181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0488 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0488  protein of unknown function DUF343  100 
 
 
61 aa  117  6e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3635  hypothetical protein  62.26 
 
 
57 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.566085  normal  0.472948 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0718  protein of unknown function DUF343  48.21 
 
 
67 aa  61.2  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.021704  normal  0.638292 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1914  hypothetical protein  50.91 
 
 
58 aa  60.8  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.354879  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2608  hypothetical protein  47.17 
 
 
56 aa  60.1  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0375272  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3220  protein of unknown function DUF343  50 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2789  protein of unknown function DUF343  47.17 
 
 
56 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1262  hypothetical protein  49.09 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2694  protein of unknown function DUF343  45.28 
 
 
56 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2677  hypothetical protein  48.15 
 
 
59 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3093  hypothetical protein  44.64 
 
 
70 aa  58.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0815  protein of unknown function DUF343  58.49 
 
 
58 aa  58.5  0.00000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232843  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2304  hypothetical protein  44.64 
 
 
87 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0650  protein of unknown function DUF343  45.45 
 
 
60 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0490  hypothetical protein  45.45 
 
 
60 aa  57.8  0.00000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.768534  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4062  protein of unknown function DUF343  48.08 
 
 
58 aa  57  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167292  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2346  hypothetical protein  38.98 
 
 
62 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2672  protein of unknown function DUF343  50.88 
 
 
59 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0296171  normal  0.0260721 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1685  hypothetical protein  50.88 
 
 
59 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1559  hypothetical protein  49.12 
 
 
59 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.730399  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1707  hypothetical protein  50.88 
 
 
59 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.502492  normal  0.508919 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2647  protein of unknown function DUF343  42.86 
 
 
66 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1670  hypothetical protein  50.88 
 
 
59 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2575  hypothetical protein  43.4 
 
 
70 aa  55.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.745341  normal  0.0666419 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2420  hypothetical protein  49.12 
 
 
59 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2490  hypothetical protein  49.12 
 
 
59 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0932206  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2582  hypothetical protein  49.12 
 
 
59 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.125481 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2800  hypothetical protein  49.12 
 
 
59 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0910  hypothetical protein  41.82 
 
 
59 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0283  hypothetical protein  44.44 
 
 
60 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0634  hypothetical protein  44.83 
 
 
70 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.797017  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1339  hypothetical protein  47.27 
 
 
61 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.736823 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1640  hypothetical protein  47.27 
 
 
59 aa  52.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1772  hypothetical protein  49.09 
 
 
57 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1506  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  41.18 
 
 
62 aa  51.6  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225187  normal  0.166181 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1726  protein of unknown function DUF343  41.82 
 
 
72 aa  51.2  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0316795  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0657  hypothetical protein  41.67 
 
 
65 aa  51.2  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.255489  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0487  hypothetical protein  43.64 
 
 
66 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  hitchhiker  0.000621039 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3207  hypothetical protein  43.4 
 
 
58 aa  50.4  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232767  normal  0.26354 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1588  hypothetical protein  40.74 
 
 
71 aa  50.1  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.412057  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0311  protein of unknown function DUF343  43.4 
 
 
59 aa  49.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0837  hypothetical protein  43.4 
 
 
68 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00693289 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3227  hypothetical protein  45.1 
 
 
56 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4097  protein of unknown function DUF343  40 
 
 
62 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1597a  conserved cytosolic protein  43.64 
 
 
56 aa  50.1  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.772471  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1613  protein of unknown function DUF343  43.4 
 
 
66 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2127  hypothetical protein  42.59 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0473913  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7603  protein of unknown function DUF343  44.44 
 
 
57 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.737133 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2570  hypothetical protein  45.1 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522503  normal  0.285708 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2197  hypothetical protein  44.44 
 
 
56 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1934  hypothetical protein  45.1 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.109309  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2206  protein of unknown function DUF343  41.51 
 
 
60 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2546  hypothetical protein  45.1 
 
 
64 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0641671  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3773  protein of unknown function DUF343  40 
 
 
62 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.540183  normal  0.541189 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2563  hypothetical protein  34.55 
 
 
60 aa  48.5  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0238405  hitchhiker  0.00461164 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1821  hypothetical protein  45.45 
 
 
58 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.135378  normal  0.937182 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1467  hypothetical protein  42.59 
 
 
59 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5877  hypothetical protein  43.14 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140063  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2464  hypothetical protein  43.14 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142603 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2088  hypothetical protein  41.51 
 
 
60 aa  48.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000436005  normal  0.437749 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1374  protein of unknown function DUF343  40 
 
 
64 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.379618  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2386  hypothetical protein  47.17 
 
 
58 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2594  hypothetical protein  43.14 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129771  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0537  hypothetical protein  43.14 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199917  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1863  protein of unknown function DUF343  40 
 
 
69 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945421 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3197  protein of unknown function DUF343  43.14 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.333049 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0741  hypothetical protein  41.18 
 
 
68 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0765  hypothetical protein  43.14 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1101  hypothetical protein  43.4 
 
 
60 aa  47.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0750  hypothetical protein  41.18 
 
 
64 aa  47.8  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112207  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003985  protein ycaR  42.59 
 
 
59 aa  47.8  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2274  hypothetical protein  41.18 
 
 
68 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00194763  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1082  tetraacyldisaccharide-1-P 4-kinase  41.18 
 
 
68 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00991384  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0757  hypothetical protein  43.4 
 
 
57 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154426  normal  0.127771 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0570  hypothetical protein  41.18 
 
 
68 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1047  hypothetical protein  41.18 
 
 
68 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000350171  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0926  hypothetical protein  41.18 
 
 
68 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0134205  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0929  hypothetical protein  41.18 
 
 
68 aa  47.4  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2152  hypothetical protein  41.18 
 
 
68 aa  47.4  0.00007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0445417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1388  hypothetical protein  45.28 
 
 
57 aa  47.4  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341245 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2486  hypothetical protein  34.55 
 
 
65 aa  47.4  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0551102  normal  0.879206 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01537  hypothetical protein  43.4 
 
 
59 aa  47  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1027  hypothetical protein  39.34 
 
 
61 aa  47  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00107826  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1426  hypothetical protein  47.06 
 
 
56 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.425865  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0270  protein of unknown function DUF343  41.51 
 
 
65 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.57933  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01858  hypothetical protein  39.62 
 
 
64 aa  47  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126062  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2726  protein of unknown function DUF343  43.4 
 
 
60 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2679  hypothetical protein  43.4 
 
 
60 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.10182  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1895  hypothetical protein  43.86 
 
 
59 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1884  hypothetical protein  43.86 
 
 
59 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2731  hypothetical protein  41.82 
 
 
85 aa  46.2  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.923353  normal  0.0512047 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1085  hypothetical protein  41.51 
 
 
60 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.1669  normal  0.234765 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0083  hypothetical protein  41.18 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2252  protein of unknown function DUF343  37.04 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.938306 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1745  protein of unknown function DUF343  47.17 
 
 
73 aa  47  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1078  hypothetical protein  43.4 
 
 
60 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00247062  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00928  hypothetical protein  43.4 
 
 
60 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1015  hypothetical protein  43.4 
 
 
60 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00271663  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1553  protein of unknown function DUF343  34.55 
 
 
60 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331555  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1024  hypothetical protein  43.4 
 
 
60 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0234361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>