195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1310 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1310  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  139  9.999999999999999e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404019  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2212  hypothetical protein  74.19 
 
 		 140 aa  97.1  9e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106103  normal  0.265266 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2939  hypothetical protein  71.01 
 
 		 63 aa  94  7e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1553  protein of unknown function DUF343  73.21 
 
 		 60 aa  87.8  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331555  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2306  hypothetical protein  73.21 
 
 		 60 aa  87.8  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190908  normal  0.12744 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3773  protein of unknown function DUF343  72.73 
 
 		 62 aa  86.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540183  normal  0.541189 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4097  protein of unknown function DUF343  72.73 
 
 		 62 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2731  hypothetical protein  74.55 
 
 		 85 aa  86.7  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.923353  normal  0.0512047 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1863  protein of unknown function DUF343  65.22 
 
 		 69 aa  86.7  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945421 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0837  hypothetical protein  76.36 
 
 		 68 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00693289 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1922  hypothetical protein  69.64 
 
 		 60 aa  85.5  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.504408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2252  protein of unknown function DUF343  69.84 
 
 		 63 aa  85.1  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.938306 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2125  hypothetical protein  75.93 
 
 		 61 aa  84.7  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4893  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  69.64 
 
 		 430 aa  83.6  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3569  hypothetical protein  67.86 
 
 		 60 aa  83.6  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0331586  hitchhiker  0.00582787 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3047  hypothetical protein  67.86 
 
 		 62 aa  82.8  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1613  protein of unknown function DUF343  70.91 
 
 		 66 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0300  hypothetical protein  68.42 
 
 		 65 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222502 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2950  hypothetical protein  67.86 
 
 		 60 aa  82  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4243  hypothetical protein  67.27 
 
 		 62 aa  82  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0959  hypothetical protein  69.64 
 
 		 67 aa  81.6  0.000000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0194  hypothetical protein  67.27 
 
 		 59 aa  81.3  0.000000000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0487  hypothetical protein  64.52 
 
 		 66 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  hitchhiker  0.000621039 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1098  hypothetical protein  64.29 
 
 		 58 aa  81.3  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.647732  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2563  hypothetical protein  69.09 
 
 		 60 aa  81.3  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0238405  hitchhiker  0.00461164 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0454  hypothetical protein  68.97 
 
 		 65 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0661253  normal  0.0911594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2210  protein of unknown function DUF343  69.09 
 
 		 68 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.451812  normal  0.154545 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0131  hypothetical protein  66.67 
 
 		 56 aa  80.1  0.000000000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2253  hypothetical protein  69.09 
 
 		 68 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.160718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2528  protein of unknown function DUF343  69.09 
 
 		 68 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0294  hypothetical protein  68.97 
 
 		 65 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0307109 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3156  hypothetical protein  64.29 
 
 		 60 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.733102  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0595  protein of unknown function DUF343  69.64 
 
 		 64 aa  80.1  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1374  protein of unknown function DUF343  67.86 
 
 		 64 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.379618  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2896  hypothetical protein  66.67 
 
 		 59 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0949765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1491  hypothetical protein  71.15 
 
 		 59 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0266  hypothetical protein  66.67 
 
 		 66 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.127662  normal  0.479749 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0141  hypothetical protein  71.15 
 
 		 59 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.282587  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0056  hypothetical protein  67.92 
 
 		 61 aa  78.2  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.825759 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2369  hypothetical protein  71.15 
 
 		 63 aa  77.8  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.77429 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0835  hypothetical protein  64.29 
 
 		 64 aa  77.4  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.137665  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2640  protein of unknown function DUF343  62.5 
 
 		 60 aa  77.4  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4588  hypothetical protein  67.31 
 
 		 66 aa  77.4  0.00000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.658837 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0891  hypothetical protein  66.67 
 
 		 64 aa  77.4  0.00000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.883095  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3270  hypothetical protein  55.56 
 
 		 71 aa  77.4  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.731056  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3665  hypothetical protein  62.96 
 
