22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0063 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0063  hypothetical protein  100 
 
 
59 aa  122  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000183566  hitchhiker  0.000563902 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2320  hypothetical protein  56.14 
 
 
58 aa  68.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0006  hypothetical protein  51.79 
 
 
61 aa  65.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0944  protein of unknown function DUF343  50.85 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.928638 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0005  hypothetical protein  50.85 
 
 
59 aa  64.3  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0864  hypothetical protein  47.46 
 
 
62 aa  63.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0049  protein of unknown function DUF343  50.85 
 
 
64 aa  61.6  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.625626  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3520  hypothetical protein  50 
 
 
55 aa  60.8  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000106635  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2231  protein of unknown function DUF343  46.15 
 
 
55 aa  59.7  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.941145  normal  0.0330687 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1284  hypothetical protein  40.68 
 
 
60 aa  58.9  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2176  protein of unknown function DUF343  50 
 
 
59 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2572  hypothetical protein  42.37 
 
 
313 aa  50.1  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.134075  normal  0.851171 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1245  methyltransferase type 11  34.48 
 
 
322 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.240532  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3215  protein of unknown function DUF343  37.88 
 
 
71 aa  48.9  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225013  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1056  protein of unknown function DUF343  44.26 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0122  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 
363 aa  46.2  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.678771  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1886  Methyltransferase type 11  40 
 
 
313 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000470548  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1597a  conserved cytosolic protein  37.29 
 
 
56 aa  41.6  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.772471  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1506  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  37.29 
 
 
62 aa  42  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225187  normal  0.166181 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0815  protein of unknown function DUF343  35.09 
 
 
58 aa  41.2  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232843  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1670  hypothetical protein  42.31 
 
 
59 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0125  hypothetical protein  32.76 
 
 
339 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>