27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3520 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3520  hypothetical protein  100 
 
 		 55 aa  110  4.0000000000000004e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000106635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1284  hypothetical protein  66.67 
 
 		 60 aa  85.5  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0864  hypothetical protein  60 
 
 		 62 aa  74.7  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2231  protein of unknown function DUF343  58 
 
 		 55 aa  67.8  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.941145  normal  0.0330687 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0006  hypothetical protein  64 
 
 		 61 aa  68.2  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0005  hypothetical protein  55.56 
 
 		 59 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0944  protein of unknown function DUF343  52.73 
 
 		 64 aa  66.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.928638 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2320  hypothetical protein  59.62 
 
 		 58 aa  65.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0049  protein of unknown function DUF343  54.55 
 
 		 64 aa  64.7  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.625626  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2176  protein of unknown function DUF343  54.55 
 
 		 59 aa  63.9  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0063  hypothetical protein  50 
 
 		 59 aa  60.8  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000183566  hitchhiker  0.000563902 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3215  protein of unknown function DUF343  46.77 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225013  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1245  methyltransferase type 11  43.4 
 
 		 322 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.240532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1056  protein of unknown function DUF343  45.61 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0246  hypothetical protein  45.45 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  41.51 
 
 		 339 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0815  protein of unknown function DUF343  53.06 
 
 		 58 aa  45.1  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232843  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1880  hypothetical protein  55.88 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0346889  normal  0.0669854 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0466  hypothetical protein  43.14 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003985  protein ycaR  43.64 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0227  hypothetical protein  48.57 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0863443 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1467  hypothetical protein  40 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0122  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 		 363 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.678771  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2004  hypothetical protein  48.57 
 
 		 140 aa  41.2  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.462402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01537  hypothetical protein  41.82 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1047  hypothetical protein  45.71 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.516502  normal  0.973248 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2163  hypothetical protein  48.57 
 
 		 141 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>