 		 61 aa  76.6  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0075  hypothetical protein  65.52 
 
 		 66 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3709  hypothetical protein  68.52 
 
 		 64 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0083  hypothetical protein  65.52 
 
 		 65 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0033  protein of unknown function DUF343  65.45 
 
 		 63 aa  75.9  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0508144  hitchhiker  0.000474909 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0424  hypothetical protein  58.33 
 
 		 66 aa  75.9  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0270  protein of unknown function DUF343  71.7 
 
 		 65 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3286  hypothetical protein  64.81 
 
 		 64 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5877  hypothetical protein  64.71 
 
 		 64 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140063  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2464  hypothetical protein  64.71 
 
 		 67 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142603 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0741  hypothetical protein  64.71 
 
 		 68 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2088  hypothetical protein  60.71 
 
 		 60 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000436005  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2594  hypothetical protein  64.71 
 
 		 67 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129771  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2274  hypothetical protein  62.75 
 
 		 68 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00194763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1082  tetraacyldisaccharide-1-P 4-kinase  62.75 
 
 		 68 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00991384  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0750  hypothetical protein  62.75 
 
 		 64 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112207  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0765  hypothetical protein  64.71 
 
 		 67 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3197  protein of unknown function DUF343  64.71 
 
 		 67 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.333049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0537  hypothetical protein  64.71 
 
 		 67 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0570  hypothetical protein  62.75 
 
 		 68 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1047  hypothetical protein  62.75 
 
 		 68 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000350171  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0926  hypothetical protein  62.75 
 
 		 68 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0134205  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0929  hypothetical protein  62.75 
 
 		 68 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2152  hypothetical protein  62.75 
 
 		 68 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0445417  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0534  hypothetical protein  64.71 
 
 		 69 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  hitchhiker  0.00000763093 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1934  hypothetical protein  62.75 
 
 		 64 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2546  hypothetical protein  62.75 
 
 		 64 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0641671  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2570  hypothetical protein  62.75 
 
 		 64 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522503  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2531  hypothetical protein  61.54 
 
 		 62 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0793629 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0592  hypothetical protein  64.71 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000872604  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1027  hypothetical protein  66.04 
 
 		 61 aa  71.2  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00107826  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2808  protein of unknown function DUF343  62.75 
 
 		 62 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2402  protein of unknown function DUF343  62.75 
 
 		 62 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25520  hypothetical protein  61.11 
 
 		 61 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1726  protein of unknown function DUF343  64.29 
 
 		 72 aa  70.1  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0316795  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1297  acetoacetyl-CoA reductase  58.93 
 
 		 63 aa  69.7  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199005  decreased coverage  0.00515811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2181  hypothetical protein  59.26 
 
 		 61 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1901  hypothetical protein  57.14 
 
 		 61 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000321593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1477  hypothetical protein  57.14 
 
 		 61 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1512  hypothetical protein  57.14 
 
 		 61 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0283  hypothetical protein  58.49 
 
 		 60 aa  68.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3813  hypothetical protein  57.14 
 
 		 61 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0446374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1101  hypothetical protein  56.6 
 
 		 60 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3214  protein of unknown function DUF343  55.36 
 
 		 63 aa  68.2  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2677  hypothetical protein  57.14 
 
 		 59 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1020  hypothetical protein  54.72 
 
 		 60 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.678169 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0993  hypothetical protein  54.72 
 
 		 60 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.638813  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1085  hypothetical protein  54.72 
 
 		 60 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.1669  normal  0.234765 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1052  hypothetical protein  54.72 
 
 		 60 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.202264 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1821  hypothetical protein  50.88 
 
 		 58 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.135378  normal  0.937182 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0311  protein of unknown function DUF343  56.6 
 
 		 59 aa  66.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2509  hypothetical protein  54.55 
 
 		 58 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1506  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  51.85 
 
 		 62 aa  66.6  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225187  normal  0.166181 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0910  hypothetical protein  56.6 
 
 		 59 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1467  hypothetical protein  56.6 
 
 		 59 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>