More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2083 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2083  permease  100 
 
 		 301 aa  578  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  45.08 
 
 		 300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0012  hypothetical protein  44.71 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  32.58 
 
 		 260 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  32.2 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  33.59 
 
 		 260 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  29.17 
 
 		 308 aa  90.9  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2279  hypothetical protein  31.54 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.705159  normal  0.384237 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  27.61 
 
 		 307 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  27.61 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  28.46 
 
 		 2798 aa  84.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  28.06 
 
 		 307 aa  82.8  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2642  hypothetical protein  27.64 
 
 		 304 aa  82.8  0.000000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  27.99 
 
 		 308 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  29.48 
 
 		 307 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0904  hypothetical protein  30.26 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.468335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  32.69 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  31.92 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  28.37 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  28.46 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0848  transmembrane protein  31.34 
 
 		 274 aa  77.4  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.57519 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  27.46 
 
 		 343 aa  77  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  31.54 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  31.54 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  28.36 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  28.03 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0466  hypothetical protein  31 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  28.73 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  29.96 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  27.78 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  25.78 
 
 		 309 aa  73.6  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  27.27 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0087  protein of unknown function DUF81  28.84 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  30.93 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48190  hypothetical protein  32.95 
 
 		 260 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.627972  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  28.81 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0302  hypothetical protein  24.4 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0028  hypothetical protein  30.73 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  28.21 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  28.85 
 
 		 306 aa  69.3  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  25.39 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  29.6 
 
 		 270 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3594  protein of unknown function DUF81  32.22 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4215  hypothetical protein  29.35 
 
 		 260 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3526  protein of unknown function DUF81  32.22 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  28.24 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  29.13 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  28.57 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  28.57 
 
 		 270 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  26.61 
 
 		 316 aa  67  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3446  hypothetical protein  31.11 
 
 		 255 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  27.04 
 
 		 316 aa  66.6  0.0000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  28.14 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  28.57 
 
 		 306 aa  66.6  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1413  hypothetical protein  31.21 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0075  protein of unknown function DUF81  26.98 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.393989  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0441  protein of unknown function DUF81  26.77 
 
 		 266 aa  65.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  27.72 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  27.72 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  29.48 
 
 		 306 aa  65.1  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  24.82 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3045  protein of unknown function DUF81  27.27 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1360  hypothetical protein  31.36 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.183653  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1613  hypothetical protein  30.93 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000897265  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0836  hypothetical protein  26.27 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00239721  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1575  hypothetical protein  30.93 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.02028  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1334  hypothetical protein  30.93 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00153027  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4025  hypothetical protein  26.34 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0751  hypothetical protein  27.71 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0692  hypothetical protein  26.17 
 
 		 257 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  27.75 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  28.86 
 
 		 260 aa  62.8  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  27.6 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1470  hypothetical protein  31.58 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0865  hypothetical protein  28.51 
 
 		 255 aa  62.4  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1507  hypothetical protein  30.51 
 
 		 266 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0347  hypothetical protein  29.85 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  25 
 
 		 251 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0552  protein of unknown function DUF81  26.84 
 
 		 265 aa  62  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  25 
 
 		 251 aa  62  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1020  protein of unknown function DUF81  26.52 
 
 		 325 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.470827  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1375  hypothetical protein  30.51 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00595709  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1333  hypothetical protein  31.14 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105686  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03708  hypothetical protein  27.23 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1425  hypothetical protein  25.1 
 
 		 426 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0163769  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1540  hypothetical protein  30.07 
 
 		 305 aa  61.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.472601 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5171  protein of unknown function DUF81  29.12 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2157  permease  24.81 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.333715  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  29.41 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  30.6 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2432  hypothetical protein  26.17 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1139  hypothetical protein  27.61 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.248182 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2371  hypothetical protein  27.48 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.643122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3097  hypothetical protein  27.38 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0521383  normal  0.0206179 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3838  hypothetical protein  30.08 
 
 		 266 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0242257  hitchhiker  0.000000000114081 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02496  hypothetical protein  27.98 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.112519  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1203  protein of unknown function DUF81  24.9 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.129839 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2357  protein of unknown function DUF81  26.77 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2100  hypothetical protein  28.57 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3420  hypothetical protein  28.09 
 
 		 269 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>