79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2699 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2699  Rad3-related DNA helicase-like protein  100 
 
 		 766 aa  1526    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.59552  normal  0.502063 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1037  CRISPR-associated DEAD/DEAH-box helicase Csf4  27.78 
 
 		 769 aa  163  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4354  DEAD/DEAH box helicase-like  26.55 
 
 		 813 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2535  helicase C2  23.87 
 
 		 645 aa  63.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2094  helicase c2  27.43 
 
 		 673 aa  60.1  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.239782  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1197  helicase c2  27.65 
 
 		 661 aa  58.5  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000973223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2178  ATP-dependent DNA helicase DinG  24.52 
 
 		 686 aa  56.6  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0897  helicase c2  25.49 
 
 		 647 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0916  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  27.71 
 
 		 954 aa  56.2  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0648  helicase c2  25.47 
 
 		 668 aa  55.8  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3029  DnaQ family exonuclease/DinG family helicase  31.76 
 
 		 929 aa  55.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1990  ATP-dependent helicase DinG  26.9 
 
 		 709 aa  55.1  0.000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0636  helicase c2  25.05 
 
 		 660 aa  54.7  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1575  putative ATP-dependent helicase  23.55 
 
 		 646 aa  54.3  0.000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.718112  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4634  helicase c2  31.76 
 
 		 674 aa  54.3  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1942  helicase c2  19.51 
 
 		 832 aa  53.9  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.357662  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1743  DNA polymerase III, epsilon subunit  27.71 
 
 		 930 aa  53.5  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.23026  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2538  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.62 
 
 		 690 aa  53.5  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.536241  unclonable  0.0000322681 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0709  helicase c2  32.81 
 
 		 650 aa  52.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.968194 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0820  helicase c2  32.81 
 
 		 650 aa  52.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.932295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.47 
 
 		 690 aa  52.4  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.920562  hitchhiker  0.00302525 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.02 
 
 		 690 aa  52.8  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.18 
 
 		 690 aa  52.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.18 
 
 		 690 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.18 
 
 		 690 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.18 
 
 		 690 aa  52  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6611  helicase c2  33.33 
 
 		 729 aa  51.6  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0933933 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  27.47 
 
 		 690 aa  51.6  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2470  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.92 
 
 		 690 aa  51.2  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127477 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1467  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.4 
 
 		 934 aa  50.8  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.533097  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1585  ATP-dependent DNA helicase DinG  28.41 
 
 		 725 aa  50.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  21.54 
 
 		 644 aa  49.3  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3486  helicase c2  30.12 
 
 		 698 aa  50.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1709  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.14 
 
 		 934 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000649538  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  28.74 
 
 		 647 aa  49.7  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  25.07 
 
 		 643 aa  49.3  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1409  helicase c2  24.77 
 
 		 651 aa  48.9  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1671  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.14 
 
 		 934 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.697043  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  23.31 
 
 		 646 aa  48.5  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1156  helicase c2  29.14 
 
 		 649 aa  48.9  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1425  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.34 
 
 		 934 aa  48.9  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.446116  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4478  helicase c2  23.96 
 
 		 633 aa  48.9  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.647625  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1990  helicase c2  24.9 
 
 		 649 aa  48.5  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0188  helicase c2  23.67 
 
 		 659 aa  48.5  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2097  helicase c2  27.49 
 
 		 644 aa  48.5  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0479006  normal  0.269462 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1452  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.34 
 
 		 934 aa  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1565  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.34 
 
 		 934 aa  48.1  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.554006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1347  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  29.88 
 
 		 957 aa  48.1  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.579486 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1424  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.34 
 
 		 934 aa  48.1  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  23.66 
 
 		 707 aa  48.1  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1636  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  24.34 
 
 		 934 aa  48.1  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00174148 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1265  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.97 
 
 		 929 aa  47.8  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00466144  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2527  helicase c2  24.47 
 
 		 653 aa  47.8  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0816709  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  25.45 
 
 		 692 aa  47.4  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  0.0000411022 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3854  helicase c2  25.3 
 
 		 830 aa  47  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000920192 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2627  DEAD_2 domain protein  30.08 
 
 		 723 aa  47  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1003  DNA polymerase III, epsilon subunit  26.4 
 
 		 960 aa  47  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3747  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  25.82 
 
 		 934 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.739451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1598  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.56 
 
 		 934 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00523268  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2455  helicase c2  27.22 
 
 		 641 aa  47.4  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2656  ATP-dependent DNA helicase DinG  23.95 
 
 		 690 aa  47  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.765136  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1940  ATP-dependent helicase DinG  27.22 
 
 		 665 aa  46.6  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.497186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.22 
 
 		 692 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000620367 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1403  helicase c2  25.05 
 
 		 757 aa  46.2  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.127709  hitchhiker  0.000000348035 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3224  DNA polymerase III, epsilon subunit  24.57 
 
 		 927 aa  45.8  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00101103  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  25.84 
 
 		 639 aa  45.8  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  26.06 
 
 		 691 aa  45.8  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3242  helicase c2  30.41 
 
 		 740 aa  45.4  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  26.95 
 
 		 640 aa  45.4  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1626  ATP-dependent DNA helicase-related protein  29.75 
 
 		 713 aa  45.4  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2115  bifunctional ATP-dependent DNA helicase/DNA polymerase III subunit epsilon  26.82 
 
 		 921 aa  45.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2156  DNA polymerase III, epsilon subunit  28.29 
 
 		 934 aa  45.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.814989  hitchhiker  0.00934468 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1612  putative ATP-dependent helicase  25.35 
 
 		 751 aa  45.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00100383  normal  0.548735 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1364  helicase c2  28.48 
 
 		 640 aa  45.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3770  helicase c2  25.15 
 
 		 830 aa  44.7  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0528  helicase c2  23.49 
 
 		 667 aa  44.7  0.007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.18 
 
 		 952 aa  44.3  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2524  helicase c2  24.76 
 
 		 755 aa  43.9  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00188741  decreased coverage  0.000000000263353 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2118  ATP-dependent DNA helicase DinG  22.9 
 
 		 707 aa  43.9  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149773  hitchhiker  0.000000714427 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>