32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09130 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_09130  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  153  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2541  hypothetical protein  77.59 
 
 		 63 aa  88.2  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1218  hypothetical protein  67.24 
 
 		 62 aa  82  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.995258 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1855  protein of unknown function DUF343  65.52 
 
 		 63 aa  78.6  0.00000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.176655  hitchhiker  0.00737468 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2340  hypothetical protein  56.34 
 
 		 76 aa  75.5  0.0000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0734131  hitchhiker  0.0000189619 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0757  hypothetical protein  47.46 
 
 		 57 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154426  normal  0.127771 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3759  protein of unknown function DUF343  46.55 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.075008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2509  hypothetical protein  49.15 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7603  protein of unknown function DUF343  43.86 
 
 		 57 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2125  hypothetical protein  42.86 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2731  hypothetical protein  43.66 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.923353  normal  0.0512047 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0466  hypothetical protein  40.74 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1388  hypothetical protein  45.76 
 
 		 57 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341245 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1310  hypothetical protein  38.57 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404019  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0131  hypothetical protein  37.93 
 
 		 56 aa  43.5  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3840  hypothetical protein  47.37 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.739989  normal  0.0432381 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2212  hypothetical protein  44.83 
 
 		 140 aa  42.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106103  normal  0.265266 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0194  hypothetical protein  41.38 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4097  protein of unknown function DUF343  37.93 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2939  hypothetical protein  45.76 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4243  hypothetical protein  39.66 
 
 		 62 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1863  protein of unknown function DUF343  41.18 
 
 		 69 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945421 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4297  protein of unknown function DUF343  42.11 
 
 		 73 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.925532  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1027  hypothetical protein  37.93 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00107826  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3047  hypothetical protein  32.76 
 
 		 62 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0910  hypothetical protein  42.37 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4062  protein of unknown function DUF343  45.76 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167292  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3773  protein of unknown function DUF343  38.33 
 
 		 62 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540183  normal  0.541189 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0959  hypothetical protein  44.07 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0741  hypothetical protein  45.61 
 
 		 68 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0424  hypothetical protein  44.07 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1098  hypothetical protein  38.18 
 
 		 58 aa  40.4  0.009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.647732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>