38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2231 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2231  protein of unknown function DUF343  100 
 
 		 55 aa  114  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.941145  normal  0.0330687 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0005  hypothetical protein  61.82 
 
 		 59 aa  73.9  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0006  hypothetical protein  65.38 
 
 		 61 aa  72.8  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2320  hypothetical protein  56.6 
 
 		 58 aa  70.5  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1284  hypothetical protein  56.86 
 
 		 60 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3520  hypothetical protein  58 
 
 		 55 aa  67.8  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000106635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0864  hypothetical protein  52.94 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0063  hypothetical protein  46.15 
 
 		 59 aa  59.7  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000183566  hitchhiker  0.000563902 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0944  protein of unknown function DUF343  50.98 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.928638 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2176  protein of unknown function DUF343  52 
 
 		 59 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0049  protein of unknown function DUF343  50.98 
 
 		 64 aa  56.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.625626  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2220  Methyltransferase type 11  43.48 
 
 		 314 aa  51.2  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3215  protein of unknown function DUF343  48.28 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225013  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1597a  conserved cytosolic protein  47.27 
 
 		 56 aa  47.4  0.00006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.772471  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0122  Methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 363 aa  47  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.678771  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  46.3 
 
 		 339 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2088  hypothetical protein  46 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000436005  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1056  protein of unknown function DUF343  47.17 
 
 		 66 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1506  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  38.18 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225187  normal  0.166181 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1245  methyltransferase type 11  40.74 
 
 		 322 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.240532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0246  hypothetical protein  46.15 
 
 		 89 aa  42.7  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2677  hypothetical protein  37.04 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1821  hypothetical protein  40 
 
 		 58 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.135378  normal  0.937182 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1772  hypothetical protein  41.82 
 
 		 57 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2824  hypothetical protein  41.82 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0741259 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1914  hypothetical protein  44 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.354879  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2572  hypothetical protein  41.18 
 
 		 313 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.134075  normal  0.851171 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2486  hypothetical protein  48 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0551102  normal  0.879206 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0456  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 371 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3227  hypothetical protein  40 
 
 		 56 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2346  hypothetical protein  40 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0454  hypothetical protein  35.85 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0661253  normal  0.0911594 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0294  hypothetical protein  35.85 
 
 		 65 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0307109 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0537  hypothetical protein  42 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3197  protein of unknown function DUF343  42 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.333049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0765  hypothetical protein  42 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0815  protein of unknown function DUF343  42 
 
 		 58 aa  40.4  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232843  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0466  hypothetical protein  38.46 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>