118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0635 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0635  hypothetical protein  100 
 
 
258 aa  535  1e-151  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 
352 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2859  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 
291 aa  59.3  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0761346  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1552  glycosyl transferase family 2  29.21 
 
 
299 aa  56.6  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  27.03 
 
 
274 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4384  glycosyl transferase family protein  27.38 
 
 
328 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2341  glycosyl transferase family protein  24.81 
 
 
684 aa  53.1  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  25.73 
 
 
345 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2003  glycosyl transferase family 2  24.37 
 
 
230 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
299 aa  51.6  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06620  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
221 aa  51.6  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0742  glycosyl transferase family 2  23.64 
 
 
281 aa  50.1  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.18736  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  26.5 
 
 
683 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0340  glycosyl transferase family 2  23.87 
 
 
270 aa  49.3  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.167181  normal  0.387021 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  30.83 
 
 
234 aa  49.3  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  28.1 
 
 
477 aa  49.3  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  29.13 
 
 
333 aa  49.3  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3927  glycosyl transferase family 2  26.72 
 
 
291 aa  48.9  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0077  glycosyl transferase family protein  27.41 
 
 
287 aa  48.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1382  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 
333 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6447  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 
333 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0237769  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1129  glycosyl transferase family 2  25.57 
 
 
785 aa  48.5  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0595  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
402 aa  48.1  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6038  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 
333 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.738252 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0155  glycosyl transferase family 2  22.02 
 
 
298 aa  48.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3154  putative glycosyl transferase  28.64 
 
 
613 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3362  N-glycosyltransferase  24.06 
 
 
422 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3131  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.64 
 
 
613 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3224  glycosyl transferase family protein  25.29 
 
 
273 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5040  glycosyl transferase family 2  25.3 
 
 
323 aa  47  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.476681  normal  0.0567661 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2573  glycosyl transferase family 2  25.54 
 
 
338 aa  47  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2935  family 2 glycosyl transferase  25 
 
 
272 aa  47  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.231634 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5649  glycosyl transferase family protein  23.95 
 
 
333 aa  46.2  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0900976  normal  0.264223 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0933  putative glycosyl transferase  28.14 
 
 
623 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.61745  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3434  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 
753 aa  46.2  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1651  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
206 aa  46.2  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1479  putative glycosyl transferase  26.8 
 
 
613 aa  45.8  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2763  putative glycosyl transferase  28.14 
 
 
613 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.618349  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3094  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.14 
 
 
613 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1842  putative glycosyl transferase  28.14 
 
 
613 aa  46.2  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.471452  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6397  glycosyl transferase family protein  23.95 
 
 
333 aa  46.2  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.441453  normal  0.138484 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3881  glycosyl transferase family 2  24.56 
 
 
305 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  23.23 
 
 
308 aa  45.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08131  glycosyl transferase family protein  23.61 
 
 
303 aa  45.8  0.0007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  29.41 
 
 
689 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3556  glycosyl transferase family 2  32.38 
 
 
244 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0239607 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  26 
 
 
325 aa  45.4  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0205  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 
339 aa  45.4  0.0009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13831  hypothetical protein  25.45 
 
 
302 aa  45.4  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.906412  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  22.01 
 
 
573 aa  45.4  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  29.81 
 
 
327 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0829  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 
535 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.759846  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2211  glycosyl transferase family protein  31.07 
 
 
357 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276702  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0715  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.67 
 
 
334 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.887983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  26.42 
 
 
1035 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  28.12 
 
 
326 aa  45.4  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2110  glycosyl transferase family protein  25.11 
 
 
300 aa  45.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  24.87 
 
 
306 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.81 
 
 
327 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.81 
 
 
327 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  29.81 
 
 
327 aa  45.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.81 
 
 
327 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.81 
 
 
327 aa  45.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0746  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
352 aa  45.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0487138  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  29.9 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1245  putative two-domain glycosyltransferase  21.29 
 
 
515 aa  45.1  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.216067  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3194  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 
455 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  29.81 
 
 
327 aa  45.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1461  glycosyl transferase family 2  31 
 
 
239 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0706  glycosyl transferase group 2 family protein  26.67 
 
 
334 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.36 
 
 
1737 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4066  glycosyl transferase family protein  27.19 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.766809  normal  0.229172 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  25.19 
 
 
994 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08121  glycosyl transferase family protein  23.61 
 
 
303 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0619  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 
370 aa  43.9  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0518  glycosyl transferase family protein  25.52 
 
 
341 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  26.91 
 
 
331 aa  44.3  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3740  glycosyl transferase family 2  24.43 
 
 
1523 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1624  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.5 
 
 
272 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.64128  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1614  glycosyl transferase family protein  26.62 
 
 
324 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  25.71 
 
 
294 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2126  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.5 
 
 
272 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.241698  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  27.35 
 
 
340 aa  43.5  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3188  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.5 
 
 
272 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1400  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.5 
 
 
272 aa  43.5  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.731905  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3950  glycosyl transferase family protein  28.43 
 
 
312 aa  43.5  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 
296 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  23.43 
 
 
401 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 
322 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  21.69 
 
 
1077 aa  43.1  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1529  glycosyltransferase-like protein  32.11 
 
 
660 aa  43.1  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000454914  normal  0.120995 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1351  glycosyl transferase family protein  24.62 
 
 
362 aa  43.1  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3252  glycosyl transferase family 2  26.61 
 
 
300 aa  43.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5394  bactoprenol glucosyl transferase  27.45 
 
 
312 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  31 
 
 
261 aa  43.1  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  24.59 
 
 
362 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2650  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.5 
 
 
272 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0566  glycosyltransferase-like  25.51 
 
 
327 aa  42.7  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.418965  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1730  glycosyl transferase family 2  22.67 
 
 
326 aa  42.7  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal  0.188207 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19750  predicted glycosyltransferase  24.5 
 
 
664 aa  42.7  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>