61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0006 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0006  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  122  2e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0005  hypothetical protein  63.16 
 
 		 59 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2320  hypothetical protein  64.91 
 
 		 58 aa  80.5  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2231  protein of unknown function DUF343  65.38 
 
 		 55 aa  72.8  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.941145  normal  0.0330687 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0864  hypothetical protein  61.82 
 
 		 62 aa  71.6  0.000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1284  hypothetical protein  52.73 
 
 		 60 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3520  hypothetical protein  64 
 
 		 55 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000106635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0063  hypothetical protein  51.79 
 
 		 59 aa  65.9  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000183566  hitchhiker  0.000563902 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0944  protein of unknown function DUF343  50.91 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.928638 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0049  protein of unknown function DUF343  50.82 
 
 		 64 aa  64.3  0.0000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.625626  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2176  protein of unknown function DUF343  55.36 
 
 		 59 aa  62  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3215  protein of unknown function DUF343  46.77 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225013  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1056  protein of unknown function DUF343  49.12 
 
 		 66 aa  51.6  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0122  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 363 aa  48.9  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.678771  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1245  methyltransferase type 11  40.62 
 
 		 322 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.240532  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2572  hypothetical protein  37.93 
 
 		 313 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.134075  normal  0.851171 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1506  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  43.1 
 
 		 62 aa  47  0.00009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225187  normal  0.166181 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3220  protein of unknown function DUF343  46.3 
 
 		 65 aa  46.2  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2304  hypothetical protein  43.1 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2672  protein of unknown function DUF343  44.64 
 
 		 59 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0296171  normal  0.0260721 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0246  hypothetical protein  44.64 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3029  hypothetical protein  44.44 
 
 		 58 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1685  hypothetical protein  44.64 
 
 		 59 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1559  hypothetical protein  44.64 
 
 		 59 aa  44.3  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.730399  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1707  hypothetical protein  44.64 
 
 		 59 aa  44.3  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.502492  normal  0.508919 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  50 
 
 		 339 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0718  protein of unknown function DUF343  42.59 
 
 		 67 aa  44.3  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.021704  normal  0.638292 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2197  hypothetical protein  42.86 
 
 		 56 aa  43.9  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0900  hypothetical protein  38.98 
 
 		 313 aa  43.5  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0815  protein of unknown function DUF343  41.38 
 
 		 58 aa  43.5  0.0009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232843  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1886  Methyltransferase type 11  34.92 
 
 		 313 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000470548  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2824  hypothetical protein  42.86 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0741259 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1772  hypothetical protein  41.38 
 
 		 57 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1366  methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 288 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2582  hypothetical protein  42.86 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.125481 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2490  hypothetical protein  42.86 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0932206  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2420  hypothetical protein  42.86 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2700  hypothetical protein  37.29 
 
 		 312 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000485808  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2677  hypothetical protein  39.66 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1670  hypothetical protein  42.86 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1374  protein of unknown function DUF343  40 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.379618  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1339  hypothetical protein  42.86 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.736823 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0125  hypothetical protein  36.21 
 
 		 339 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2220  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 314 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2800  hypothetical protein  41.07 
 
 		 59 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2088  hypothetical protein  39.66 
 
 		 60 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000436005  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1914  hypothetical protein  39.66 
 
 		 58 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.354879  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1755  methyltransferase type 11  40 
 
 		 276 aa  41.2  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1597a  conserved cytosolic protein  37.93 
 
 		 56 aa  41.2  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.772471  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0083  hypothetical protein  41.07 
 
 		 65 aa  41.2  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0592  hypothetical protein  39.66 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000872604  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1640  hypothetical protein  42.86 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2386  hypothetical protein  44.64 
 
 		 58 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2114  methyltransferase type 11  40 
 
 		 276 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.420703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0534  hypothetical protein  39.66 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  hitchhiker  0.00000763093 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1821  hypothetical protein  39.29 
 
 		 58 aa  40.8  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.135378  normal  0.937182 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1618  Methyltransferase type 11  36.73 
 
 		 299 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2486  hypothetical protein  40.74 
 
 		 65 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0551102  normal  0.879206 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0454  hypothetical protein  37.5 
 
 		 65 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0661253  normal  0.0911594 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3227  hypothetical protein  37.93 
 
 		 56 aa  40  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0294  hypothetical protein  37.5 
 
 		 65 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0307109 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>