12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0815 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0815  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  249  6e-66  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1880  hypothetical protein  56.52 
 
 
133 aa  135  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0346889  normal  0.0669854 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2163  hypothetical protein  49.24 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0227  hypothetical protein  50.76 
 
 
140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0863443 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2004  hypothetical protein  48.48 
 
 
140 aa  124  3e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.462402  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0224  hypothetical protein  50.81 
 
 
128 aa  124  6e-28  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.166196  decreased coverage  0.00859524 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1047  hypothetical protein  45.45 
 
 
140 aa  121  3e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.516502  normal  0.973248 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1187  protein of unknown function DUF343  49.19 
 
 
129 aa  120  5e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0246  hypothetical protein  34.96 
 
 
89 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0944  protein of unknown function DUF343  54.55 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.928638 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3215  protein of unknown function DUF343  34.74 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225013  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0049  protein of unknown function DUF343  54.84 
 
 
64 aa  40.4  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.625626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>