83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2320 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2320  hypothetical protein  100 
 
 
58 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0006  hypothetical protein  64.91 
 
 
61 aa  80.5  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0864  hypothetical protein  60.34 
 
 
62 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0005  hypothetical protein  63.16 
 
 
59 aa  75.1  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1284  hypothetical protein  58.18 
 
 
60 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0049  protein of unknown function DUF343  58.62 
 
 
64 aa  71.6  0.000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.625626  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0944  protein of unknown function DUF343  55.17 
 
 
64 aa  70.9  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.928638 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2231  protein of unknown function DUF343  56.6 
 
 
55 aa  70.5  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.941145  normal  0.0330687 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0063  hypothetical protein  56.14 
 
 
59 aa  68.6  0.00000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000183566  hitchhiker  0.000563902 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3520  hypothetical protein  59.62 
 
 
55 aa  65.9  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000106635  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2176  protein of unknown function DUF343  55.77 
 
 
59 aa  65.5  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1056  protein of unknown function DUF343  51.67 
 
 
66 aa  55.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3215  protein of unknown function DUF343  44.62 
 
 
71 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225013  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0718  protein of unknown function DUF343  48.15 
 
 
67 aa  53.5  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.021704  normal  0.638292 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2572  hypothetical protein  44.83 
 
 
313 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.134075  normal  0.851171 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1506  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  42.11 
 
 
62 aa  47.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225187  normal  0.166181 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1886  Methyltransferase type 11  43.86 
 
 
313 aa  47  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000470548  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0266  hypothetical protein  40 
 
 
66 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.127662  normal  0.479749 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2582  hypothetical protein  50 
 
 
59 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.125481 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2420  hypothetical protein  50 
 
 
59 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2490  hypothetical protein  50 
 
 
59 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0932206  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2088  hypothetical protein  44.44 
 
 
60 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000436005  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0270  protein of unknown function DUF343  41.82 
 
 
65 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0592  hypothetical protein  44.44 
 
 
67 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000872604  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2114  methyltransferase type 11  45.45 
 
 
276 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.420703  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1685  hypothetical protein  48.08 
 
 
59 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0125  hypothetical protein  39.66 
 
 
339 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2304  hypothetical protein  44.44 
 
 
87 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1707  hypothetical protein  48.08 
 
 
59 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.502492  normal  0.508919 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2800  hypothetical protein  46.15 
 
 
59 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0534  hypothetical protein  44.44 
 
 
69 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  hitchhiker  0.00000763093 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0454  hypothetical protein  40 
 
 
65 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0661253  normal  0.0911594 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2672  protein of unknown function DUF343  48.08 
 
 
59 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0296171  normal  0.0260721 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3227  hypothetical protein  40.74 
 
 
56 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0294  hypothetical protein  40 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0307109 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3220  protein of unknown function DUF343  46.3 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0122  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
363 aa  44.3  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.678771  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1559  hypothetical protein  46.15 
 
 
59 aa  44.3  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.730399  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1670  hypothetical protein  46.15 
 
 
59 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1245  methyltransferase type 11  39.66 
 
 
322 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.240532  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1914  hypothetical protein  44.44 
 
 
58 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.354879  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2824  hypothetical protein  46.15 
 
 
60 aa  43.9  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0741259 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3207  hypothetical protein  40.74 
 
 
58 aa  43.9  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232767  normal  0.26354 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2677  hypothetical protein  40.35 
 
 
59 aa  43.9  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1597a  conserved cytosolic protein  42.11 
 
 
56 aa  43.5  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.772471  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1772  hypothetical protein  44.23 
 
 
57 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14770  hypothetical protein  42.59 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4174  hypothetical protein  42.59 
 
 
61 aa  42.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.172558  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1615  hypothetical protein  46.3 
 
 
61 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.822901  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  41.18 
 
 
339 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1755  methyltransferase type 11  43.64 
 
 
276 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1082  tetraacyldisaccharide-1-P 4-kinase  40.74 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00991384  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2152  hypothetical protein  40.74 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0445417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0929  hypothetical protein  40.74 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0926  hypothetical protein  40.74 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0134205  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1047  hypothetical protein  40.74 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000350171  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0570  hypothetical protein  40.74 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0466  hypothetical protein  40.38 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3635  hypothetical protein  42.59 
 
 
57 aa  42.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.566085  normal  0.472948 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2274  hypothetical protein  40.74 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00194763  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0083  hypothetical protein  38.18 
 
 
65 aa  42  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2575  hypothetical protein  45.1 
 
 
70 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.745341  normal  0.0666419 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3844  hypothetical protein  38.89 
 
 
61 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0075  hypothetical protein  40.74 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0815  protein of unknown function DUF343  42.59 
 
 
58 aa  41.6  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232843  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2346  hypothetical protein  37.04 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2402  protein of unknown function DUF343  40.74 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213254  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2808  protein of unknown function DUF343  40.74 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106746  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1739  hypothetical protein  40.74 
 
 
62 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.317629  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0657  hypothetical protein  42.59 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.255489  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1262  hypothetical protein  42.59 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0300  hypothetical protein  37.74 
 
 
65 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.222502 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2531  hypothetical protein  40.74 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0793629 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3197  protein of unknown function DUF343  40.74 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.333049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0537  hypothetical protein  40.74 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199917  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0765  hypothetical protein  40.74 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2464  hypothetical protein  40.74 
 
 
67 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142603 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2594  hypothetical protein  40.74 
 
 
67 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129771  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5877  hypothetical protein  40.74 
 
 
64 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140063  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2694  protein of unknown function DUF343  47.06 
 
 
56 aa  40  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0283  hypothetical protein  42.59 
 
 
60 aa  40.4  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0741  hypothetical protein  40.74 
 
 
68 aa  40  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2789  protein of unknown function DUF343  47.06 
 
 
56 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>