55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4167 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4167  protein of unknown function DUF343  100 
 
 		 78 aa  149  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.182728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31010  hypothetical protein  74.55 
 
 		 76 aa  82  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.424305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0899  hypothetical protein  63.49 
 
 		 61 aa  79.3  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0245559 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6009  hypothetical protein  66.07 
 
 		 73 aa  70.9  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0181193  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5857  hypothetical protein  56.06 
 
 		 66 aa  68.9  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.768237  normal  0.140959 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4297  protein of unknown function DUF343  61.02 
 
 		 73 aa  66.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.925532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6326  protein of unknown function DUF343  61.4 
 
 		 63 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.239266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7603  protein of unknown function DUF343  58.33 
 
 		 57 aa  61.6  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0752  hypothetical protein  50.77 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0466  hypothetical protein  40 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3759  protein of unknown function DUF343  49.12 
 
 		 58 aa  52  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.075008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4062  protein of unknown function DUF343  52.63 
 
 		 58 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167292  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2509  hypothetical protein  47.37 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1388  hypothetical protein  45.9 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0757  hypothetical protein  50 
 
 		 57 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154426  normal  0.127771 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2125  hypothetical protein  43.1 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0049  protein of unknown function DUF343  42 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.625626  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2647  protein of unknown function DUF343  42.86 
 
 		 66 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0741  hypothetical protein  45.45 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0959  hypothetical protein  43.64 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1027  hypothetical protein  37.88 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00107826  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2088  hypothetical protein  39.06 
 
 		 60 aa  43.5  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000436005  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2304  hypothetical protein  41.79 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3093  hypothetical protein  41.18 
 
 		 70 aa  42.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0718  protein of unknown function DUF343  43.86 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.021704  normal  0.638292 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0929  hypothetical protein  45.45 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2152  hypothetical protein  45.45 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0445417  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2274  hypothetical protein  45.45 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00194763  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0926  hypothetical protein  45.45 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0134205  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1047  hypothetical protein  45.45 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000350171  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0570  hypothetical protein  45.45 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0750  hypothetical protein  45.45 
 
 		 64 aa  42  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112207  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1082  tetraacyldisaccharide-1-P 4-kinase  45.45 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00991384  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0650  protein of unknown function DUF343  46.43 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3215  protein of unknown function DUF343  42.11 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225013  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0490  hypothetical protein  46.43 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.768534  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5877  hypothetical protein  43.64 
 
 		 64 aa  41.6  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140063  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2464  hypothetical protein  43.64 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142603 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2594  hypothetical protein  43.64 
 
 		 67 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129771  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1426  hypothetical protein  37.7 
 
 		 56 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.425865  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3220  protein of unknown function DUF343  40 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2252  protein of unknown function DUF343  40 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.938306 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1934  hypothetical protein  41.82 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109309  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2570  hypothetical protein  41.82 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522503  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2546  hypothetical protein  41.82 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0641671  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3709  hypothetical protein  40.32 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2677  hypothetical protein  33.33 
 
 		 59 aa  40.8  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0944  protein of unknown function DUF343  40 
 
 		 64 aa  40.8  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.928638 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2346  hypothetical protein  42.86 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4097  protein of unknown function DUF343  37.7 
 
 		 62 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0910  hypothetical protein  40 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3270  hypothetical protein  43.64 
 
 		 71 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.731056  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3227  hypothetical protein  49.09 
 
 		 56 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0270  protein of unknown function DUF343  38.1 
 
 		 65 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3207  hypothetical protein  38.33 
 
 		 58 aa  40  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232767  normal  0.26354 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>