293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_28690 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_00540  dihydroxyacetone kinase  70.86 
 
 		 571 aa  732    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28690  dihydroxyacetone kinase  100 
 
 		 581 aa  1145    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0302263 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29810  dihydroxyacetone kinase  62.13 
 
 		 578 aa  619  1e-176  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0884  dihydroxyacetone kinase  53.82 
 
 		 616 aa  539  9.999999999999999e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3102  dihydroxyacetone kinase  51.83 
 
 		 568 aa  499  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1547  dihydroxyacetone kinase  58.03 
 
 		 585 aa  493  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.462978  normal  0.25069 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1919  dihydroxyacetone kinase  50.52 
 
 		 569 aa  485  1e-136  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2599  dihydroxyacetone kinase  50 
 
 		 581 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2560  dihydroxyacetone kinase  49.83 
 
 		 581 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2605  dihydroxyacetone kinase  49.83 
 
 		 581 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4228  dihydroxyacetone kinase  51.9 
 
 		 572 aa  472  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4222  Glycerone kinase  52.18 
 
 		 576 aa  463  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2647  dihydroxyacetone kinase  51.66 
 
 		 567 aa  444  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3953  dihydroxyacetone kinase  48.89 
 
 		 587 aa  442  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0411  dihydroxyacetone kinase  48.3 
 
 		 587 aa  443  1e-123  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32080  dihydroxyacetone kinase  47.41 
 
 		 573 aa  411  1e-113  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530886  normal  0.42287 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0184  Glycerone kinase  47.62 
 
 		 612 aa  391  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000456785 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4072  Glycerone kinase  56.27 
 
 		 619 aa  368  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.572793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2484  Glycerone kinase  54.22 
 
 		 335 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  31.91 
 
 		 582 aa  296  5e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  34.13 
 
 		 583 aa  296  8e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  32.49 
 
 		 583 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  31.99 
 
 		 583 aa  289  9e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  31.99 
 
 		 583 aa  289  9e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  35.3 
 
 		 598 aa  288  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  32.15 
 
 		 583 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  32.17 
 
 		 583 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  31.99 
 
 		 583 aa  284  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  31.82 
 
 		 583 aa  283  9e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  31.99 
 
 		 583 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  31.65 
 
 		 583 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  31.51 
 
 		 583 aa  277  5e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1459  dihydroxyacetone kinase  34.08 
 
 		 589 aa  271  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478575  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0411  dihydroxyacetone kinase  34.41 
 
 		 588 aa  262  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0779  Glycerone kinase  36.19 
 
 		 546 aa  256  6e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.86082  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2360  dihydroxyacetone kinase family protein  38.74 
 
 		 335 aa  253  6e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2047  dihydroxyacetone kinase  32.46 
 
 		 612 aa  252  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7717  dihydroxyacetone kinase  35.01 
 
 		 566 aa  251  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4660  Glycerone kinase  41.14 
 
 		 334 aa  249  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49108 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0527  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase  43.49 
 
 		 333 aa  249  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2329  dihydroxyacetone kinase  35.41 
 
 		 567 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5133  dihydroxyacetone kinase  35.43 
 
 		 544 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5222  dihydroxyacetone kinase  35.43 
 
 		 544 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.829392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5514  dihydroxyacetone kinase  35.6 
 
 		 544 aa  242  1e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.84095 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2328  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.42 
 
 		 333 aa  241  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4753  Glycerone kinase  39.94 
 
 		 334 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0100124  normal  0.245979 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3297  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.67 
 
 		 330 aa  240  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4393  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.79 
 
 		 331 aa  240  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6032  dihydroxyacetone kinase  35.99 
 
 		 572 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.19 
 
 		 332 aa  239  1e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1716  dihydroxyacetone kinase  35.85 
 
 		 569 aa  239  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.631887  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  39.4 
 
 		 332 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4101  Glycerone kinase  33.57 
 
 		 544 aa  234  2.0000000000000002e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6637  dihydroxyacetone kinase  35.53 
 
 		 566 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  37.24 
 
 		 329 aa  233  1e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1105  Glycerone kinase  34.42 
 
 		 572 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5792  dihydroxyacetone kinase  35.91 
 
 		 569 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6157  dihydroxyacetone kinase  35.91 
 
 		 569 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1361  Glycerone kinase  40.06 
 
 		 333 aa  230  4e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42962  2-phosphoglycerate dehydratase  32.02 
 
 		 577 aa  231  4e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2108  dihydroxyacetone kinase  35.89 
 
 		 570 aa  231  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1909  Glycerone kinase  40.96 
 
 		 331 aa  230  6e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.366009  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4368  Glycerone kinase  38.39 
 
 		 333 aa  230  6e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2053  dihydroxyacetone kinase  35.89 
 
 		 570 aa  230  6e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  35.41 
 
 		 567 aa  229  7e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0081  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.06 
 
 		 331 aa  229  7e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2582  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  35.59 
 
 		 354 aa  229  7e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4000  Glycerone kinase  36.72 
 
 		 560 aa  230  7e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0457364  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2248  dihydroxyacetone kinase  35.89 
 
 		 616 aa  229  8e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36027  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6137  dihydroxyacetone kinase  35.95 
 
 		 616 aa  229  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1001  dihydroxyacetone kinase  35.71 
 
 		 570 aa  228  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0484962  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4109  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.36 
 
 		 330 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.987034  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44124  predicted protein  33.11 
 
 		 580 aa  228  2e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.136016  decreased coverage  0.00988345 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  40.06 
 
 		 700 aa  228  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3653  dihydroxyacetone kinase  34.58 
 
 		 548 aa  228  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0429503 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.99 
 
 		 333 aa  227  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2220  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.28 
 
 		 332 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1941  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.9 
 
 		 356 aa  226  6e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0517776 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  34.08 
 
 		 567 aa  226  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1101  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.48 
 
 		 332 aa  225  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.550542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2616  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.42 
 
 		 333 aa  225  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0611237  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1304  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.62 
 
 		 356 aa  224  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01175  dihydroxyacetone kinase, N-terminal domain protein  36.62 
 
 		 356 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2448  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  36.62 
 
 		 356 aa  224  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01185  hypothetical protein  36.62 
 
 		 356 aa  224  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.898254  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2426  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.62 
 
 		 356 aa  224  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.260612 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1342  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.96 
 
 		 332 aa  224  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00155435  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0651  Glycerone kinase  38.48 
 
 		 334 aa  224  4e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0661746  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2009  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  35.31 
 
 		 354 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.5 
 
 		 333 aa  222  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  38.91 
 
 		 695 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1359  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.13 
 
 		 369 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0972  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.12 
 
 		 331 aa  221  3e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.58 
 
 		 332 aa  221  3e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3286  dihydroxyacetone kinase family protein  38.39 
 
 		 333 aa  221  3.9999999999999997e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6114  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.15 
 
 		 333 aa  221  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0949  dihydroxyacetone kinase family protein  38.69 
 
 		 362 aa  220  6e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.181047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3419  Glycerone kinase  38.69 
 
 		 362 aa  220  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0658381  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1346  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.06 
 
 		 356 aa  220  7e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  36.64 
 
 		 694 aa  219  7.999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>