179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7603 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7603  protein of unknown function DUF343  100 
 
 		 57 aa  112  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1388  hypothetical protein  60 
 
 		 57 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0757  hypothetical protein  58.18 
 
 		 57 aa  66.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154426  normal  0.127771 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2509  hypothetical protein  61.11 
 
 		 58 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3759  protein of unknown function DUF343  59.26 
 
 		 58 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.075008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4062  protein of unknown function DUF343  59.62 
 
 		 58 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167292  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4167  protein of unknown function DUF343  58.33 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.182728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0466  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6009  hypothetical protein  56.36 
 
 		 73 aa  57.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0181193  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4297  protein of unknown function DUF343  58.18 
 
 		 73 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.925532  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3197  protein of unknown function DUF343  50.91 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.333049 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5877  hypothetical protein  50.91 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140063  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0765  hypothetical protein  50.91 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0537  hypothetical protein  50.91 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0750  hypothetical protein  52.73 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112207  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0741  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2594  hypothetical protein  51.85 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129771  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2464  hypothetical protein  51.85 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142603 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0899  hypothetical protein  53.57 
 
 		 61 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0245559 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2570  hypothetical protein  49.09 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522503  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1934  hypothetical protein  49.09 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2546  hypothetical protein  49.09 
 
 		 64 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0641671  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0926  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0134205  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2274  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00194763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1082  tetraacyldisaccharide-1-P 4-kinase  50 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00991384  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2346  hypothetical protein  50 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3093  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3635  hypothetical protein  50 
 
 		 57 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.566085  normal  0.472948 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0570  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1047  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000350171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0929  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2152  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0445417  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1914  hypothetical protein  50.94 
 
 		 58 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.354879  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1262  hypothetical protein  52.83 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0718  protein of unknown function DUF343  52.83 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.021704  normal  0.638292 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2647  protein of unknown function DUF343  51.92 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5857  hypothetical protein  56.36 
 
 		 66 aa  53.5  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.768237  normal  0.140959 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2125  hypothetical protein  48.15 
 
 		 61 aa  52  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1855  protein of unknown function DUF343  50.91 
 
 		 63 aa  51.6  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.176655  hitchhiker  0.00737468 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4893  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  51.92 
 
 		 430 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0592  hypothetical protein  49.09 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000872604  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3665  hypothetical protein  48.08 
 
 		 61 aa  50.8  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2212  hypothetical protein  48.15 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106103  normal  0.265266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31010  hypothetical protein  57.89 
 
 		 76 aa  50.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.424305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3227  hypothetical protein  48.15 
 
 		 56 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0534  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  hitchhiker  0.00000763093 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1426  hypothetical protein  51.85 
 
 		 56 aa  50.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.425865  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3709  hypothetical protein  45.28 
 
 		 64 aa  50.4  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2531  hypothetical protein  47.27 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0793629 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2402  protein of unknown function DUF343  47.27 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2808  protein of unknown function DUF343  47.27 
 
 		 62 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3270  hypothetical protein  50 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.731056  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0300  hypothetical protein  46.3 
 
 		 65 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222502 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2088  hypothetical protein  50.98 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000436005  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2939  hypothetical protein  48.15 
 
 		 63 aa  49.7  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0488  protein of unknown function DUF343  44.44 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3220  protein of unknown function DUF343  48.21 
 
 		 65 aa  49.3  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14770  hypothetical protein  50 
 
 		 61 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0752  hypothetical protein  54.55 
 
 		 65 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0910  hypothetical protein  43.64 
 
 		 59 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0490  hypothetical protein  50.94 
 
 		 60 aa  47.8  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.768534  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1297  acetoacetyl-CoA reductase  49.06 
 
 		 63 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199005  decreased coverage  0.00515811 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0650  protein of unknown function DUF343  50.94 
 
 		 60 aa  47.8  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1310  hypothetical protein  44.23 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404019  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2257  hypothetical protein  48 
 
 		 58 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523879  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0959  hypothetical protein  46.15 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3029  hypothetical protein  49.09 
 
 		 58 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0131  hypothetical protein  41.82 
 
 		 56 aa  46.6  0.0001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1506  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  50 
 
 		 62 aa  46.2  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225187  normal  0.166181 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0075  hypothetical protein  47.17 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2043  protein of unknown function DUF343  48.15 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1339  hypothetical protein  47.17 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.736823 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2304  hypothetical protein  47.27 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0283  hypothetical protein  43.4 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1771  hypothetical protein  46.43 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09130  hypothetical protein  43.86 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1027  hypothetical protein  42.59 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00107826  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0454  hypothetical protein  44.44 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0661253  normal  0.0911594 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6326  protein of unknown function DUF343  50 
 
 		 63 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.239266  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2306  hypothetical protein  48.08 
 
 		 60 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190908  normal  0.12744 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3047  hypothetical protein  42.59 
 
 		 62 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1553  protein of unknown function DUF343  48.08 
 
 		 60 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331555  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3844  hypothetical protein  46.15 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0294  hypothetical protein  44.44 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0307109 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0194  hypothetical protein  40 
 
 		 59 aa  45.4  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2307  protein of unknown function DUF343  48.21 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.858072  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2563  hypothetical protein  48.08 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0238405  hitchhiker  0.00461164 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1821  hypothetical protein  46.15 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.135378  normal  0.937182 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2210  protein of unknown function DUF343  44.23 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.451812  normal  0.154545 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3239  hypothetical protein  43.64 
 
 		 119 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.641232  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0815  protein of unknown function DUF343  42.11 
 
 		 58 aa  44.7  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232843  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4174  hypothetical protein  44.23 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.172558  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0837  hypothetical protein  44.23 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00693289 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25520  hypothetical protein  46.15 
 
 		 61 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2252  protein of unknown function DUF343  42.31 
 
 		 63 aa  45.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.938306 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2528  protein of unknown function DUF343  44.23 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2253  hypothetical protein  44.23 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.160718 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2181  hypothetical protein  46.15 
 
 		 61 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1374  protein of unknown function DUF343  42.59 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.379618  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2661  hypothetical protein  48.08 
 
 		 60 aa  44.3  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.654159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>