190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_23900 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_23900  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  100 
 
 
331 aa  654    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0662069  normal  0.453933 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1154  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  77.01 
 
 
335 aa  458  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543562  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1457  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  77.04 
 
 
331 aa  457  1e-127  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.217396  normal  0.856558 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0335  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  72.21 
 
 
333 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0172  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  73.11 
 
 
333 aa  441  1e-123  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0972  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  66.77 
 
 
331 aa  432  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203846  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2328  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  59.52 
 
 
333 aa  403  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  58.91 
 
 
333 aa  398  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  58.01 
 
 
333 aa  398  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6114  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  64.65 
 
 
333 aa  396  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1659  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  60.3 
 
 
333 aa  394  1e-108  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.14976  normal  0.0341698 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2616  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  60.73 
 
 
333 aa  392  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0611237  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29380  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  62.54 
 
 
332 aa  388  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3915  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  61.33 
 
 
333 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.708801  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1556  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  55.89 
 
 
332 aa  367  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4782  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  49.58 
 
 
355 aa  363  2e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.797257 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  49.17 
 
 
364 aa  363  2e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0706  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  55.59 
 
 
327 aa  362  5.0000000000000005e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.598011  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  60.73 
 
 
332 aa  358  6e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2201  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  48.64 
 
 
331 aa  358  7e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000263646  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0960  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  53.17 
 
 
329 aa  354  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0101892  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1104  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  53.17 
 
 
329 aa  354  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2582  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  50.85 
 
 
354 aa  345  4e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  55.02 
 
 
332 aa  342  5e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1101  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  53.47 
 
 
332 aa  340  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.550542  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2347  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  60.24 
 
 
333 aa  338  9.999999999999999e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0769027  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1941  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  47.89 
 
 
356 aa  337  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0517776 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0698  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  50.76 
 
 
332 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0536678  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01175  dihydroxyacetone kinase, N-terminal domain protein  47.89 
 
 
356 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2448  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  47.89 
 
 
356 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01185  hypothetical protein  47.89 
 
 
356 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.898254  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2426  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  47.89 
 
 
356 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.260612 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1304  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  47.89 
 
 
356 aa  336  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1178  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  50.86 
 
 
354 aa  335  7e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516671  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1346  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  47.61 
 
 
356 aa  335  9e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6364  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  51.06 
 
 
329 aa  334  1e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0674086  normal  0.470329 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1359  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  47.61 
 
 
369 aa  334  1e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5631  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  51.36 
 
 
329 aa  333  2e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735758  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2009  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  49.44 
 
 
354 aa  334  2e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4272  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  50.84 
 
 
356 aa  332  4e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.346583 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4109  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  51.05 
 
 
330 aa  328  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.987034  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3048  Glycerone kinase  57.4 
 
 
330 aa  328  8e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.817448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3297  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  50.76 
 
 
330 aa  327  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  48.17 
 
 
329 aa  325  8.000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0877  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  56.97 
 
 
333 aa  325  8.000000000000001e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0040  dihydroxyacetone kinase family protein  52.87 
 
 
329 aa  324  1e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0697  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  52.27 
 
 
327 aa  324  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001638  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase dihydroxyacetone binding subunit DhaK  49.01 
 
 
352 aa  324  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2438  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  52.27 
 
 
330 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288269  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1342  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  54.24 
 
 
332 aa  323  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00155435  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  52.74 
 
 
332 aa  321  8e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  48.63 
 
 
332 aa  321  9.000000000000001e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1650  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  47.62 
 
 
329 aa  315  7e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4858  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  46.22 
 
 
354 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  46.81 
 
 
582 aa  309  4e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4393  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  47.99 
 
 
331 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1458  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  55.93 
 
 
333 aa  307  1.0000000000000001e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2220  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  53.5 
 
 
332 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2457  Glycerone kinase  51.36 
 
 
332 aa  302  6.000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  47.11 
 
 
583 aa  301  1e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  47.11 
 
 
583 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  47.11 
 
 
583 aa  300  3e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0081  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  47.68 
 
 
331 aa  296  3e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  46.06 
 
 
583 aa  296  3e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  47.72 
 
 
583 aa  293  4e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  47.42 
 
 
583 aa  290  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  47.42 
 
 
583 aa  290  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  47.42 
 
 
583 aa  290  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  47.42 
 
 
583 aa  289  4e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  47.11 
 
 
583 aa  288  7e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  47.42 
 
 
583 aa  288  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3126  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  50 
 
 
331 aa  285  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76772  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3316  Glycerone kinase  49.07 
 
 
333 aa  280  3e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0673  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  47.37 
 
 
322 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.384752  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0688  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  47.37 
 
 
322 aa  274  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.03804  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2345  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.02 
 
 
320 aa  272  7e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1639  Dak kinase  41.82 
 
 
333 aa  269  5e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0196246  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1361  Glycerone kinase  44.21 
 
 
333 aa  268  8e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1909  Glycerone kinase  45.26 
 
 
331 aa  265  7e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.366009  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6032  dihydroxyacetone kinase  46.97 
 
 
572 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1080  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.46 
 
 
325 aa  263  4e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4368  Glycerone kinase  44.79 
 
 
333 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2566  Glycerone kinase  42.55 
 
 
333 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882581  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  47.88 
 
 
567 aa  261  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5792  dihydroxyacetone kinase  46.85 
 
 
569 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6157  dihydroxyacetone kinase  46.85 
 
 
569 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6637  dihydroxyacetone kinase  46.85 
 
 
566 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01180  dihydroxyacetone kinase  49.85 
 
 
332 aa  259  6e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1716  dihydroxyacetone kinase  44.92 
 
 
569 aa  259  6e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.631887  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0527  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase  45.43 
 
 
333 aa  259  6e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2360  dihydroxyacetone kinase family protein  39.34 
 
 
335 aa  258  9e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  47.2 
 
 
567 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2329  dihydroxyacetone kinase  45.18 
 
 
567 aa  256  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6137  dihydroxyacetone kinase  46.99 
 
 
616 aa  256  3e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0779  Glycerone kinase  47.9 
 
 
546 aa  255  9e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.86082  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7717  dihydroxyacetone kinase  46.67 
 
 
566 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03250  Glycerone kinase  39.68 
 
 
334 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000458534  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22060  Glycerone kinase  41.03 
 
 
333 aa  253  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0651  Glycerone kinase  38.91 
 
 
334 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0661746  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1401  Glycerone kinase  40.91 
 
 
331 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0864848  normal  0.637354 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>