49.09 
 
 		 62 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2043  protein of unknown function DUF343  55.56 
 
 		 60 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1771  hypothetical protein  55.56 
 
 		 60 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1310  hypothetical protein  49.09 
 
 		 70 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404019  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1901  hypothetical protein  50.94 
 
 		 61 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000321593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1477  hypothetical protein  50.94 
 
 		 61 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2640  protein of unknown function DUF343  56.6 
 
 		 60 aa  50.8  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3813  hypothetical protein  50.94 
 
 		 61 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0446374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1512  hypothetical protein  50.94 
 
 		 61 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0131  hypothetical protein  46.3 
 
 		 56 aa  50.8  0.000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1506  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  57.14 
 
 		 62 aa  50.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225187  normal  0.166181 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0910  hypothetical protein  50 
 
 		 59 aa  50.4  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3156  hypothetical protein  52.83 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.733102  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1615  hypothetical protein  50.94 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.822901  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31010  hypothetical protein  54.24 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.424305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0270  protein of unknown function DUF343  48.15 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4297  protein of unknown function DUF343  49.12 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.925532  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3207  hypothetical protein  48.15 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232767  normal  0.26354 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3709  hypothetical protein  45.28 
 
 		 64 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0194  hypothetical protein  44.44 
 
 		 59 aa  49.7  0.00001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3569  hypothetical protein  56.6 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0331586  hitchhiker  0.00582787 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1718  hypothetical protein  52.83 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2563  hypothetical protein  56.6 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0238405  hitchhiker  0.00461164 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3227  hypothetical protein  48.21 
 
 		 56 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0300  hypothetical protein  50 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222502 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0634  hypothetical protein  51.85 
 
 		 70 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.797017  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14770  hypothetical protein  50.94 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0454  hypothetical protein  48.15 
 
 		 65 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0661253  normal  0.0911594 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2307  protein of unknown function DUF343  54.72 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.858072  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4167  protein of unknown function DUF343  45.9 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.182728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1262  hypothetical protein  50.91 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0294  hypothetical protein  48.15 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0307109 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2306  hypothetical protein  54.72 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190908  normal  0.12744 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1553  protein of unknown function DUF343  54.72 
 
 		 60 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331555  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3665  hypothetical protein  42.59 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2575  hypothetical protein  47.27 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.745341  normal  0.0666419 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0959  hypothetical protein  47.17 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1027  hypothetical protein  48.15 
 
 		 61 aa  48.1  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00107826  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2369  hypothetical protein  41.51 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.77429 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4893  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  52.83 
 
 		 430 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1374  protein of unknown function DUF343  50 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.379618  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0083  hypothetical protein  48.15 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3214  protein of unknown function DUF343  50.94 
 
 		 63 aa  47.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1863  protein of unknown function DUF343  46.3 
 
 		 69 aa  47.4  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945421 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1297  acetoacetyl-CoA reductase  47.17 
 
 		 63 aa  47.4  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199005  decreased coverage  0.00515811 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1964  hypothetical protein  52.83 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1726  protein of unknown function DUF343  49.06 
 
 		 72 aa  47.4  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0316795  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2661  hypothetical protein  52.83 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.654159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>