190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2009 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2582  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  91.81 
 
 		 354 aa  679    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2009  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  100 
 
 		 354 aa  725    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1178  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  86.04 
 
 		 354 aa  626  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516671  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4782  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  69.41 
 
 		 355 aa  511  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.797257 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  65.01 
 
 		 364 aa  485  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1941  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  60.28 
 
 		 356 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0517776 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1359  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  60.56 
 
 		 369 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1346  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  60 
 
 		 356 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4272  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  60.85 
 
 		 356 aa  454  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.346583 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01175  dihydroxyacetone kinase, N-terminal domain protein  60.56 
 
 		 356 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2448  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  60.56 
 
 		 356 aa  450  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01185  hypothetical protein  60.56 
 
 		 356 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.898254  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2426  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  60.56 
 
 		 356 aa  450  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.260612 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1304  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  60.56 
 
 		 356 aa  451  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001638  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase dihydroxyacetone binding subunit DhaK  58.52 
 
 		 352 aa  432  1e-120  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  62.64 
 
 		 333 aa  433  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  62.08 
 
 		 333 aa  431  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1556  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  60.28 
 
 		 332 aa  421  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4858  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  56.06 
 
 		 354 aa  418  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2328  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  57.87 
 
 		 333 aa  401  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2616  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  60.39 
 
 		 333 aa  403  1e-111  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0611237  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3915  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  61.24 
 
 		 333 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.708801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1101  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  56.06 
 
 		 332 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.550542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2201  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  51.55 
 
 		 331 aa  364  1e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000263646  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  59.72 
 
 		 332 aa  363  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6114  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  55.62 
 
 		 333 aa  356  2.9999999999999997e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1659  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  52.53 
 
 		 333 aa  353  2.9999999999999997e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.14976  normal  0.0341698 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0972  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  50.28 
 
 		 331 aa  346  3e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3048  Glycerone kinase  52.96 
 
 		 330 aa  346  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.817448 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2347  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  57.3 
 
 		 333 aa  345  1e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.81 
 
 		 332 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5631  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  49.86 
 
 		 329 aa  341  1e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0706  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  49.58 
 
 		 327 aa  338  5.9999999999999996e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.598011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0172  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  54.49 
 
 		 333 aa  338  7e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1457  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  54.93 
 
 		 331 aa  338  7e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.217396  normal  0.856558 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0335  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  53.93 
 
 		 333 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0960  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  49.01 
 
 		 329 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0101892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1104  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  49.01 
 
 		 329 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  50.85 
 
 		 332 aa  336  2.9999999999999997e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  46.88 
 
 		 329 aa  336  3.9999999999999995e-91  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6364  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  48.17 
 
 		 329 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0674086  normal  0.470329 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29380  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  52.68 
 
 		 332 aa  333  3e-90  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0698  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.35 
 
 		 332 aa  321  1.9999999999999998e-86  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0536678  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4109  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  46.65 
 
 		 330 aa  317  1e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.987034  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3297  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  46.63 
 
 		 330 aa  315  7e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23900  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  49.44 
 
 		 331 aa  315  7e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0662069  normal  0.453933 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0081  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  48.85 
 
 		 331 aa  313  1.9999999999999998e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0040  dihydroxyacetone kinase family protein  49.72 
 
 		 329 aa  311  1e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  44.48 
 
 		 582 aa  310  2e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0697  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  46.74 
 
 		 327 aa  310  2.9999999999999997e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0877  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  49.3 
 
 		 333 aa  304  1.0000000000000001e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4393  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  45.3 
 
 		 331 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1342  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  51.41 
 
 		 332 aa  301  1e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00155435  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  44.19 
 
 		 332 aa  295  7e-79  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  43.34 
 
 		 583 aa  295  9e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  43.34 
 
 		 583 aa  293  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  43.34 
 
 		 583 aa  293  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  43.63 
 
 		 583 aa  293  4e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1154  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  50.42 
 
 		 335 aa  290  2e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543562  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  43.34 
 
 		 583 aa  290  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  43.34 
 
 		 583 aa  290  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  43.34 
 
 		 583 aa  289  4e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  43.06 
 
 		 583 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  43.06 
 
 		 583 aa  287  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  42.78 
 
 		 583 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  42.78 
 
 		 583 aa  285  8e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2457  Glycerone kinase  44.89 
 
 		 332 aa  280  2e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3126  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  47.41 
 
 		 331 aa  278  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1458  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  48.73 
 
 		 333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1650  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.31 
 
 		 329 aa  272  7e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2438  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.49 
 
 		 330 aa  271  1e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4368  Glycerone kinase  42.21 
 
 		 333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2220  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  47.85 
 
 		 332 aa  269  7e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0527  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase  45.21 
 
 		 333 aa  260  2e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2329  dihydroxyacetone kinase  42.94 
 
 		 567 aa  259  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  46.35 
 
 		 567 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6032  dihydroxyacetone kinase  42.36 
 
 		 572 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  46.02 
 
 		 567 aa  252  6e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0673  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.82 
 
 		 322 aa  251  9.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.384752  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0688  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.82 
 
 		 322 aa  251  9.000000000000001e-66  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.03804  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5792  dihydroxyacetone kinase  42.36 
 
 		 569 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6157  dihydroxyacetone kinase  42.36 
 
 		 569 aa  250  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3316  Glycerone kinase  41.48 
 
 		 333 aa  249  5e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6637  dihydroxyacetone kinase  42.07 
 
 		 566 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2360  dihydroxyacetone kinase family protein  39.32 
 
 		 335 aa  249  6e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4101  Glycerone kinase  39.6 
 
 		 544 aa  249  7e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4660  Glycerone kinase  41.19 
 
 		 334 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49108 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4753  Glycerone kinase  41.76 
 
 		 334 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0100124  normal  0.245979 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0779  Glycerone kinase  39.66 
 
 		 546 aa  245  9e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.86082  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6137  dihydroxyacetone kinase  41.5 
 
 		 616 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1001  dihydroxyacetone kinase  42.04 
 
 		 570 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0484962  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2248  dihydroxyacetone kinase  41.74 
 
 		 616 aa  242  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36027  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2053  dihydroxyacetone kinase  41.74 
 
 		 570 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2108  dihydroxyacetone kinase  41.74 
 
 		 570 aa  241  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7717  dihydroxyacetone kinase  41.5 
 
 		 566 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2345  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.64 
 
 		 320 aa  238  1e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1361  Glycerone kinase  38.15 
 
 		 333 aa  236  4e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5514  dihydroxyacetone kinase  40 
 
 		 544 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.84095 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1105  Glycerone kinase  40.6 
 
 		 572 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1909  Glycerone kinase  39.49 
 
 		 331 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.366009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>