286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12289 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_12289  hypothetical protein  100 
 
 
532 aa  1033    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.248752  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1688  apolipoprotein N-acyltransferase  62.73 
 
 
501 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1711  apolipoprotein N-acyltransferase  62.73 
 
 
501 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1756  apolipoprotein N-acyltransferase  62.73 
 
 
501 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  46.09 
 
 
545 aa  324  3e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0610408 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1679  apolipoprotein N-acyltransferase  31.53 
 
 
550 aa  134  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  30.63 
 
 
525 aa  133  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  30.46 
 
 
507 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  29.92 
 
 
507 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1808  apolipoprotein N-acyltransferase  29.86 
 
 
517 aa  123  7e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  29.89 
 
 
516 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  31.87 
 
 
524 aa  120  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  28.32 
 
 
477 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  28.6 
 
 
521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  28.63 
 
 
521 aa  115  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  30.2 
 
 
506 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  30.08 
 
 
510 aa  114  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2703  apolipoprotein N-acyltransferase  31.79 
 
 
536 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0493141  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0151  apolipoprotein N-acyltransferase  27.23 
 
 
475 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.721179  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  27.66 
 
 
489 aa  107  8e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2269  apolipoprotein N-acyltransferase  33.16 
 
 
559 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0937964  normal  0.125706 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  29.21 
 
 
542 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  30.57 
 
 
520 aa  105  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15980  apolipoprotein N-acyltransferase  31.8 
 
 
546 aa  105  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.280752  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  28.74 
 
 
506 aa  102  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2388  apolipoprotein N-acyltransferase  32.11 
 
 
543 aa  102  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0733975  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5319  apolipoprotein N-acyltransferase  28.38 
 
 
566 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.144278  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  27.11 
 
 
553 aa  100  8e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1060  apolipoprotein N-acyltransferase  27.02 
 
 
526 aa  99.8  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  28.84 
 
 
506 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0044  apolipoprotein N-acyltransferase  28.41 
 
 
543 aa  96.3  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00386393  unclonable  0.00000000000481156 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1180  apolipoprotein N-acyltransferase  28.31 
 
 
509 aa  96.7  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1874  apolipoprotein N-acyltransferase  28.34 
 
 
552 aa  96.3  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.118252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2349  apolipoprotein N-acyltransferase  32.1 
 
 
539 aa  96.3  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00106954  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1762  apolipoprotein N-acyltransferase  28.39 
 
 
527 aa  95.5  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3281  apolipoprotein N-acyltransferase  31.28 
 
 
495 aa  94.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.909948 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  25.66 
 
 
529 aa  94.7  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1004  apolipoprotein N-acyltransferase  26.2 
 
 
516 aa  94.7  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.13359 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1294  apolipoprotein N-acyltransferase  29.23 
 
 
518 aa  94.4  5e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.93193  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  30.98 
 
 
505 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1210  apolipoprotein N-acyltransferase  29.73 
 
 
540 aa  94.4  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.359482  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  30.73 
 
 
505 aa  94  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  28.33 
 
 
507 aa  94  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  26.67 
 
 
512 aa  94  6e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  29.57 
 
 
528 aa  94  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3596  Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  31.11 
 
 
495 aa  93.6  8e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0428669  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21790  apolipoprotein N-acyltransferase  29.68 
 
 
551 aa  93.6  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.285628  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  26.67 
 
 
512 aa  93.6  9e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  26.4 
 
 
512 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  26.4 
 
 
512 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1065  apolipoprotein N-acyltransferase  25.94 
 
 
519 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0720615 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  30.67 
 
 
557 aa  92.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  26.4 
 
 
512 aa  92  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2666  apolipoprotein N-acyltransferase  30.32 
 
 
551 aa  92  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.482048  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3700  apolipoprotein N-acyltransferase  25.53 
 
 
515 aa  92.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.582606  hitchhiker  0.0000254581 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  29.56 
 
 
479 aa  92.4  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3531  apolipoprotein N-acyltransferase  32.36 
 
 
487 aa  91.7  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0261601 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  26.4 
 
 
512 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  30.33 
 
 
505 aa  91.3  4e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4561  apolipoprotein N-acyltransferase  28.05 
 
 
559 aa  91.3  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  26.13 
 
 
512 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  26.13 
 
 
512 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1000  apolipoprotein N-acyltransferase  25.67 
 
 
516 aa  90.9  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.671685  normal  0.0816035 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  26.13 
 
 
508 aa  90.9  5e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1703  apolipoprotein N-acyltransferase  25.05 
 
 
545 aa  90.1  9e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00015013  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3876  hypothetical protein  30.75 
 
 
495 aa  90.1  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.350017  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1912  apolipoprotein N-acyltransferase  22.69 
 
 
537 aa  88.6  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000101188  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2913  apolipoprotein N-acyltransferase  25.99 
 
 
505 aa  88.6  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0601  apolipoprotein N-acyltransferase  28.25 
 
 
501 aa  88.6  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.180307  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0752  apolipoprotein N-acyltransferase  28.25 
 
 
506 aa  88.6  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179484 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3783  apolipoprotein N-acyltransferase  27.46 
 
 
507 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.299433 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1890  apolipoprotein N-acyltransferase  28.43 
 
 
593 aa  87.8  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  32.13 
 
 
505 aa  87.8  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0889  apolipoprotein N-acyltransferase  28.73 
 
 
510 aa  87.4  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.623273  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0222  apolipoprotein N-acyltransferase  21.73 
 
 
491 aa  87  7e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.4417  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  30.46 
 
 
522 aa  87  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1708  apolipoprotein N-acyltransferase  24.01 
 
 
544 aa  86.3  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00863379  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  26.61 
 
 
509 aa  86.3  0.000000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  28.86 
 
 
497 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1594  apolipoprotein N-acyltransferase  23.91 
 
 
537 aa  86.7  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.953743 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  26.27 
 
 
509 aa  86.3  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2485  apolipoprotein N-acyltransferase  28.83 
 
 
541 aa  86.3  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  26.32 
 
 
554 aa  85.5  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  27.82 
 
 
534 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  32.84 
 
 
505 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004215  apolipoprotein N-acyltransferase/copper homeostasis protein CutE  22.65 
 
 
492 aa  85.5  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  29.92 
 
 
573 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.632903 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2927  apolipoprotein N-acyltransferase  25.06 
 
 
537 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.974187  decreased coverage  0.00828182 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0241  apolipoprotein N-acyltransferase  29.77 
 
 
521 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2064  apolipoprotein N-acyltransferase  26.96 
 
 
508 aa  84.7  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0246959 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  24.6 
 
 
518 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0709  apolipoprotein N-acyltransferase  23.8 
 
 
520 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.309882  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2135  apolipoprotein N-acyltransferase  28.91 
 
 
500 aa  83.6  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.180116  normal  0.129079 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1455  apolipoprotein N-acyltransferase  28.25 
 
 
504 aa  83.2  0.00000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.0063424  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  28.45 
 
 
507 aa  83.2  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  23.16 
 
 
501 aa  82.8  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  23.95 
 
 
506 aa  83.2  0.00000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4108  apolipoprotein N-acyltransferase  28.39 
 
 
530 aa  83.2  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0125934  decreased coverage  0.00767945 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3232  apolipoprotein N-acyltransferase  26.02 
 
 
634 aa  82  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40392  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0630  apolipoprotein N-acyltransferase  30.33 
 
 
505 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.112466  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>