190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001638 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001638  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase dihydroxyacetone binding subunit DhaK  100 
 
 		 352 aa  729    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4858  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  64.2 
 
 		 354 aa  485  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1941  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  60.73 
 
 		 356 aa  454  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0517776 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1359  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  60.73 
 
 		 369 aa  455  1e-127  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1346  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  60.73 
 
 		 356 aa  457  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01175  dihydroxyacetone kinase, N-terminal domain protein  60.73 
 
 		 356 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2448  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  60.73 
 
 		 356 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2426  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  60.73 
 
 		 356 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.260612 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01185  hypothetical protein  60.73 
 
 		 356 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.898254  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1304  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  60.73 
 
 		 356 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4272  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  59.44 
 
 		 356 aa  443  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2009  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  58.52 
 
 		 354 aa  432  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1178  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  59.77 
 
 		 354 aa  425  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516671  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2582  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  57.39 
 
 		 354 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.76 
 
 		 364 aa  398  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4782  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.39 
 
 		 355 aa  397  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.797257 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0972  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  51.55 
 
 		 331 aa  352  5.9999999999999994e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  50.7 
 
 		 333 aa  351  1e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1101  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  51.12 
 
 		 332 aa  350  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.550542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  47.89 
 
 		 333 aa  344  1e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1556  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  50.56 
 
 		 332 aa  342  4e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2328  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  48.6 
 
 		 333 aa  330  3e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6114  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  51.39 
 
 		 333 aa  328  1.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3915  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  49.86 
 
 		 333 aa  327  2.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.708801  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2201  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  45.61 
 
 		 331 aa  324  1e-87  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000263646  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1457  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  51.55 
 
 		 331 aa  323  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.217396  normal  0.856558 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2616  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  46.76 
 
 		 333 aa  320  3e-86  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0611237  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0335  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  50.99 
 
 		 333 aa  319  5e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3048  Glycerone kinase  49.72 
 
 		 330 aa  316  5e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.817448 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5631  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.76 
 
 		 329 aa  315  8e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0172  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  50.99 
 
 		 333 aa  314  9.999999999999999e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0706  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.48 
 
 		 327 aa  309  4e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.598011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0960  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  44.07 
 
 		 329 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0101892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1104  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  44.07 
 
 		 329 aa  308  6.999999999999999e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6364  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  44.63 
 
 		 329 aa  306  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0674086  normal  0.470329 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23900  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  49.01 
 
 		 331 aa  305  6e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0662069  normal  0.453933 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  48.31 
 
 		 332 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1659  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.5 
 
 		 333 aa  301  9e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.14976  normal  0.0341698 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0698  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.48 
 
 		 332 aa  301  1e-80  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0536678  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  46.05 
 
 		 332 aa  299  5e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0040  dihydroxyacetone kinase family protein  47.04 
 
 		 329 aa  295  1e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  47.74 
 
 		 332 aa  289  5.0000000000000004e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4393  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.57 
 
 		 331 aa  287  1e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0697  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  42.94 
 
 		 327 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2347  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  49.86 
 
 		 333 aa  287  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  41.76 
 
 		 582 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29380  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  45.94 
 
 		 332 aa  286  4e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4109  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.58 
 
 		 330 aa  286  5e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.987034  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.9 
 
 		 329 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.57 
 
 		 332 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3297  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.97 
 
 		 330 aa  283  5.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1650  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.38 
 
 		 329 aa  282  6.000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1342  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  45.48 
 
 		 332 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00155435  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0081  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.43 
 
 		 331 aa  280  3e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  42.33 
 
 		 583 aa  276  4e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  41.76 
 
 		 583 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  41.76 
 
 		 583 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0877  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  45.76 
 
 		 333 aa  273  3e-72  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2220  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  46.05 
 
 		 332 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  41.76 
 
 		 583 aa  272  6e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1154  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  46.01 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543562  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  41.76 
 
 		 583 aa  266  4e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0673  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.54 
 
 		 322 aa  266  4e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.384752  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0688  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.54 
 
 		 322 aa  266  4e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.03804  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  41.76 
 
 		 583 aa  265  8e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  41.76 
 
 		 583 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  41.76 
 
 		 583 aa  265  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  41.76 
 
 		 583 aa  265  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  41.76 
 
 		 583 aa  265  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  41.48 
 
 		 583 aa  262  6e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2457  Glycerone kinase  43.5 
 
 		 332 aa  259  7e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3126  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.91 
 
 		 331 aa  258  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2438  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.83 
 
 		 330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288269  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1458  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  44.63 
 
 		 333 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4660  Glycerone kinase  39.32 
 
 		 334 aa  242  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49108 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2329  dihydroxyacetone kinase  39.04 
 
 		 567 aa  239  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6032  dihydroxyacetone kinase  38.76 
 
 		 572 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4753  Glycerone kinase  39.89 
 
 		 334 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0100124  normal  0.245979 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2345  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.95 
 
 		 320 aa  238  2e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  40.11 
 
 		 567 aa  237  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1080  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  38.51 
 
 		 325 aa  236  6e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1105  Glycerone kinase  40.18 
 
 		 572 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0527  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase  39.55 
 
 		 333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4101  Glycerone kinase  38.86 
 
 		 544 aa  233  3e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4368  Glycerone kinase  38.81 
 
 		 333 aa  233  3e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5792  dihydroxyacetone kinase  38.2 
 
 		 569 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6157  dihydroxyacetone kinase  38.2 
 
 		 569 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6637  dihydroxyacetone kinase  38.2 
 
 		 566 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  40.96 
 
 		 567 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  37.08 
 
 		 694 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2360  dihydroxyacetone kinase family protein  37.21 
 
 		 335 aa  228  2e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6137  dihydroxyacetone kinase  38.76 
 
 		 616 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7717  dihydroxyacetone kinase  38.48 
 
 		 566 aa  224  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  36.09 
 
 		 695 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1909  Glycerone kinase  37.32 
 
 		 331 aa  223  3e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.366009  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  36.74 
 
 		 700 aa  222  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32080  dihydroxyacetone kinase  38.73 
 
 		 573 aa  222  6e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530886  normal  0.42287 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0779  Glycerone kinase  37.85 
 
 		 546 aa  221  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.86082  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3316  Glycerone kinase  37.07 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  36.8 
 
 		 694 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>