24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0944 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_0944  protein of unknown function DUF343  100 
 
 
64 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.928638 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0049  protein of unknown function DUF343  78.12 
 
 
64 aa  103  7e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.625626  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2176  protein of unknown function DUF343  79.66 
 
 
59 aa  99.4  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1056  protein of unknown function DUF343  66.67 
 
 
66 aa  80.1  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0864  hypothetical protein  55 
 
 
62 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3215  protein of unknown function DUF343  60.56 
 
 
71 aa  78.2  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225013  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1284  hypothetical protein  55 
 
 
60 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2320  hypothetical protein  55.17 
 
 
58 aa  70.9  0.000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0005  hypothetical protein  55.93 
 
 
59 aa  70.5  0.000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3520  hypothetical protein  52.73 
 
 
55 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000106635  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0006  hypothetical protein  50.91 
 
 
61 aa  65.1  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0063  hypothetical protein  50.85 
 
 
59 aa  64.3  0.0000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000183566  hitchhiker  0.000563902 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2231  protein of unknown function DUF343  50.98 
 
 
55 aa  57.4  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.941145  normal  0.0330687 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1245  methyltransferase type 11  39.66 
 
 
322 aa  47.4  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.240532  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1755  methyltransferase type 11  42.11 
 
 
276 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2114  methyltransferase type 11  43.1 
 
 
276 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.420703  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0815  hypothetical protein  54.55 
 
 
123 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0122  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 
363 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.678771  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1886  Methyltransferase type 11  39.34 
 
 
313 aa  41.6  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000470548  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0246  hypothetical protein  35.94 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2700  hypothetical protein  36.21 
 
 
312 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000485808  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2509  hypothetical protein  44.83 
 
 
58 aa  40.8  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0125  hypothetical protein  36.21 
 
 
339 aa  40.4  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4167  protein of unknown function DUF343  40 
 
 
78 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.182728  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>