193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1426 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1426  hypothetical protein  100 
 
 
56 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.425865  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2509  hypothetical protein  63.64 
 
 
58 aa  61.6  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4062  protein of unknown function DUF343  60.71 
 
 
58 aa  62  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167292  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0283  hypothetical protein  58.82 
 
 
60 aa  61.6  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1506  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  56.86 
 
 
62 aa  61.2  0.000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225187  normal  0.166181 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2212  hypothetical protein  56.6 
 
 
140 aa  60.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.106103  normal  0.265266 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0311  protein of unknown function DUF343  58.82 
 
 
59 aa  60.1  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2677  hypothetical protein  55.77 
 
 
59 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2939  hypothetical protein  54.72 
 
 
63 aa  59.7  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0300  hypothetical protein  52.73 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.222502 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3207  hypothetical protein  55.77 
 
 
58 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232767  normal  0.26354 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0454  hypothetical protein  51.85 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0661253  normal  0.0911594 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0294  hypothetical protein  51.85 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0307109 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0757  hypothetical protein  57.14 
 
 
57 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154426  normal  0.127771 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2088  hypothetical protein  57.69 
 
 
60 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000436005  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0075  hypothetical protein  56.86 
 
 
66 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0456158 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3759  protein of unknown function DUF343  60 
 
 
58 aa  57  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.075008  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2570  hypothetical protein  59.62 
 
 
64 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522503  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1934  hypothetical protein  59.62 
 
 
64 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2546  hypothetical protein  59.62 
 
 
64 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0641671  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0837  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  57  0.00000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00693289 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2304  hypothetical protein  53.85 
 
 
87 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1388  hypothetical protein  55.36 
 
 
57 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341245 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0537  hypothetical protein  57.69 
 
 
67 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199917  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2274  hypothetical protein  59.62 
 
 
68 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00194763  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1895  hypothetical protein  53.06 
 
 
59 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1884  hypothetical protein  53.06 
 
 
59 aa  56.6  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1082  tetraacyldisaccharide-1-P 4-kinase  59.62 
 
 
68 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00991384  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0741  hypothetical protein  59.62 
 
 
68 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0266  hypothetical protein  50 
 
 
66 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.127662  normal  0.479749 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0765  hypothetical protein  57.69 
 
 
67 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3197  protein of unknown function DUF343  57.69 
 
 
67 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.333049 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2594  hypothetical protein  57.69 
 
 
67 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129771  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0910  hypothetical protein  53.85 
 
 
59 aa  56.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0570  hypothetical protein  59.62 
 
 
68 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2464  hypothetical protein  57.69 
 
 
67 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142603 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1047  hypothetical protein  59.62 
 
 
68 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000350171  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0926  hypothetical protein  59.62 
 
 
68 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0134205  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0929  hypothetical protein  59.62 
 
 
68 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2152  hypothetical protein  59.62 
 
 
68 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0445417  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1863  protein of unknown function DUF343  50.91 
 
 
69 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945421 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2125  hypothetical protein  55.77 
 
 
61 aa  56.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.665009  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0270  protein of unknown function DUF343  50.94 
 
 
65 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0592  hypothetical protein  55.77 
 
 
67 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000872604  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4174  hypothetical protein  52.94 
 
 
61 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.172558  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5877  hypothetical protein  57.69 
 
 
64 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140063  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3220  protein of unknown function DUF343  52 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2528  protein of unknown function DUF343  47.37 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0534  hypothetical protein  55.77 
 
 
69 aa  55.8  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  hitchhiker  0.00000763093 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0256  hypothetical protein  56 
 
 
54 aa  55.5  0.0000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0280343  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2253  hypothetical protein  47.37 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.160718 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2210  protein of unknown function DUF343  47.37 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.451812  normal  0.154545 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2731  hypothetical protein  52.83 
 
 
85 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.923353  normal  0.0512047 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0750  hypothetical protein  55.77 
 
 
64 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112207  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3665  hypothetical protein  51.85 
 
 
61 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3047  hypothetical protein  49.12 
 
 
62 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3844  hypothetical protein  50.98 
 
 
61 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1613  protein of unknown function DUF343  52.83 
 
 
66 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0466  hypothetical protein  47.69 
 
 
77 aa  55.1  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0487  hypothetical protein  52.83 
 
 
66 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  hitchhiker  0.000621039 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2531  hypothetical protein  55.77 
 
 
62 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0793629 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1310  hypothetical protein  49.06 
 
 
70 aa  54.7  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404019  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2808  protein of unknown function DUF343  55.77 
 
 
62 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106746  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2402  protein of unknown function DUF343  55.77 
 
 
62 aa  54.3  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213254  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1615  hypothetical protein  52.94 
 
 
61 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.822901  normal  0.149006 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1027  hypothetical protein  53.85 
 
 
61 aa  53.9  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00107826  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3635  hypothetical protein  47.17 
 
 
57 aa  53.9  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.566085  normal  0.472948 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3214  protein of unknown function DUF343  56.86 
 
 
63 aa  53.9  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4893  tetraacyldisaccharide 4'-kinase  49.09 
 
 
430 aa  53.5  0.0000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.353495 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0718  protein of unknown function DUF343  46.15 
 
 
67 aa  53.5  0.0000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.021704  normal  0.638292 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0959  hypothetical protein  45.1 
 
 
67 aa  53.5  0.0000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1901  hypothetical protein  50.98 
 
 
61 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000321593 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0634  hypothetical protein  55.77 
 
 
70 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.797017  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1771  hypothetical protein  53.85 
 
 
60 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2346  hypothetical protein  51.92 
 
 
62 aa  52.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2608  hypothetical protein  52.94 
 
 
56 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0375272  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2252  protein of unknown function DUF343  50.98 
 
 
63 aa  53.1  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.938306 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2789  protein of unknown function DUF343  52.94 
 
 
56 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4243  hypothetical protein  52.63 
 
 
62 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1477  hypothetical protein  50.98 
 
 
61 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165354  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14770  hypothetical protein  49.02 
 
 
61 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0083  hypothetical protein  49.06 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2181  hypothetical protein  52.94 
 
 
61 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2043  protein of unknown function DUF343  53.85 
 
 
60 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1512  hypothetical protein  50.98 
 
 
61 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3227  hypothetical protein  50 
 
 
56 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3813  hypothetical protein  50.98 
 
 
61 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0446374  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2694  protein of unknown function DUF343  52.94 
 
 
56 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1553  protein of unknown function DUF343  52.94 
 
 
60 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331555  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3270  hypothetical protein  47.17 
 
 
71 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.731056  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2307  protein of unknown function DUF343  54.9 
 
 
60 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.858072  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25520  hypothetical protein  52.94 
 
 
61 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1718  hypothetical protein  54.9 
 
 
60 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2306  hypothetical protein  52.94 
 
 
60 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190908  normal  0.12744 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4297  protein of unknown function DUF343  47.27 
 
 
73 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.925532  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4097  protein of unknown function DUF343  49.06 
 
 
62 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3093  hypothetical protein  46.15 
 
 
70 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2647  protein of unknown function DUF343  48.08 
 
 
66 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5857  hypothetical protein  50 
 
 
66 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.768237  normal  0.140959 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3773  protein of unknown function DUF343  49.06 
 
 
62 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540183  normal  0.541189 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>