294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6567 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  90.99 
 
 
567 aa  915    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  100 
 
 
567 aa  1096    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7717  dihydroxyacetone kinase  56.61 
 
 
566 aa  514  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2329  dihydroxyacetone kinase  54.29 
 
 
567 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6032  dihydroxyacetone kinase  56.47 
 
 
572 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6637  dihydroxyacetone kinase  57.07 
 
 
566 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5792  dihydroxyacetone kinase  56.79 
 
 
569 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6157  dihydroxyacetone kinase  56.79 
 
 
569 aa  499  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2248  dihydroxyacetone kinase  55.15 
 
 
616 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36027  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2053  dihydroxyacetone kinase  55.15 
 
 
570 aa  486  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1001  dihydroxyacetone kinase  54.97 
 
 
570 aa  484  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0484962  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6137  dihydroxyacetone kinase  55.99 
 
 
616 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2108  dihydroxyacetone kinase  55.15 
 
 
570 aa  485  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44124  predicted protein  43.59 
 
 
580 aa  387  1e-106  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.136016  decreased coverage  0.00988345 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  37.33 
 
 
583 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  37.33 
 
 
583 aa  369  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  36.92 
 
 
583 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  37.84 
 
 
583 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  36.88 
 
 
583 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  37.5 
 
 
583 aa  365  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  37.22 
 
 
583 aa  364  2e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  37.5 
 
 
583 aa  360  5e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  37.33 
 
 
583 aa  359  7e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  34.65 
 
 
582 aa  359  7e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  36.64 
 
 
583 aa  359  9e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  35.88 
 
 
583 aa  351  2e-95  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42962  2-phosphoglycerate dehydratase  40.44 
 
 
577 aa  346  6e-94  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2432  Glycerone kinase  42.09 
 
 
547 aa  332  9e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0739383  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0963  Glycerone kinase  44.6 
 
 
545 aa  326  8.000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459045  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2167  Glycerone kinase  43.45 
 
 
544 aa  325  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.804466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4584  Glycerone kinase  38.39 
 
 
539 aa  324  3e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.150824  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  50.45 
 
 
332 aa  323  7e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4101  Glycerone kinase  39.89 
 
 
544 aa  321  3e-86  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2328  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.87 
 
 
333 aa  315  9.999999999999999e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  51.34 
 
 
332 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1342  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  53.61 
 
 
332 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00155435  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  47.89 
 
 
329 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0779  Glycerone kinase  39.57 
 
 
546 aa  309  1.0000000000000001e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.86082  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  51.36 
 
 
333 aa  308  2.0000000000000002e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0698  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  44.48 
 
 
332 aa  306  6e-82  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0536678  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2889  Glycerone kinase  42.43 
 
 
542 aa  306  7e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.377224 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0877  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  53.17 
 
 
333 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  36.16 
 
 
598 aa  305  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  50.45 
 
 
333 aa  304  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1101  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  51.52 
 
 
332 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.550542  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  46.95 
 
 
332 aa  300  6e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1359  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.65 
 
 
369 aa  299  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0893  Glycerone kinase  41.17 
 
 
546 aa  297  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2726  Glycerone kinase  40.67 
 
 
556 aa  296  5e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0972  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  51.06 
 
 
331 aa  295  1e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203846  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1346  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.68 
 
 
356 aa  295  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01175  dihydroxyacetone kinase, N-terminal domain protein  45.96 
 
 
356 aa  294  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2448  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  45.96 
 
 
356 aa  294  3e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1556  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  49.39 
 
 
332 aa  294  3e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01185  hypothetical protein  45.96 
 
 
356 aa  294  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.898254  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2426  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.96 
 
 
356 aa  294  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.260612 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1941  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.68 
 
 
356 aa  294  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0517776 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1031  Glycerone kinase  43.21 
 
 
545 aa  293  6e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0593318  normal  0.109318 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1304  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.68 
 
 
356 aa  293  7e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3915  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  53.47 
 
 
333 aa  292  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.708801  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1650  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.88 
 
 
329 aa  291  1e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29380  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  53.47 
 
 
332 aa  291  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2616  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  50.15 
 
 
333 aa  291  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0611237  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1178  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  46.76 
 
 
354 aa  291  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516671  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5133  dihydroxyacetone kinase  39.72 
 
 
544 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5222  dihydroxyacetone kinase  39.72 
 
 
544 aa  290  3e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.829392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5514  dihydroxyacetone kinase  39.54 
 
 
544 aa  290  5.0000000000000004e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.84095 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3653  dihydroxyacetone kinase  36.89 
 
 
548 aa  289  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0429503 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1457  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  54.85 
 
 
331 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.217396  normal  0.856558 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4393  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  47.69 
 
 
331 aa  286  5e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2220  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  50.3 
 
 
332 aa  286  9e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2009  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  46.31 
 
 
354 aa  286  9e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0335  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.27 
 
 
333 aa  285  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0081  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  46.54 
 
 
331 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6114  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  51.96 
 
 
333 aa  285  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2326  Glycerone kinase  38.12 
 
 
562 aa  283  8.000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1659  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  47.73 
 
 
333 aa  283  8.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.14976  normal  0.0341698 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57462  dihydroxyacetone kinase  33.91 
 
 
595 aa  283  9e-75  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0972297  normal  0.404993 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4782  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  44.23 
 
 
355 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.797257 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2582  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  44.89 
 
 
354 aa  281  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1158  Glycerone kinase  43.92 
 
 
545 aa  281  3e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263533  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2047  dihydroxyacetone kinase  33.72 
 
 
612 aa  280  4e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4109  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  47.73 
 
 
330 aa  280  7e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.987034  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2560  dihydroxyacetone kinase  35.92 
 
 
581 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2605  dihydroxyacetone kinase  35.92 
 
 
581 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307656  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2599  dihydroxyacetone kinase  35.81 
 
 
581 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0172  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  51.36 
 
 
333 aa  276  8e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4858  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.37 
 
 
354 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3297  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  47.13 
 
 
330 aa  275  1.0000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3559  Glycerone kinase  43.46 
 
 
549 aa  274  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.463491  normal  0.192785 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1716  dihydroxyacetone kinase  37.44 
 
 
569 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.631887  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4000  Glycerone kinase  39.15 
 
 
560 aa  271  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0457364  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04180  dihydroxyacetone kinase 1, putative  33.78 
 
 
591 aa  270  4e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.12537  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0706  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.62 
 
 
327 aa  270  4e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.598011  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4272  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  44.07 
 
 
356 aa  270  5e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1459  dihydroxyacetone kinase  34.08 
 
 
589 aa  268  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478575  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23900  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  48.18 
 
 
331 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0662069  normal  0.453933 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.09 
 
 
364 aa  267  4e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2345  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.3 
 
 
320 aa  266  1e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6364  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  44.51 
 
 
329 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0674086  normal  0.470329 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>