172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2304 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2304  hypothetical protein  100 
 
 		 87 aa  174  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2647  protein of unknown function DUF343  70.97 
 
 		 66 aa  92  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3220  protein of unknown function DUF343  67.21 
 
 		 65 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0718  protein of unknown function DUF343  63.93 
 
 		 67 aa  84  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.021704  normal  0.638292 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3093  hypothetical protein  57.81 
 
 		 70 aa  79  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2346  hypothetical protein  64 
 
 		 62 aa  67  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0815  protein of unknown function DUF343  52.63 
 
 		 58 aa  67.4  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232843  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3635  hypothetical protein  46.43 
 
 		 57 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.566085  normal  0.472948 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3227  hypothetical protein  59.62 
 
 		 56 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1262  hypothetical protein  50.82 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1914  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  62  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.354879  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0490  hypothetical protein  49.09 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.768534  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0650  protein of unknown function DUF343  49.09 
 
 		 60 aa  61.6  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1506  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  56 
 
 		 62 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225187  normal  0.166181 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0910  hypothetical protein  54 
 
 		 59 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0488  protein of unknown function DUF343  44.64 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2677  hypothetical protein  50 
 
 		 59 aa  57.4  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3029  hypothetical protein  54 
 
 		 58 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1426  hypothetical protein  53.85 
 
 		 56 aa  57  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.425865  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14770  hypothetical protein  56 
 
 		 61 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2608  hypothetical protein  48.08 
 
 		 56 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0375272  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2789  protein of unknown function DUF343  46.3 
 
 		 56 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2257  hypothetical protein  52 
 
 		 58 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523879  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2694  protein of unknown function DUF343  48.08 
 
 		 56 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0283  hypothetical protein  50 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0311  protein of unknown function DUF343  48 
 
 		 59 aa  52.8  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4062  protein of unknown function DUF343  54.9 
 
 		 58 aa  52.8  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167292  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3207  hypothetical protein  46 
 
 		 58 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232767  normal  0.26354 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0634  hypothetical protein  50 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.797017  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1739  hypothetical protein  44.26 
 
 		 62 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2274  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00194763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1082  tetraacyldisaccharide-1-P 4-kinase  50 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00991384  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0741  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0570  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1047  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000350171  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0926  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0134205  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0929  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2152  hypothetical protein  50 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0445417  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2088  hypothetical protein  45.61 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000436005  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1745  protein of unknown function DUF343  50 
 
 		 73 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0757  hypothetical protein  48.08 
 
 		 57 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154426  normal  0.127771 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2420  hypothetical protein  46.15 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2490  hypothetical protein  46.15 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0932206  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2582  hypothetical protein  46.15 
 
 		 59 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.125481 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3214  protein of unknown function DUF343  50 
 
 		 63 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1615  hypothetical protein  50 
 
 		 61 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.822901  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3844  hypothetical protein  50 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3197  protein of unknown function DUF343  48 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.333049 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4174  hypothetical protein  48 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.172558  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0765  hypothetical protein  48 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0750  hypothetical protein  50 
 
 		 64 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112207  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0537  hypothetical protein  48 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2824  hypothetical protein  38.71 
 
 		 60 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0741259 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1901  hypothetical protein  42.62 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000321593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1477  hypothetical protein  42.62 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3813  hypothetical protein  42.62 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0446374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2575  hypothetical protein  44.23 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.745341  normal  0.0666419 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1512  hypothetical protein  42.62 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0592  hypothetical protein  46 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000872604  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5877  hypothetical protein  48 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140063  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2672  protein of unknown function DUF343  44.23 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0296171  normal  0.0260721 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2464  hypothetical protein  48 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142603 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2594  hypothetical protein  48 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129771  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2486  hypothetical protein  44 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0551102  normal  0.879206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1685  hypothetical protein  44.23 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1707  hypothetical protein  44.23 
 
 		 59 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.502492  normal  0.508919 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2153  hypothetical protein  46.97 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.286356  normal  0.313374 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2800  hypothetical protein  44.23 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1895  hypothetical protein  43.33 
 
 		 59 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1588  hypothetical protein  37.31 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.412057  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0534  hypothetical protein  46 
 
 		 69 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  hitchhiker  0.00000763093 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0256  hypothetical protein  53.19 
 
 		 54 aa  47.8  0.00005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0280343  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0595  protein of unknown function DUF343  43.1 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1934  hypothetical protein  46 
 
 		 64 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2546  hypothetical protein  46 
 
 		 64 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0641671  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2570  hypothetical protein  46 
 
 		 64 aa  47.8  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522503  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1884  hypothetical protein  43.33 
 
 		 59 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31010  hypothetical protein  41.43 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.424305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1670  hypothetical protein  44.23 
 
 		 59 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0752  hypothetical protein  50.91 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1726  protein of unknown function DUF343  40.35 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0316795  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1821  hypothetical protein  37.7 
 
 		 58 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.135378  normal  0.937182 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0959  hypothetical protein  43.33 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1374  protein of unknown function DUF343  46 
 
 		 64 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.379618  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5857  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.768237  normal  0.140959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1388  hypothetical protein  48.08 
 
 		 57 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341245 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1559  hypothetical protein  42.31 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.730399  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1772  hypothetical protein  42.31 
 
 		 57 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2531  hypothetical protein  44 
 
 		 62 aa  45.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0793629 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7603  protein of unknown function DUF343  47.27 
 
 		 57 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25520  hypothetical protein  46 
 
 		 61 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0466  hypothetical protein  35.53 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0279  hypothetical protein  47.83 
 
 		 48 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2181  hypothetical protein  46 
 
 		 61 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2320  hypothetical protein  44.44 
 
 		 58 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2402  protein of unknown function DUF343  44 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0270  protein of unknown function DUF343  39.66 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0657  hypothetical protein  37.25 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.255489  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2808  protein of unknown function DUF343  44 
 
 		 62 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1597a  conserved cytosolic protein  42.31 
 
 		 56 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.772471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>