113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1855 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1855  protein of unknown function DUF343  100 
 
 		 63 aa  128  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.176655  hitchhiker  0.00737468 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2541  hypothetical protein  70.69 
 
 		 63 aa  81.3  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09130  hypothetical protein  65.52 
 
 		 76 aa  78.6  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2340  hypothetical protein  62.5 
 
 		 76 aa  68.9  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0734131  hitchhiker  0.0000189619 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1218  hypothetical protein  58.33 
 
 		 62 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.995258 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25520  hypothetical protein  51.72 
 
 		 61 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2181  hypothetical protein  50 
 
 		 61 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7603  protein of unknown function DUF343  50.91 
 
 		 57 aa  51.6  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0757  hypothetical protein  43.1 
 
 		 57 aa  50.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154426  normal  0.127771 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2563  hypothetical protein  51.72 
 
 		 60 aa  50.4  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0238405  hitchhiker  0.00461164 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2153  hypothetical protein  53.7 
 
 		 65 aa  50.4  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.286356  normal  0.313374 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0959  hypothetical protein  46.55 
 
 		 67 aa  50.4  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14770  hypothetical protein  43.1 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1901  hypothetical protein  46.55 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000321593 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2950  hypothetical protein  53.7 
 
 		 60 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3813  hypothetical protein  46.55 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0446374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1477  hypothetical protein  46.55 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1512  hypothetical protein  46.55 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3844  hypothetical protein  46.67 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4174  hypothetical protein  46.67 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.172558  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3156  hypothetical protein  51.85 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.733102  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2306  hypothetical protein  50 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190908  normal  0.12744 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1553  protein of unknown function DUF343  50 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331555  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2486  hypothetical protein  42.62 
 
 		 65 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0551102  normal  0.879206 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3759  protein of unknown function DUF343  46.55 
 
 		 58 aa  47.8  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.075008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2206  protein of unknown function DUF343  48.15 
 
 		 60 aa  47.4  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2212  hypothetical protein  44.26 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106103  normal  0.265266 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1436  hypothetical protein  50 
 
 		 60 aa  47  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2043  protein of unknown function DUF343  48.15 
 
 		 60 aa  47  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1388  hypothetical protein  44.07 
 
 		 57 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341245 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2640  protein of unknown function DUF343  51.85 
 
 		 60 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1615  hypothetical protein  45.61 
 
 		 61 aa  47  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.822901  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1771  hypothetical protein  48.15 
 
 		 60 aa  47  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1297  acetoacetyl-CoA reductase  46.3 
 
 		 63 aa  47  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199005  decreased coverage  0.00515811 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1782  hypothetical protein  42.11 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.188644  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1310  hypothetical protein  47.54 
 
 		 70 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404019  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1718  hypothetical protein  48.15 
 
 		 60 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3569  hypothetical protein  48.28 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0331586  hitchhiker  0.00582787 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1101  hypothetical protein  46.3 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1374  protein of unknown function DUF343  48.15 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.379618  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2307  protein of unknown function DUF343  48.15 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.858072  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4893  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  48.28 
 
 		 430 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2125  hypothetical protein  41.38 
 
 		 61 aa  45.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2572  hypothetical protein  48.15 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1772  hypothetical protein  41.67 
 
 		 57 aa  45.8  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1964  hypothetical protein  48.15 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2253  hypothetical protein  44.83 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.160718 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2661  hypothetical protein  48.15 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.654159  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2528  protein of unknown function DUF343  44.83 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2509  hypothetical protein  47.46 
 
 		 58 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1027  hypothetical protein  37.93 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00107826  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1726  protein of unknown function DUF343  46.3 
 
 		 72 aa  45.4  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0316795  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0300  hypothetical protein  42.37 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222502 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2210  protein of unknown function DUF343  48.28 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.451812  normal  0.154545 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1020  hypothetical protein  42.11 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.678169 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1085  hypothetical protein  42.11 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.1669  normal  0.234765 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0993  hypothetical protein  42.11 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.638813  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1052  hypothetical protein  42.11 
 
 		 60 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.202264 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2386  hypothetical protein  38.71 
 
 		 58 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1098  hypothetical protein  41.67 
 
 		 58 aa  44.7  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.647732  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00921  hypothetical protein  44.44 
 
 		 60 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0400201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2726  protein of unknown function DUF343  44.44 
 
 		 60 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3270  hypothetical protein  44.07 
 
 		 71 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.731056  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1024  hypothetical protein  44.44 
 
 		 60 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0234361  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1015  hypothetical protein  44.44 
 
 		 60 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00271663  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2679  hypothetical protein  44.44 
 
 		 60 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.10182  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2203  hypothetical protein  44.44 
 
 		 60 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.082443  normal  0.29986 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2407  hypothetical protein  44.44 
 
 		 60 aa  44.7  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.025157  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1078  hypothetical protein  44.44 
 
 		 60 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00247062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00928  hypothetical protein  44.44 
 
 		 60 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1922  hypothetical protein  47.46 
 
 		 60 aa  44.3  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.504408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4243  hypothetical protein  42.37 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4588  hypothetical protein  44.44 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.658837 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1821  hypothetical protein  40.68 
 
 		 58 aa  43.9  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.135378  normal  0.937182 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0075  hypothetical protein  44.07 
 
 		 66 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0294  hypothetical protein  44.07 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0307109 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0454  hypothetical protein  44.07 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0661253  normal  0.0911594 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3840  hypothetical protein  43.86 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.739989  normal  0.0432381 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1491  hypothetical protein  46.3 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0424  hypothetical protein  39.66 
 
 		 66 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2939  hypothetical protein  49.15 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1467  hypothetical protein  44.44 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01537  hypothetical protein  42.59 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0837  hypothetical protein  44.07 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00693289 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003985  protein ycaR  44.44 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01858  hypothetical protein  38.33 
 
 		 64 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126062  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3214  protein of unknown function DUF343  37.93 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2088  hypothetical protein  46.3 
 
 		 60 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000436005  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2197  hypothetical protein  36.67 
 
 		 56 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0141  hypothetical protein  46.3 
 
 		 59 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.282587  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3047  hypothetical protein  42.37 
 
 		 62 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3286  hypothetical protein  45.76 
 
 		 64 aa  41.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0595  protein of unknown function DUF343  49.09 
 
 		 64 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4097  protein of unknown function DUF343  42.37 
 
 		 62 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0891  hypothetical protein  45.76 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.883095  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0266  hypothetical protein  40.68 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.127662  normal  0.479749 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0083  hypothetical protein  43.33 
 
 		 65 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0835  hypothetical protein  45.76 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.137665  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0033  protein of unknown function DUF343  44.44 
 
 		 63 aa  41.2  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0508144  hitchhiker  0.000474909 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2252  protein of unknown function DUF343  39.66 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.938306 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>