24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1056 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1056  protein of unknown function DUF343  100 
 
 
66 aa  129  9e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3215  protein of unknown function DUF343  71.83 
 
 
71 aa  96.3  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225013  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0049  protein of unknown function DUF343  69.7 
 
 
64 aa  92.8  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.625626  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2176  protein of unknown function DUF343  72.13 
 
 
59 aa  89.4  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0944  protein of unknown function DUF343  66.67 
 
 
64 aa  85.9  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.928638 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0864  hypothetical protein  51.61 
 
 
62 aa  65.1  0.0000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1284  hypothetical protein  48.39 
 
 
60 aa  62  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2320  hypothetical protein  51.67 
 
 
58 aa  60.5  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0006  hypothetical protein  49.12 
 
 
61 aa  55.1  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0005  hypothetical protein  49.18 
 
 
59 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0063  hypothetical protein  44.26 
 
 
59 aa  54.7  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000183566  hitchhiker  0.000563902 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3520  hypothetical protein  46.43 
 
 
55 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000106635  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2231  protein of unknown function DUF343  47.17 
 
 
55 aa  50.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.941145  normal  0.0330687 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1755  methyltransferase type 11  48.28 
 
 
276 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2114  methyltransferase type 11  46.55 
 
 
276 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.420703  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0125  hypothetical protein  40 
 
 
339 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0246  hypothetical protein  37.5 
 
 
89 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2700  hypothetical protein  39.66 
 
 
312 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000485808  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2509  hypothetical protein  45 
 
 
58 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2572  hypothetical protein  43.55 
 
 
313 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.134075  normal  0.851171 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2153  hypothetical protein  37.5 
 
 
65 aa  40.4  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.286356  normal  0.313374 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0075  hypothetical protein  40.68 
 
 
66 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1506  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  36.92 
 
 
62 aa  40.4  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225187  normal  0.166181 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4167  protein of unknown function DUF343  40.38 
 
 
78 aa  40  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.182728  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>