182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2556 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2556  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  135  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00131307 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2486  hypothetical protein  74.19 
 
 		 65 aa  102  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0551102  normal  0.879206 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0765  hypothetical protein  56.06 
 
 		 67 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0537  hypothetical protein  56.06 
 
 		 67 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3197  protein of unknown function DUF343  56.06 
 
 		 67 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.333049 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1027  hypothetical protein  64.15 
 
 		 61 aa  79  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00107826  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5877  hypothetical protein  56.25 
 
 		 64 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140063  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0750  hypothetical protein  53.73 
 
 		 64 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112207  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2594  hypothetical protein  56.25 
 
 		 67 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129771  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2464  hypothetical protein  56.25 
 
 		 67 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3214  protein of unknown function DUF343  66.04 
 
 		 63 aa  78.6  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2808  protein of unknown function DUF343  56.25 
 
 		 62 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2402  protein of unknown function DUF343  56.25 
 
 		 62 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0741  hypothetical protein  56.25 
 
 		 68 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1934  hypothetical protein  54.69 
 
 		 64 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2546  hypothetical protein  54.69 
 
 		 64 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0641671  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2570  hypothetical protein  54.69 
 
 		 64 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522503  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0926  hypothetical protein  56.25 
 
 		 68 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0134205  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2531  hypothetical protein  56.25 
 
 		 62 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0793629 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2274  hypothetical protein  56.25 
 
 		 68 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00194763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1082  tetraacyldisaccharide-1-P 4-kinase  56.25 
 
 		 68 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00991384  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0534  hypothetical protein  56.72 
 
 		 69 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  hitchhiker  0.00000763093 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0570  hypothetical protein  56.25 
 
 		 68 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1047  hypothetical protein  56.25 
 
 		 68 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000350171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0929  hypothetical protein  56.25 
 
 		 68 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2152  hypothetical protein  56.25 
 
 		 68 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0445417  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0592  hypothetical protein  63.46 
 
 		 67 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000872604  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14770  hypothetical protein  61.11 
 
 		 61 aa  75.1  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2950  hypothetical protein  54.72 
 
 		 60 aa  73.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.776204 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0283  hypothetical protein  64.15 
 
 		 60 aa  73.6  0.0000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1374  protein of unknown function DUF343  58.49 
 
 		 64 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.379618  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3156  hypothetical protein  52.83 
 
 		 60 aa  72.8  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.733102  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1922  hypothetical protein  56.6 
 
 		 60 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.504408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2088  hypothetical protein  54.1 
 
 		 60 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000436005  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3207  hypothetical protein  62.26 
 
 		 58 aa  71.6  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232767  normal  0.26354 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1297  acetoacetyl-CoA reductase  55 
 
 		 63 aa  72  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.199005  decreased coverage  0.00515811 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1101  hypothetical protein  48.33 
 
 		 60 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003985  protein ycaR  52.83 
 
 		 59 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0993  hypothetical protein  46.67 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.638813  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1052  hypothetical protein  46.67 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.202264 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1085  hypothetical protein  46.67 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.1669  normal  0.234765 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1020  hypothetical protein  46.67 
 
 		 60 aa  70.5  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.678169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1553  protein of unknown function DUF343  52.83 
 
 		 60 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331555  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3569  hypothetical protein  52.54 
 
 		 60 aa  70.1  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0331586  hitchhiker  0.00582787 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2306  hypothetical protein  52.83 
 
 		 60 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190908  normal  0.12744 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1436  hypothetical protein  51.61 
 
 		 60 aa  70.1  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1884  hypothetical protein  62.26 
 
 		 59 aa  69.7  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2677  hypothetical protein  57.41 
 
 		 59 aa  70.1  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2420  hypothetical protein  49.09 
 
 		 59 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2490  hypothetical protein  49.09 
 
 		 59 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0932206  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2582  hypothetical protein  49.09 
 
 		 59 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.125481 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2563  hypothetical protein  54.72 
 
 		 60 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0238405  hitchhiker  0.00461164 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4893  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  54.72 
 
 		 430 aa  69.7  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1821  hypothetical protein  49.09 
 
 		 58 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.135378  normal  0.937182 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1467  hypothetical protein  54.72 
 
 		 59 aa  70.1  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4097  protein of unknown function DUF343  56.36 
 
 		 62 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01537  hypothetical protein  52.83 
 
 		 59 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00921  hypothetical protein  46.67 
 
 		 60 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0400201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2726  protein of unknown function DUF343  46.67 
 
 		 60 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1015  hypothetical protein  46.67 
 
 		 60 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00271663  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0634  hypothetical protein  58.49 
 
 		 70 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.797017  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0891  hypothetical protein  54.55 
 
 		 64 aa  68.9  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.883095  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3844  hypothetical protein  56.6 
 
 		 61 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2679  hypothetical protein  46.67 
 
 		 60 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.10182  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1078  hypothetical protein  46.67 
 
 		 60 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00247062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4174  hypothetical protein  58.49 
 
 		 61 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.172558  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0311  protein of unknown function DUF343  60.38 
 
 		 59 aa  68.9  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1024  hypothetical protein  46.67 
 
 		 60 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0234361  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2407  hypothetical protein  46.67 
 
 		 60 aa  69.3  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.025157  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2206  protein of unknown function DUF343  52.83 
 
 		 60 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2203  hypothetical protein  46.67 
 
 		 60 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.082443  normal  0.29986 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0835  hypothetical protein  54.55 
 
 		 64 aa  69.3  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.137665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00928  hypothetical protein  46.67 
 
 		 60 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3773  protein of unknown function DUF343  56.36 
 
 		 62 aa  68.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540183  normal  0.541189 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2210  protein of unknown function DUF343  52.73 
 
 		 68 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.451812  normal  0.154545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2253  hypothetical protein  52.73 
 
 		 68 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.160718 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1707  hypothetical protein  52 
 
 		 59 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.502492  normal  0.508919 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2640  protein of unknown function DUF343  52.83 
 
 		 60 aa  68.2  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2672  protein of unknown function DUF343  52 
 
 		 59 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0296171  normal  0.0260721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2528  protein of unknown function DUF343  52.73 
 
 		 68 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2212  hypothetical protein  52.73 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106103  normal  0.265266 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1685  hypothetical protein  52 
 
 		 59 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1895  hypothetical protein  60.38 
 
 		 59 aa  67.8  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0959  hypothetical protein  54.72 
 
 		 67 aa  67.8  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0300  hypothetical protein  50.94 
 
 		 65 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.222502 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1964  hypothetical protein  51.67 
 
 		 60 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2661  hypothetical protein  51.67 
 
 		 60 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.654159  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1339  hypothetical protein  45.76 
 
 		 61 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.736823 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1559  hypothetical protein  47.27 
 
 		 59 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.730399  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1670  hypothetical protein  52 
 
 		 59 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2572  hypothetical protein  51.67 
 
 		 60 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1640  hypothetical protein  45.61 
 
 		 59 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2800  hypothetical protein  52 
 
 		 59 aa  67  0.00000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0595  protein of unknown function DUF343  50.85 
 
 		 64 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25520  hypothetical protein  57.41 
 
 		 61 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3047  hypothetical protein  52.73 
 
 		 62 aa  67  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2127  hypothetical protein  51.85 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0473913  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1512  hypothetical protein  56.6 
 
 		 61 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1718  hypothetical protein  50.94 
 
 		 60 aa  66.2  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3813  hypothetical protein  56.6 
 
 		 61 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0446374  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>