97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6009 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6009  hypothetical protein  100 
 
 
73 aa  147  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0181193  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0899  hypothetical protein  78.43 
 
 
61 aa  85.1  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0245559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4297  protein of unknown function DUF343  63.33 
 
 
73 aa  73.9  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.925532  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4167  protein of unknown function DUF343  66.07 
 
 
78 aa  70.9  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.182728  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6326  protein of unknown function DUF343  60.66 
 
 
63 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.239266  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31010  hypothetical protein  59.32 
 
 
76 aa  63.5  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.424305  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7603  protein of unknown function DUF343  56.36 
 
 
57 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0537  hypothetical protein  47.37 
 
 
67 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199917  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5857  hypothetical protein  51.85 
 
 
66 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.768237  normal  0.140959 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3197  protein of unknown function DUF343  47.37 
 
 
67 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.333049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0765  hypothetical protein  47.37 
 
 
67 aa  51.2  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2212  hypothetical protein  49.06 
 
 
140 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106103  normal  0.265266 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5877  hypothetical protein  47.37 
 
 
64 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140063  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2125  hypothetical protein  48.21 
 
 
61 aa  49.7  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2594  hypothetical protein  49.06 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129771  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4893  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  50.98 
 
 
430 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2464  hypothetical protein  49.06 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142603 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0300  hypothetical protein  44.44 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.222502 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0750  hypothetical protein  45.61 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112207  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0741  hypothetical protein  47.17 
 
 
68 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2570  hypothetical protein  45.61 
 
 
64 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522503  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2306  hypothetical protein  50.98 
 
 
60 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190908  normal  0.12744 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2546  hypothetical protein  45.61 
 
 
64 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0641671  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0592  hypothetical protein  44.12 
 
 
67 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000872604  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1934  hypothetical protein  45.61 
 
 
64 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109309  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1553  protein of unknown function DUF343  50.98 
 
 
60 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331555  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2088  hypothetical protein  47.17 
 
 
60 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000436005  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0752  hypothetical protein  47.62 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0534  hypothetical protein  47.37 
 
 
69 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  hitchhiker  0.00000763093 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0926  hypothetical protein  47.17 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0134205  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2274  hypothetical protein  47.17 
 
 
68 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00194763  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0570  hypothetical protein  47.17 
 
 
68 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1082  tetraacyldisaccharide-1-P 4-kinase  47.17 
 
 
68 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00991384  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1047  hypothetical protein  47.17 
 
 
68 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000350171  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2152  hypothetical protein  47.17 
 
 
68 aa  47.8  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0445417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0929  hypothetical protein  47.17 
 
 
68 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2896  hypothetical protein  41.82 
 
 
59 aa  47.4  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0949765  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1310  hypothetical protein  49.02 
 
 
70 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404019  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2608  hypothetical protein  45.28 
 
 
56 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0375272  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1640  hypothetical protein  45.28 
 
 
59 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3759  protein of unknown function DUF343  49.06 
 
 
58 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.075008  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2694  protein of unknown function DUF343  45.28 
 
 
56 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2789  protein of unknown function DUF343  46.15 
 
 
56 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2509  hypothetical protein  48.15 
 
 
58 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2677  hypothetical protein  41.38 
 
 
59 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1821  hypothetical protein  46.15 
 
 
58 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.135378  normal  0.937182 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2210  protein of unknown function DUF343  47.06 
 
 
68 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.451812  normal  0.154545 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2252  protein of unknown function DUF343  50.98 
 
 
63 aa  45.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.938306 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0141  hypothetical protein  45.28 
 
 
59 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.282587  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3299  hypothetical protein  48.08 
 
 
71 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.448781  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0837  hypothetical protein  47.06 
 
 
68 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00693289 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0487  hypothetical protein  47.06 
 
 
66 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  hitchhiker  0.000621039 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0959  hypothetical protein  45.1 
 
 
67 aa  44.3  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0033  protein of unknown function DUF343  47.17 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0508144  hitchhiker  0.000474909 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2127  hypothetical protein  47.17 
 
 
65 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0473913  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3709  hypothetical protein  48 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1613  protein of unknown function DUF343  47.06 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1374  protein of unknown function DUF343  43.4 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.379618  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1491  hypothetical protein  45.28 
 
 
59 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2563  hypothetical protein  49.02 
 
 
60 aa  44.3  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0238405  hitchhiker  0.00461164 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0466  hypothetical protein  41.67 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2253  hypothetical protein  45.1 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.160718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2528  protein of unknown function DUF343  45.1 
 
 
68 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3047  hypothetical protein  40.74 
 
 
62 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3665  hypothetical protein  46.15 
 
 
61 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1863  protein of unknown function DUF343  43.4 
 
 
69 aa  43.9  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945421 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2575  hypothetical protein  43.4 
 
 
70 aa  43.5  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.745341  normal  0.0666419 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1339  hypothetical protein  46.15 
 
 
61 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.736823 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2369  hypothetical protein  44.44 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.77429 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4062  protein of unknown function DUF343  48.21 
 
 
58 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167292  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3270  hypothetical protein  42.31 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.731056  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0294  hypothetical protein  40.74 
 
 
65 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0307109 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1297  acetoacetyl-CoA reductase  48.08 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199005  decreased coverage  0.00515811 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0454  hypothetical protein  40.74 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0661253  normal  0.0911594 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1914  hypothetical protein  39.62 
 
 
58 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.354879  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0075  hypothetical protein  42.59 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0056  hypothetical protein  45.28 
 
 
61 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.825759 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0083  hypothetical protein  40.74 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1027  hypothetical protein  45.1 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00107826  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3156  hypothetical protein  43.14 
 
 
60 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.733102  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2731  hypothetical protein  43.14 
 
 
85 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.923353  normal  0.0512047 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2950  hypothetical protein  45.1 
 
 
60 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2346  hypothetical protein  38.89 
 
 
62 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2197  hypothetical protein  45.1 
 
 
56 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2640  protein of unknown function DUF343  45.1 
 
 
60 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2647  protein of unknown function DUF343  35.85 
 
 
66 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2824  hypothetical protein  35 
 
 
60 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0741259 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1772  hypothetical protein  40.38 
 
 
57 aa  41.2  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0270  protein of unknown function DUF343  40.74 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4097  protein of unknown function DUF343  37.04 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0488  protein of unknown function DUF343  30.19 
 
 
61 aa  40.4  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1506  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  39.22 
 
 
62 aa  40.8  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225187  normal  0.166181 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0131  hypothetical protein  37.5 
 
 
56 aa  40.8  0.007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4243  hypothetical protein  37.5 
 
 
62 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0266  hypothetical protein  39.62 
 
 
66 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.127662  normal  0.479749 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0424  hypothetical protein  39.62 
 
 
66 aa  40  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003985  protein ycaR  47.06 
 
 
59 aa  40  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>