196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0650 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_0490  hypothetical protein  100 
 
 		 60 aa  120  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.768534  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0650  protein of unknown function DUF343  100 
 
 		 60 aa  120  8e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0718  protein of unknown function DUF343  55 
 
 		 67 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.021704  normal  0.638292 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3635  hypothetical protein  53.57 
 
 		 57 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.566085  normal  0.472948 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1262  hypothetical protein  50.88 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3093  hypothetical protein  46.3 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2257  hypothetical protein  44.83 
 
 		 58 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.523879  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3220  protein of unknown function DUF343  53.7 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3227  hypothetical protein  52.83 
 
 		 56 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2304  hypothetical protein  49.09 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2647  protein of unknown function DUF343  44.64 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4062  protein of unknown function DUF343  51.85 
 
 		 58 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.167292  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0311  protein of unknown function DUF343  54.9 
 
 		 59 aa  58.2  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0488  protein of unknown function DUF343  45.45 
 
 		 61 aa  57.8  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2824  hypothetical protein  46.67 
 
 		 60 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0741259 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3207  hypothetical protein  52.94 
 
 		 58 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00232767  normal  0.26354 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2346  hypothetical protein  49.06 
 
 		 62 aa  57  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1914  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.354879  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0757  hypothetical protein  52.73 
 
 		 57 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154426  normal  0.127771 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0283  hypothetical protein  50.98 
 
 		 60 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2677  hypothetical protein  50 
 
 		 59 aa  55.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.270272  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1821  hypothetical protein  47.37 
 
 		 58 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.135378  normal  0.937182 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0194  hypothetical protein  43.64 
 
 		 59 aa  55.5  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3270  hypothetical protein  49.15 
 
 		 71 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.731056  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0910  hypothetical protein  46.3 
 
 		 59 aa  56.2  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1310  hypothetical protein  41.38 
 
 		 70 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.404019  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2572  hypothetical protein  50 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1101  hypothetical protein  49.02 
 
 		 60 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1964  hypothetical protein  50 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.494406 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2661  hypothetical protein  50 
 
 		 60 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.654159  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1388  hypothetical protein  52.73 
 
 		 57 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341245 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1020  hypothetical protein  49.02 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.678169 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0131  hypothetical protein  46.3 
 
 		 56 aa  55.1  0.0000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1506  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  49.02 
 
 		 62 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.225187  normal  0.166181 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1772  hypothetical protein  48.15 
 
 		 57 aa  55.1  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2731  hypothetical protein  50.91 
 
 		 85 aa  55.5  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.923353  normal  0.0512047 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1085  hypothetical protein  49.02 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.1669  normal  0.234765 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0993  hypothetical protein  49.02 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.638813  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1052  hypothetical protein  49.02 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.202264 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00921  hypothetical protein  49.02 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0400201  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2726  protein of unknown function DUF343  49.02 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.334861  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00928  hypothetical protein  49.02 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1024  hypothetical protein  49.02 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0234361  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2203  hypothetical protein  49.02 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.082443  normal  0.29986 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2608  hypothetical protein  48.15 
 
 		 56 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0375272  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1015  hypothetical protein  49.02 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00271663  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1718  hypothetical protein  50.98 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2640  protein of unknown function DUF343  46.43 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.946245  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2679  hypothetical protein  49.02 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.10182  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0595  protein of unknown function DUF343  48.21 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0606808 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2407  hypothetical protein  49.02 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.025157  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2789  protein of unknown function DUF343  48.15 
 
 		 56 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1078  hypothetical protein  49.02 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00247062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2575  hypothetical protein  45 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.745341  normal  0.0666419 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2694  protein of unknown function DUF343  48.15 
 
 		 56 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2808  protein of unknown function DUF343  52.94 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2402  protein of unknown function DUF343  52.94 
 
 		 62 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4174  hypothetical protein  50.98 
 
 		 61 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.172558  normal  0.492888 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1613  protein of unknown function DUF343  49.09 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1863  protein of unknown function DUF343  45.45 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.945421 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2531  hypothetical protein  52.94 
 
 		 62 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0793629 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2509  hypothetical protein  50 
 
 		 58 aa  53.9  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1553  protein of unknown function DUF343  48.21 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.331555  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2306  hypothetical protein  48.21 
 
 		 60 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.190908  normal  0.12744 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0634  hypothetical protein  52.94 
 
 		 70 aa  53.5  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.797017  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0837  hypothetical protein  45.45 
 
 		 68 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00693289 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0454  hypothetical protein  48.08 
 
 		 65 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0661253  normal  0.0911594 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2420  hypothetical protein  47.37 
 
 		 59 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2490  hypothetical protein  47.37 
 
 		 59 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0932206  normal  0.179823 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2582  hypothetical protein  47.37 
 
 		 59 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.125481 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1339  hypothetical protein  41.67 
 
 		 61 aa  53.5  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.736823 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1901  hypothetical protein  47.27 
 
 		 61 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000321593 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3844  hypothetical protein  49.02 
 
 		 61 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0592  hypothetical protein  52.94 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000872604  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3197  protein of unknown function DUF343  52.94 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.333049 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0741  hypothetical protein  52.94 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0294  hypothetical protein  48.08 
 
 		 65 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0307109 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3156  hypothetical protein  42.86 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.733102  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0266  hypothetical protein  48.08 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.127662  normal  0.479749 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0487  hypothetical protein  50 
 
 		 66 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  hitchhiker  0.000621039 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0765  hypothetical protein  52.94 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0534  hypothetical protein  52.94 
 
 		 69 aa  53.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  hitchhiker  0.00000763093 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2464  hypothetical protein  52.94 
 
 		 67 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142603 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2594  hypothetical protein  52.94 
 
 		 67 aa  52.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129771  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1771  hypothetical protein  49.02 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1512  hypothetical protein  47.27 
 
 		 61 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0537  hypothetical protein  52.94 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.199917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2043  protein of unknown function DUF343  49.02 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1477  hypothetical protein  47.27 
 
 		 61 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.165354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2206  protein of unknown function DUF343  50.98 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1436  hypothetical protein  49.02 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1467  hypothetical protein  52.94 
 
 		 59 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3813  hypothetical protein  47.27 
 
 		 61 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0446374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0750  hypothetical protein  50.98 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.112207  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1082  tetraacyldisaccharide-1-P 4-kinase  52.94 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00991384  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5877  hypothetical protein  52.94 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.140063  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2307  protein of unknown function DUF343  50.98 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.858072  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2152  hypothetical protein  52.94 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0445417  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1640  hypothetical protein  41.38 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1559  hypothetical protein  45.61 
 
 		 59 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.730399  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>