12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1880 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1880  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  274  4e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0346889  normal  0.0669854 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0227  hypothetical protein  59.4 
 
 
140 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0863443 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2163  hypothetical protein  56.39 
 
 
141 aa  159  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2004  hypothetical protein  57.14 
 
 
140 aa  157  7e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.462402  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1047  hypothetical protein  55.64 
 
 
140 aa  155  2e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.516502  normal  0.973248 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0224  hypothetical protein  56.41 
 
 
128 aa  139  9e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.166196  decreased coverage  0.00859524 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0815  hypothetical protein  56.52 
 
 
123 aa  135  1e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1187  protein of unknown function DUF343  50.85 
 
 
129 aa  121  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0246  hypothetical protein  37.82 
 
 
89 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3520  hypothetical protein  55.88 
 
 
55 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000106635  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3215  protein of unknown function DUF343  31.68 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225013  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1284  hypothetical protein  48.48 
 
 
60 aa  40.4  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>