196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_25520 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_25520  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2181  hypothetical protein  96.72 
 
 		 61 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1901  hypothetical protein  86.89 
 
 		 61 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000321593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1477  hypothetical protein  86.89 
 
 		 61 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1512  hypothetical protein  86.89 
 
 		 61 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3813  hypothetical protein  86.89 
 
 		 61 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0446374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1615  hypothetical protein  85.25 
 
 		 61 aa  103  9e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.822901  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3844  hypothetical protein  83.61 
 
 		 61 aa  102  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4174  hypothetical protein  85.25 
 
 		 61 aa  103  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.172558  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14770  hypothetical protein  78.69 
 
 		 61 aa  100  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2153  hypothetical protein  68.33 
 
 		 65 aa  88.6  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.286356  normal  0.313374 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1374  protein of unknown function DUF343  68.85 
 
 		 64 aa  82.4  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.379618  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0959  hypothetical protein  63.79 
 
 		 67 aa  80.9  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2950  hypothetical protein  64.91 
 
 		 60 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1553  protein of unknown function DUF343  62.3 
 
 		 60 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331555  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1739  hypothetical protein  62.3 
 
 		 62 aa  79  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2306  hypothetical protein  62.3 
 
 		 60 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190908  normal  0.12744 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3270  hypothetical protein  64.91 
 
 		 71 aa  78.2  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.731056  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2252  protein of unknown function DUF343  63.64 
 
 		 63 aa  78.6  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.938306 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3569  hypothetical protein  61.4 
 
 		 60 aa  77.4  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0331586  hitchhiker  0.00582787 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0595  protein of unknown function DUF343  65.52 
 
 		 64 aa  77.4  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2563  hypothetical protein  62.96 
 
 		 60 aa  77  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0238405  hitchhiker  0.00461164 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1027  hypothetical protein  60.66 
 
 		 61 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00107826  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1771  hypothetical protein  61.4 
 
 		 60 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1922  hypothetical protein  63.16 
 
 		 60 aa  75.5  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.504408  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2640  protein of unknown function DUF343  61.4 
 
 		 60 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3156  hypothetical protein  57.89 
 
 		 60 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.733102  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2125  hypothetical protein  62.96 
 
 		 61 aa  75.1  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1297  acetoacetyl-CoA reductase  60.34 
 
 		 63 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199005  decreased coverage  0.00515811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2212  hypothetical protein  61.4 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106103  normal  0.265266 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2043  protein of unknown function DUF343  59.65 
 
 		 60 aa  74.3  0.0000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1718  hypothetical protein  55.17 
 
 		 60 aa  73.9  0.0000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4893  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  62.3 
 
 		 430 aa  73.9  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1726  protein of unknown function DUF343  60.66 
 
 		 72 aa  73.9  0.0000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0316795  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4097  protein of unknown function DUF343  62.96 
 
 		 62 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2307  protein of unknown function DUF343  59.65 
 
 		 60 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.858072  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3214  protein of unknown function DUF343  61.4 
 
 		 63 aa  73.2  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0300  hypothetical protein  64.81 
 
 		 65 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222502 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4243  hypothetical protein  60.38 
 
 		 62 aa  72  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0075  hypothetical protein  66.04 
 
 		 66 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2088  hypothetical protein  58.33 
 
 		 60 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000436005  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3773  protein of unknown function DUF343  62.96 
 
 		 62 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540183  normal  0.541189 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1436  hypothetical protein  59.65 
 
 		 60 aa  72.8  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2572  hypothetical protein  53.45 
 
 		 60 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1101  hypothetical protein  57.89 
 
 		 60 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2661  hypothetical protein  53.45 
 
 		 60 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.654159  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1964  hypothetical protein  53.45 
 
 		 60 aa  71.6  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2206  protein of unknown function DUF343  57.89 
 
 		 60 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0266  hypothetical protein  64.81 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.127662  normal  0.479749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2253  hypothetical protein  62.96 
 
 		 68 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.160718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2210  protein of unknown function DUF343  62.96 
 
 		 68 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.451812  normal  0.154545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2528  protein of unknown function DUF343  62.96 
 
 		 68 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0835  hypothetical protein  59.26 
 
 		 64 aa  70.9  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.137665  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0891  hypothetical protein  59.26 
 
 		 64 aa  70.9  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.883095  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1310  hypothetical protein  61.11 
 
 		 70 aa  70.5  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404019  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0837  hypothetical protein  66.04 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00693289 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00921  hypothetical protein  56.14 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0400201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2726  protein of unknown function DUF343  56.14 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2679  hypothetical protein  56.14 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.10182  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0270  protein of unknown function DUF343  64.81 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1078  hypothetical protein  56.14 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00247062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1024  hypothetical protein  56.14 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0234361  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2407  hypothetical protein  56.14 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.025157  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00928  hypothetical protein  56.14 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1015  hypothetical protein  56.14 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00271663  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2203  hypothetical protein  56.14 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.082443  normal  0.29986 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1085  hypothetical protein  54.39 
 
 		 60 aa  69.3  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.1669  normal  0.234765 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1052  hypothetical protein  54.39 
 
 		 60 aa  69.3  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.202264 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0454  hypothetical protein  62.96 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0661253  normal  0.0911594 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1020  hypothetical protein  54.39 
 
 		 60 aa  69.3  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.678169 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0993  hypothetical protein  54.39 
 
 		 60 aa  69.3  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.638813  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3286  hypothetical protein  61.11 
 
 		 64 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0283  hypothetical protein  63.16 
 
 		 60 aa  70.1  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1467  hypothetical protein  57.89 
 
 		 59 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0487  hypothetical protein  64.15 
 
 		 66 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  hitchhiker  0.000621039 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0294  hypothetical protein  62.96 
 
 		 65 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0307109 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1613  protein of unknown function DUF343  64.15 
 
 		 66 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3047  hypothetical protein  60.38 
 
 		 62 aa  68.9  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01858  hypothetical protein  54.39 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126062  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01537  hypothetical protein  56.14 
 
 		 59 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2939  hypothetical protein  59.26 
 
 		 63 aa  68.2  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0311  protein of unknown function DUF343  61.4 
 
 		 59 aa  67.8  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0083  hypothetical protein  59.26 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1491  hypothetical protein  58.49 
 
 		 59 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2556  hypothetical protein  57.41 
 
 		 67 aa  67  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131307 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1098  hypothetical protein  59.62 
 
 		 58 aa  67  0.00000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.647732  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0141  hypothetical protein  58.49 
 
 		 59 aa  67  0.00000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.282587  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003985  protein ycaR  54.39 
 
 		 59 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0424  hypothetical protein  57.41 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2731  hypothetical protein  61.11 
 
 		 85 aa  66.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.923353  normal  0.0512047 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2486  hypothetical protein  57.41 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0551102  normal  0.879206 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3665  hypothetical protein  57.41 
 
 		 61 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0131  hypothetical protein  58.49 
 
 		 56 aa  65.5  0.0000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2677  hypothetical protein  54.24 
 
 		 59 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0194  hypothetical protein  58.49 
 
 		 59 aa  65.9  0.0000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1863  protein of unknown function DUF343  59.26 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945421 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0634  hypothetical protein  54.39 
 
 		 70 aa  64.7  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.797017  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4588  hypothetical protein  56 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.658837 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3207  hypothetical protein  55.36 
 
 		 58 aa  63.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232767  normal  0.26354 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0033  protein of unknown function DUF343  51.85 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0508144  hitchhiker  0.000474909 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>