192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3207 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3207  hypothetical protein  100 
 
 		 58 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232767  normal  0.26354 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2088  hypothetical protein  67.24 
 
 		 60 aa  87  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000436005  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2677  hypothetical protein  62.26 
 
 		 59 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1027  hypothetical protein  65.52 
 
 		 61 aa  77  0.00000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00107826  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2531  hypothetical protein  64.91 
 
 		 62 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0793629 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1506  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  58.93 
 
 		 62 aa  76.3  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225187  normal  0.166181 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1374  protein of unknown function DUF343  64.81 
 
 		 64 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.379618  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2808  protein of unknown function DUF343  64.91 
 
 		 62 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0765  hypothetical protein  66.67 
 
 		 67 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3197  protein of unknown function DUF343  66.67 
 
 		 67 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.333049 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2402  protein of unknown function DUF343  64.91 
 
 		 62 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0537  hypothetical protein  66.67 
 
 		 67 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5877  hypothetical protein  66.67 
 
 		 64 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140063  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0750  hypothetical protein  64.91 
 
 		 64 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112207  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2594  hypothetical protein  66.67 
 
 		 67 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129771  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2464  hypothetical protein  66.67 
 
 		 67 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3214  protein of unknown function DUF343  62.5 
 
 		 63 aa  75.5  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2274  hypothetical protein  66.67 
 
 		 68 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00194763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1082  tetraacyldisaccharide-1-P 4-kinase  66.67 
 
 		 68 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00991384  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0741  hypothetical protein  64.91 
 
 		 68 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0534  hypothetical protein  67.31 
 
 		 69 aa  75.1  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  hitchhiker  0.00000763093 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1934  hypothetical protein  64.91 
 
 		 64 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2546  hypothetical protein  64.91 
 
 		 64 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0641671  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0570  hypothetical protein  66.67 
 
 		 68 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1047  hypothetical protein  66.67 
 
 		 68 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000350171  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2570  hypothetical protein  64.91 
 
 		 64 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522503  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0926  hypothetical protein  66.67 
 
 		 68 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0134205  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0929  hypothetical protein  66.67 
 
 		 68 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2152  hypothetical protein  66.67 
 
 		 68 aa  74.7  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0445417  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0592  hypothetical protein  67.31 
 
 		 67 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000872604  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0283  hypothetical protein  62.5 
 
 		 60 aa  74.3  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0910  hypothetical protein  64.29 
 
 		 59 aa  74.3  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0634  hypothetical protein  62.96 
 
 		 70 aa  73.6  0.0000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.797017  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0311  protein of unknown function DUF343  60.71 
 
 		 59 aa  72.4  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0993  hypothetical protein  55.36 
 
 		 60 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.638813  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1052  hypothetical protein  55.36 
 
 		 60 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.202264 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1020  hypothetical protein  55.36 
 
 		 60 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.678169 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1101  hypothetical protein  55.36 
 
 		 60 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1085  hypothetical protein  55.36 
 
 		 60 aa  72.4  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.1669  normal  0.234765 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2486  hypothetical protein  64.15 
 
 		 65 aa  72  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0551102  normal  0.879206 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0959  hypothetical protein  60.71 
 
 		 67 aa  72  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2556  hypothetical protein  62.26 
 
 		 67 aa  71.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131307 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1922  hypothetical protein  53.7 
 
 		 60 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.504408  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00921  hypothetical protein  57.14 
 
 		 60 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0400201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2726  protein of unknown function DUF343  57.14 
 
 		 60 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1015  hypothetical protein  57.14 
 
 		 60 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00271663  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2679  hypothetical protein  57.14 
 
 		 60 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.10182  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1078  hypothetical protein  57.14 
 
 		 60 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00247062  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2407  hypothetical protein  57.14 
 
 		 60 aa  71.2  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.025157  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2203  hypothetical protein  57.14 
 
 		 60 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.082443  normal  0.29986 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1024  hypothetical protein  57.14 
 
 		 60 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0234361  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00928  hypothetical protein  57.14 
 
 		 60 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3844  hypothetical protein  58.93 
 
 		 61 aa  70.5  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4174  hypothetical protein  58.93 
 
 		 61 aa  70.5  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.172558  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0595  protein of unknown function DUF343  59.26 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3156  hypothetical protein  51.85 
 
 		 60 aa  69.3  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.733102  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1615  hypothetical protein  58.93 
 
 		 61 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.822901  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14770  hypothetical protein  60.71 
 
 		 61 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2043  protein of unknown function DUF343  55.36 
 
 		 60 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1718  hypothetical protein  55.36 
 
 		 60 aa  67.8  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0266  hypothetical protein  62.26 
 
 		 66 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.127662  normal  0.479749 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0837  hypothetical protein  58.49 
 
 		 68 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00693289 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4893  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  51.85 
 
 		 430 aa  68.2  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1901  hypothetical protein  58.93 
 
 		 61 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000321593 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1477  hypothetical protein  58.93 
 
 		 61 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1436  hypothetical protein  53.57 
 
 		 60 aa  67.8  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3813  hypothetical protein  58.93 
 
 		 61 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0446374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1512  hypothetical protein  58.93 
 
 		 61 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0270  protein of unknown function DUF343  60.38 
 
 		 65 aa  67  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2572  hypothetical protein  55.36 
 
 		 60 aa  67  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1964  hypothetical protein  55.36 
 
 		 60 aa  67  0.00000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2661  hypothetical protein  55.36 
 
 		 60 aa  67  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.654159  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1771  hypothetical protein  53.57 
 
 		 60 aa  67  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1895  hypothetical protein  64.71 
 
 		 59 aa  66.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2210  protein of unknown function DUF343  57.41 
 
 		 68 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.451812  normal  0.154545 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0454  hypothetical protein  58.49 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0661253  normal  0.0911594 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1613  protein of unknown function DUF343  55.56 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003985  protein ycaR  51.79 
 
 		 59 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0487  hypothetical protein  56.6 
 
 		 66 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  hitchhiker  0.000621039 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2206  protein of unknown function DUF343  53.57 
 
 		 60 aa  66.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0300  hypothetical protein  56.6 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222502 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2127  hypothetical protein  48.21 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0473913  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2212  hypothetical protein  56.6 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106103  normal  0.265266 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0294  hypothetical protein  58.49 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0307109 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01537  hypothetical protein  51.79 
 
 		 59 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2253  hypothetical protein  57.41 
 
 		 68 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.160718 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2528  protein of unknown function DUF343  57.41 
 
 		 68 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2153  hypothetical protein  53.57 
 
 		 65 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.286356  normal  0.313374 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1467  hypothetical protein  51.79 
 
 		 59 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2800  hypothetical protein  53.7 
 
 		 59 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1884  hypothetical protein  64.71 
 
 		 59 aa  65.5  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2950  hypothetical protein  48.15 
 
 		 60 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1726  protein of unknown function DUF343  58.49 
 
 		 72 aa  65.5  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0316795  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0131  hypothetical protein  58.49 
 
 		 56 aa  64.7  0.0000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0194  hypothetical protein  58.49 
 
 		 59 aa  64.7  0.0000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2307  protein of unknown function DUF343  53.57 
 
 		 60 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.858072  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3569  hypothetical protein  51.79 
 
 		 60 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0331586  hitchhiker  0.00582787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1553  protein of unknown function DUF343  48.15 
 
 		 60 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331555  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2672  protein of unknown function DUF343  51.85 
 
 		 59 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0296171  normal  0.0260721 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1707  hypothetical protein  51.85 
 
 		 59 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.502492  normal  0.508919 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>