17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2176 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2176  protein of unknown function DUF343  100 
 
 
59 aa  116  9e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0049  protein of unknown function DUF343  81.36 
 
 
64 aa  102  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.625626  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0944  protein of unknown function DUF343  79.66 
 
 
64 aa  99.4  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.928638 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1056  protein of unknown function DUF343  72.13 
 
 
66 aa  83.6  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3215  protein of unknown function DUF343  66.67 
 
 
71 aa  80.1  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225013  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0864  hypothetical protein  54.55 
 
 
62 aa  68.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1284  hypothetical protein  49.09 
 
 
60 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2320  hypothetical protein  55.77 
 
 
58 aa  65.5  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3520  hypothetical protein  54.55 
 
 
55 aa  63.9  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000106635  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0005  hypothetical protein  53.7 
 
 
59 aa  62  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0006  hypothetical protein  55.36 
 
 
61 aa  62  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2231  protein of unknown function DUF343  52 
 
 
55 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.941145  normal  0.0330687 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0063  hypothetical protein  50 
 
 
59 aa  56.6  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000183566  hitchhiker  0.000563902 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0125  hypothetical protein  36.54 
 
 
339 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0246  hypothetical protein  43.1 
 
 
89 aa  41.6  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0466  hypothetical protein  39.22 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2509  hypothetical protein  47.27 
 
 
58 aa  40.4  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>