17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6326 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6326  protein of unknown function DUF343  100 
 
 		 63 aa  125  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.239266  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31010  hypothetical protein  63.33 
 
 		 76 aa  78.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.424305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6009  hypothetical protein  60.66 
 
 		 73 aa  67.8  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0181193  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4167  protein of unknown function DUF343  61.4 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.182728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5857  hypothetical protein  59.65 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.768237  normal  0.140959 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0899  hypothetical protein  56.14 
 
 		 61 aa  60.8  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0245559 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4297  protein of unknown function DUF343  47.62 
 
 		 73 aa  51.6  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.925532  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0752  hypothetical protein  48.33 
 
 		 65 aa  50.4  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7603  protein of unknown function DUF343  50 
 
 		 57 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1914  hypothetical protein  39.66 
 
 		 58 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.354879  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3759  protein of unknown function DUF343  48.21 
 
 		 58 aa  45.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.075008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3270  hypothetical protein  46.43 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.731056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1388  hypothetical protein  48.33 
 
 		 57 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341245 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4062  protein of unknown function DUF343  42.86 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167292  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0757  hypothetical protein  45.76 
 
 		 57 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154426  normal  0.127771 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0718  protein of unknown function DUF343  41.38 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.021704  normal  0.638292 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1262  hypothetical protein  47.37 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>