294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_32080 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_32080  dihydroxyacetone kinase  100 
 
 
573 aa  1121    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530886  normal  0.42287 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0884  dihydroxyacetone kinase  50 
 
 
616 aa  455  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28690  dihydroxyacetone kinase  47.64 
 
 
581 aa  449  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0302263 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2560  dihydroxyacetone kinase  49.29 
 
 
581 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2605  dihydroxyacetone kinase  49.29 
 
 
581 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307656  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2599  dihydroxyacetone kinase  49.38 
 
 
581 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3102  dihydroxyacetone kinase  50.18 
 
 
568 aa  431  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0411  dihydroxyacetone kinase  49.2 
 
 
587 aa  425  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3953  dihydroxyacetone kinase  49.56 
 
 
587 aa  413  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4222  Glycerone kinase  47.74 
 
 
576 aa  403  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1919  dihydroxyacetone kinase  48.77 
 
 
569 aa  395  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2647  dihydroxyacetone kinase  48.66 
 
 
567 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4072  Glycerone kinase  61.99 
 
 
619 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.572793  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00540  dihydroxyacetone kinase  47.1 
 
 
571 aa  379  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29810  dihydroxyacetone kinase  46.78 
 
 
578 aa  379  1e-104  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2484  Glycerone kinase  60.24 
 
 
335 aa  380  1e-104  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4228  dihydroxyacetone kinase  47.34 
 
 
572 aa  371  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0184  Glycerone kinase  49.24 
 
 
612 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000456785 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1547  dihydroxyacetone kinase  48.76 
 
 
585 aa  353  2.9999999999999997e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.462978  normal  0.25069 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  36.21 
 
 
598 aa  306  5.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  32.82 
 
 
582 aa  306  6e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  33.73 
 
 
583 aa  296  5e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  33.73 
 
 
583 aa  296  5e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  34.25 
 
 
583 aa  294  3e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1716  dihydroxyacetone kinase  41.92 
 
 
569 aa  292  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.631887  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1459  dihydroxyacetone kinase  36.05 
 
 
589 aa  290  3e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478575  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  33.73 
 
 
583 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  33.73 
 
 
583 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  33.56 
 
 
583 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0779  Glycerone kinase  38.03 
 
 
546 aa  284  3.0000000000000004e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.86082  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  32.99 
 
 
583 aa  283  6.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  33.73 
 
 
583 aa  282  9e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  33.73 
 
 
583 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  33.56 
 
 
583 aa  281  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4753  Glycerone kinase  46.69 
 
 
334 aa  279  9e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0100124  normal  0.245979 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  33.79 
 
 
583 aa  279  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2047  dihydroxyacetone kinase  33 
 
 
612 aa  277  4e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4660  Glycerone kinase  49.15 
 
 
334 aa  276  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.49108 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0411  dihydroxyacetone kinase  34.08 
 
 
588 aa  273  8.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  39.51 
 
 
694 aa  263  8.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2329  dihydroxyacetone kinase  38.74 
 
 
567 aa  258  2e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3316  Glycerone kinase  45.9 
 
 
333 aa  258  2e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  40.92 
 
 
695 aa  258  2e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  43.73 
 
 
694 aa  256  6e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0527  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase  44.38 
 
 
333 aa  256  6e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7717  dihydroxyacetone kinase  39.08 
 
 
566 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  37.07 
 
 
567 aa  254  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1909  Glycerone kinase  42.94 
 
 
331 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.366009  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6137  dihydroxyacetone kinase  38.83 
 
 
616 aa  250  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  44.59 
 
 
700 aa  249  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4000  Glycerone kinase  38.24 
 
 
560 aa  247  4e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0457364  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0651  Glycerone kinase  39.51 
 
 
334 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0661746  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2360  dihydroxyacetone kinase family protein  37.46 
 
 
335 aa  246  6e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4368  Glycerone kinase  44.44 
 
 
333 aa  246  6.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4101  Glycerone kinase  33.75 
 
 
544 aa  246  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1361  Glycerone kinase  41.21 
 
 
333 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6032  dihydroxyacetone kinase  37.83 
 
 
572 aa  243  9e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2053  dihydroxyacetone kinase  38.75 
 
 
570 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0877  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  45.08 
 
 
333 aa  240  5.999999999999999e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2248  dihydroxyacetone kinase  38.56 
 
 
616 aa  239  8e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36027  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6637  dihydroxyacetone kinase  38.55 
 
 
566 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1001  dihydroxyacetone kinase  38.56 
 
 
570 aa  239  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0484962  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2108  dihydroxyacetone kinase  38.56 
 
 
570 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2220  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.32 
 
 
332 aa  238  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4393  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  39.81 
 
 
331 aa  237  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0335  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  44.76 
 
 
333 aa  236  9e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0972  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.54 
 
 
331 aa  236  9e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203846  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.75 
 
 
332 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  35.71 
 
 
567 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0172  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  44.13 
 
 
333 aa  235  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1401  Glycerone kinase  39.76 
 
 
331 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0864848  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5514  dihydroxyacetone kinase  35.42 
 
 
544 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.84095 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03250  Glycerone kinase  39.06 
 
 
334 aa  234  4.0000000000000004e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000458534  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5792  dihydroxyacetone kinase  38.29 
 
 
569 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6157  dihydroxyacetone kinase  38.29 
 
 
569 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1639  Dak kinase  38.76 
 
 
333 aa  232  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0196246  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5133  dihydroxyacetone kinase  35.24 
 
 
544 aa  232  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5222  dihydroxyacetone kinase  35.24 
 
 
544 aa  232  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.829392 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0620  Glycerone kinase  47.22 
 
 
336 aa  230  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.76 
 
 
332 aa  230  4e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  41.01 
 
 
332 aa  229  7e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0081  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.19 
 
 
331 aa  229  8e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1556  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  38.41 
 
 
332 aa  229  8e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  37.39 
 
 
329 aa  229  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0697  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  43.77 
 
 
327 aa  229  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0698  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  35.37 
 
 
332 aa  227  4e-58  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0536678  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4272  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.78 
 
 
356 aa  227  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2616  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.95 
 
 
333 aa  227  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0611237  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1342  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.69 
 
 
332 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00155435  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44124  predicted protein  33.62 
 
 
580 aa  227  6e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.136016  decreased coverage  0.00988345 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3761  Dak kinase  41.49 
 
 
327 aa  225  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.41 
 
 
333 aa  224  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.8 
 
 
333 aa  223  9e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001638  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase dihydroxyacetone binding subunit DhaK  38.73 
 
 
352 aa  223  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3653  dihydroxyacetone kinase  35.46 
 
 
548 aa  222  9.999999999999999e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0429503 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2328  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40 
 
 
333 aa  220  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1359  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.72 
 
 
369 aa  220  5e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3297  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.12 
 
 
330 aa  220  6e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1340  Glycerone kinase  39.2 
 
 
334 aa  220  7e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579574  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1304  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.1 
 
 
356 aa  219  7e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>