More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0430 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0430  transposase  100 
 
 		 270 aa  564  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2079  transposase  100 
 
 		 270 aa  564  1e-160  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1194  integrase catalytic region  40.15 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0470498  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0112  transposase  38.58 
 
 		 289 aa  170  3e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0546  transposase  38.58 
 
 		 289 aa  170  3e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0841  transposase  38.58 
 
 		 289 aa  170  3e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1478  integrase catalytic subunit  37.66 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.168577  normal  0.117043 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1362  integrase catalytic subunit  37.66 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397787 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1091  integrase catalytic subunit  37.66 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1055  integrase catalytic subunit  37.66 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0848  transposase  37.83 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.556417  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02200  YadA protein  36.8 
 
 		 279 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04289  transposase  36.8 
 
 		 279 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02377  hypothetical protein  36.8 
 
 		 279 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02160  hypothetical protein  36.8 
 
 		 279 aa  166  5e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.604012  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1564  integrase catalytic subunit  35.63 
 
 		 278 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1436  isrso11-transposase orfb protein  34.87 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2265  isrso11-transposase orfb protein  34.87 
 
 		 269 aa  159  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3089  isrso11-transposase orfb protein  34.87 
 
 		 278 aa  159  4e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5018  ISPsy9, transposase OrfB  36.74 
 
 		 278 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2408  isrso11-transposase orfb protein  34.48 
 
 		 278 aa  155  6e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2250  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  40.37 
 
 		 239 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2533  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  40.37 
 
 		 239 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3041  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  40.37 
 
 		 239 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2164  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  40.37 
 
 		 239 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0273  integrase catalytic subunit  36.36 
 
 		 278 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0592  integrase catalytic subunit  36.36 
 
 		 278 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398355  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1176  integrase catalytic subunit  36.36 
 
 		 278 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.155999  normal  0.139612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4616  integrase catalytic subunit  36.36 
 
 		 278 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.698457  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4680  integrase catalytic subunit  36.36 
 
 		 278 aa  155  8e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  34.48 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  34.48 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0347  integrase core domain protein  38.24 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0509  transposase  38.24 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1099  transposase  38.24 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.41959e-57 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0515  transposase  38.24 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1312  transposase  38.24 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000889717  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2024  transposase  38.24 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.08352e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2994  transposase  38.24 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4078  transposase  38.24 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0741694  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1522  transposase  38.24 
 
 		 246 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.60985e-43 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2862  transposase  37.82 
 
 		 246 aa  149  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.318  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0006  IS3 family transposase  35.02 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149374 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00620  IS150 putative transposase  36.17 
 
 		 283 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03409  IS150 putative transposase  36.17 
 
 		 283 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04283  IS150 putative transposase  36.17 
 
 		 283 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04284  IS150 putative transposase  36.17 
 
 		 283 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0153  Integrase catalytic region  36.17 
 
 		 283 aa  149  6e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03360  hypothetical protein  36.17 
 
 		 283 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02652  hypothetical protein  36.17 
 
 		 283 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03577  hypothetical protein  36.17 
 
 		 283 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00609  hypothetical protein  36.17 
 
 		 283 aa  149  6e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3760  IS150, transposase orfB  36.17 
 
 		 283 aa  149  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1365  transposase  37.82 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0447e-22 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0717  integrase catalytic subunit  34.35 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.558663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0848  integrase catalytic subunit  34.35 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1577  integrase catalytic subunit  34.35 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.279406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2077  integrase catalytic subunit  34.35 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.74373  normal  0.201044 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2412  integrase catalytic subunit  34.35 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.714231 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2437  integrase catalytic subunit  34.35 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1459  IS3 family transposase  34.63 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000914872  normal  0.0630219 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1788  IS3 family transposase  34.63 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3880  IS150 transposase orfB  35.74 
 
 		 283 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.636384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3759  integrase core subunit  32.81 
 
 		 261 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3804  integrase core subunit  32.81 
 
 		 261 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4172  integrase core subunit  32.81 
 
 		 261 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421914 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0196  integrase core subunit  32.81 
 
 		 261 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0350068 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3998  integrase core subunit  32.81 
 
 		 261 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3122  integrase core subunit  32.81 
 
 		 261 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00391606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0908  integrase core subunit  32.81 
 
 		 261 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3902  integrase core subunit  32.81 
 
 		 261 aa  145  8.000000000000001e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1074  IS150 transposase orfB  35.32 
 
 		 283 aa  145  9e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.274968 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2654  integrase catalytic subunit  32.58 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596052  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3317  integrase catalytic subunit  32.58 
 
 		 268 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.817536  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5220  transposase  34.47 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00041055  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0354  transposase  34.47 
 
 		 294 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.163187  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0553  transposase  35.23 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000171843  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3446  transposase  34.85 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000031866 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0737  transposase  35.23 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0120329  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1689  transposase  35.23 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.42483  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1784  transposase  35.23 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5175  transposase  35.23 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4045  transposase  35.23 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3205  transposase  35.23 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4456  integrase catalytic region  34.47 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3912  integrase catalytic region  34.47 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553017  normal  0.660901 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1458  integrase catalytic region  34.47 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31397  normal  0.395934 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2397  integrase catalytic region  34.47 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.861552 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1740  integrase catalytic region  34.47 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  hitchhiker  0.000236948 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3346  integrase catalytic region  34.47 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0096806 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2938  integrase catalytic region  34.47 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2727  integrase catalytic region  34.35 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74831  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1128  IS3 family transposase OrfB  32.57 
 
 		 267 aa  143  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0974  Integrase catalytic region  34.69 
 
 		 277 aa  142  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382547  normal  0.109209 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2805  integrase core domain protein  34.09 
 
 		 294 aa  143  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000153033 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0056  IS3 family transposase OrfB  32.57 
 
 		 267 aa  143  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1975  integrase catalytic subunit  32.58 
 
 		 268 aa  142  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.259629 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1214  integrase core domain protein  34.09 
 
 		 294 aa  143  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000600847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2945  Integrase catalytic region  34.69 
 
 		 277 aa  142  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0817746  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3208  Integrase catalytic region  34.69 
 
 		 277 aa  142  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928461 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>