20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0246 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0246  hypothetical protein  100 
 
 		 89 aa  179  8.000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0815  hypothetical protein  34.96 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0224  hypothetical protein  34.92 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.166196  decreased coverage  0.00859524 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1880  hypothetical protein  37.82 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0346889  normal  0.0669854 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1187  protein of unknown function DUF343  50.85 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1047  hypothetical protein  32.85 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.516502  normal  0.973248 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0227  hypothetical protein  34.31 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0863443 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2163  hypothetical protein  32.85 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2004  hypothetical protein  33.58 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.462402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1284  hypothetical protein  44.26 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0864  hypothetical protein  42.19 
 
 		 62 aa  48.5  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3215  protein of unknown function DUF343  37.14 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225013  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0049  protein of unknown function DUF343  42.19 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.625626  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3520  hypothetical protein  45.45 
 
 		 55 aa  45.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000106635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0006  hypothetical protein  44.64 
 
 		 61 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2572  hypothetical protein  35.59 
 
 		 313 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.134075  normal  0.851171 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2231  protein of unknown function DUF343  46.15 
 
 		 55 aa  42.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.941145  normal  0.0330687 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0944  protein of unknown function DUF343  35.94 
 
 		 64 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.928638 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2176  protein of unknown function DUF343  43.1 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2304  hypothetical protein  39.66 
 
 		 87 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>