292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4000 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4000  Glycerone kinase  100 
 
 		 560 aa  1066    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0457364  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1105  Glycerone kinase  50.18 
 
 		 572 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0779  Glycerone kinase  43.46 
 
 		 546 aa  330  3e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.86082  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4101  Glycerone kinase  41.61 
 
 		 544 aa  312  9e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5514  dihydroxyacetone kinase  41.47 
 
 		 544 aa  287  4e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.84095 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5133  dihydroxyacetone kinase  41.09 
 
 		 544 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5222  dihydroxyacetone kinase  41.09 
 
 		 544 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.829392 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  41.04 
 
 		 567 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  40.69 
 
 		 567 aa  276  5e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  30.78 
 
 		 582 aa  263  4e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6032  dihydroxyacetone kinase  39.57 
 
 		 572 aa  264  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44124  predicted protein  33.96 
 
 		 580 aa  257  5e-67  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.136016  decreased coverage  0.00988345 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2329  dihydroxyacetone kinase  39.86 
 
 		 567 aa  254  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5792  dihydroxyacetone kinase  37.5 
 
 		 569 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6157  dihydroxyacetone kinase  37.5 
 
 		 569 aa  254  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7717  dihydroxyacetone kinase  38.2 
 
 		 566 aa  250  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6637  dihydroxyacetone kinase  37.66 
 
 		 566 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2053  dihydroxyacetone kinase  39.54 
 
 		 570 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3102  dihydroxyacetone kinase  37.32 
 
 		 568 aa  248  2e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  31.48 
 
 		 583 aa  248  2e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2108  dihydroxyacetone kinase  39.54 
 
 		 570 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2248  dihydroxyacetone kinase  39.54 
 
 		 616 aa  248  3e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1101  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  48.25 
 
 		 332 aa  248  3e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.550542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  32.41 
 
 		 583 aa  247  4e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1001  dihydroxyacetone kinase  39.36 
 
 		 570 aa  247  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0484962  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28690  dihydroxyacetone kinase  36.69 
 
 		 581 aa  244  1.9999999999999999e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0302263 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2457  Glycerone kinase  51.54 
 
 		 332 aa  244  3e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2328  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45 
 
 		 333 aa  243  7e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  31.42 
 
 		 583 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  31.42 
 
 		 583 aa  242  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6137  dihydroxyacetone kinase  39.46 
 
 		 616 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2560  dihydroxyacetone kinase  37.43 
 
 		 581 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2605  dihydroxyacetone kinase  37.43 
 
 		 581 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2616  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.45 
 
 		 333 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0611237  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  31.61 
 
 		 583 aa  240  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  31.11 
 
 		 583 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  31.79 
 
 		 583 aa  239  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  31.66 
 
 		 583 aa  237  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2599  dihydroxyacetone kinase  36.84 
 
 		 581 aa  238  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  31.3 
 
 		 583 aa  237  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  31.61 
 
 		 583 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1304  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.75 
 
 		 356 aa  237  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1556  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.57 
 
 		 332 aa  237  5.0000000000000005e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  31.24 
 
 		 583 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4782  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.01 
 
 		 355 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.797257 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3297  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  46.08 
 
 		 330 aa  236  6e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2009  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.4 
 
 		 354 aa  236  9e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3915  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  46.56 
 
 		 333 aa  235  1.0000000000000001e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.708801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0697  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  43.3 
 
 		 327 aa  236  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.19 
 
 		 333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1359  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.11 
 
 		 369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04180  dihydroxyacetone kinase 1, putative  33.22 
 
 		 591 aa  235  2.0000000000000002e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.12537  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2582  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.52 
 
 		 354 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1919  dihydroxyacetone kinase  35.3 
 
 		 569 aa  235  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01175  dihydroxyacetone kinase, N-terminal domain protein  40.46 
 
 		 356 aa  234  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2448  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.46 
 
 		 356 aa  234  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01185  hypothetical protein  40.46 
 
 		 356 aa  234  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.898254  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2426  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.46 
 
 		 356 aa  234  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.260612 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1346  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40 
 
 		 356 aa  234  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1941  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.04 
 
 		 356 aa  234  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0517776 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.81 
 
 		 333 aa  233  5e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1178  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.99 
 
 		 354 aa  233  1e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516671  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32080  dihydroxyacetone kinase  38.27 
 
 		 573 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530886  normal  0.42287 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  33.1 
 
 		 598 aa  231  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6114  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  47.17 
 
 		 333 aa  230  4e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2201  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  35.99 
 
 		 331 aa  229  1e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000263646  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42962  2-phosphoglycerate dehydratase  33.09 
 
 		 577 aa  229  1e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4109  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  44.2 
 
 		 330 aa  228  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.987034  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4228  dihydroxyacetone kinase  35.94 
 
 		 572 aa  227  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57462  dihydroxyacetone kinase  30.77 
 
 		 595 aa  227  4e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0972297  normal  0.404993 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0411  dihydroxyacetone kinase  35.28 
 
 		 587 aa  226  6e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4858  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.14 
 
 		 354 aa  223  7e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0884  dihydroxyacetone kinase  35.24 
 
 		 616 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00540  dihydroxyacetone kinase  37.22 
 
 		 571 aa  220  3.9999999999999997e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0706  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.61 
 
 		 327 aa  220  6e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.598011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0893  Glycerone kinase  38.18 
 
 		 546 aa  219  1e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0960  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.36 
 
 		 329 aa  218  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0101892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1104  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.36 
 
 		 329 aa  218  2e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3048  Glycerone kinase  45.11 
 
 		 330 aa  217  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.817448 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0040  dihydroxyacetone kinase family protein  43.9 
 
 		 329 aa  216  9.999999999999999e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.18 
 
 		 364 aa  216  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0972  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.9 
 
 		 331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  40.06 
 
 		 332 aa  212  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4272  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.12 
 
 		 356 aa  212  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0963  Glycerone kinase  39.28 
 
 		 545 aa  212  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0335  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.89 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2726  Glycerone kinase  35.83 
 
 		 556 aa  211  2e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  36.56 
 
 		 329 aa  211  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29810  dihydroxyacetone kinase  34.6 
 
 		 578 aa  211  4e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001638  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase dihydroxyacetone binding subunit DhaK  36.92 
 
 		 352 aa  210  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29380  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.93 
 
 		 332 aa  210  7e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3653  dihydroxyacetone kinase  34.78 
 
 		 548 aa  209  8e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0429503 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.85 
 
 		 332 aa  209  9e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2889  Glycerone kinase  39.39 
 
 		 542 aa  208  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.19 
 
 		 332 aa  208  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1659  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  38.99 
 
 		 333 aa  207  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.14976  normal  0.0341698 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1650  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.15 
 
 		 329 aa  207  6e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4222  Glycerone kinase  35.48 
 
 		 576 aa  205  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5631  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.01 
 
 		 329 aa  204  3e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0698  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  35.33 
 
 		 332 aa  204  4e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0536678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>