290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1716 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1716  dihydroxyacetone kinase  100 
 
 
569 aa  1111    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.631887  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3316  Glycerone kinase  67.17 
 
 
333 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4368  Glycerone kinase  53.31 
 
 
333 aa  345  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2360  dihydroxyacetone kinase family protein  47.59 
 
 
335 aa  337  3.9999999999999995e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0527  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase  52.55 
 
 
333 aa  336  7e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4660  Glycerone kinase  49.4 
 
 
334 aa  323  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.49108 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  38.79 
 
 
598 aa  322  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  47.43 
 
 
695 aa  321  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4753  Glycerone kinase  49.7 
 
 
334 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0100124  normal  0.245979 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1459  dihydroxyacetone kinase  38.67 
 
 
589 aa  315  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478575  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  47.88 
 
 
694 aa  312  9e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32080  dihydroxyacetone kinase  40.9 
 
 
573 aa  312  1e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530886  normal  0.42287 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  49.7 
 
 
700 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1909  Glycerone kinase  49.24 
 
 
331 aa  311  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.366009  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  48.19 
 
 
332 aa  307  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1401  Glycerone kinase  46.95 
 
 
331 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0864848  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  34.49 
 
 
583 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  47.88 
 
 
694 aa  304  4.0000000000000003e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  33.85 
 
 
583 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  33.85 
 
 
583 aa  298  1e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  32.4 
 
 
582 aa  299  1e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1639  Dak kinase  45.03 
 
 
333 aa  298  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0196246  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  33.62 
 
 
583 aa  297  3e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0651  Glycerone kinase  45.18 
 
 
334 aa  296  5e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0661746  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2560  dihydroxyacetone kinase  38.42 
 
 
581 aa  296  8e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2605  dihydroxyacetone kinase  38.42 
 
 
581 aa  296  8e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307656  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22060  Glycerone kinase  48.19 
 
 
333 aa  296  8e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2484  Glycerone kinase  46.04 
 
 
335 aa  294  3e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  46.71 
 
 
333 aa  293  5e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  47.01 
 
 
333 aa  293  5e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  46.34 
 
 
332 aa  291  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3761  Dak kinase  49.85 
 
 
327 aa  291  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1342  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  48.31 
 
 
332 aa  291  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00155435  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0884  dihydroxyacetone kinase  37.79 
 
 
616 aa  290  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2047  dihydroxyacetone kinase  37.31 
 
 
612 aa  290  6e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4393  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  45.12 
 
 
331 aa  290  7e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  33.85 
 
 
583 aa  289  8e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2566  Glycerone kinase  46.71 
 
 
333 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882581  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  33.85 
 
 
583 aa  288  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  33.62 
 
 
583 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  33.97 
 
 
583 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2599  dihydroxyacetone kinase  37.72 
 
 
581 aa  288  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  33.62 
 
 
583 aa  287  5e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1659  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  48.05 
 
 
333 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.14976  normal  0.0341698 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2220  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  47.73 
 
 
332 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  33.68 
 
 
583 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4069  Glycerone kinase  48.45 
 
 
330 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0698  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.39 
 
 
332 aa  284  4.0000000000000003e-75  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0536678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  33.8 
 
 
583 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0411  dihydroxyacetone kinase  37.01 
 
 
587 aa  283  6.000000000000001e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2616  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.65 
 
 
333 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0611237  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03250  Glycerone kinase  43.41 
 
 
334 aa  283  8.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000458534  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0081  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  45.54 
 
 
331 aa  282  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0172  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  49.55 
 
 
333 aa  282  1e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0335  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  49.25 
 
 
333 aa  281  2e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0411  dihydroxyacetone kinase  37.67 
 
 
588 aa  281  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.77 
 
 
332 aa  280  4e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2328  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.05 
 
 
333 aa  278  2e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1572  dihydroxyacetone kinase family protein  48.76 
 
 
330 aa  278  3e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0152467  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0972  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  47.22 
 
 
331 aa  276  5e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203846  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1458  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.81 
 
 
333 aa  276  8e-73  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3915  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  48.05 
 
 
333 aa  276  9e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.708801  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6114  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  48.65 
 
 
333 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.47 
 
 
329 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3126  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  45.54 
 
 
331 aa  275  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76772  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  37.72 
 
 
567 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  37.89 
 
 
567 aa  272  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28690  dihydroxyacetone kinase  35.85 
 
 
581 aa  271  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0302263 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7717  dihydroxyacetone kinase  38.37 
 
 
566 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0877  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  47.4 
 
 
333 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1340  Glycerone kinase  48.32 
 
 
334 aa  270  5e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579574  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6137  dihydroxyacetone kinase  38.68 
 
 
616 aa  270  7e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23900  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  45.99 
 
 
331 aa  269  1e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0662069  normal  0.453933 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00540  dihydroxyacetone kinase  35.53 
 
 
571 aa  268  2e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6637  dihydroxyacetone kinase  38.07 
 
 
566 aa  267  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2329  dihydroxyacetone kinase  37.69 
 
 
567 aa  266  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1178  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.29 
 
 
354 aa  266  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516671  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1556  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.51 
 
 
332 aa  265  2e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5792  dihydroxyacetone kinase  38.61 
 
 
569 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6157  dihydroxyacetone kinase  38.61 
 
 
569 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1457  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  48.62 
 
 
331 aa  263  6.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.217396  normal  0.856558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4072  Glycerone kinase  44.05 
 
 
619 aa  262  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.572793  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0960  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.9 
 
 
329 aa  262  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0101892  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1104  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.9 
 
 
329 aa  262  1e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3823  Glycerone kinase  47.52 
 
 
330 aa  261  3e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386942  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.01 
 
 
364 aa  261  3e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1547  dihydroxyacetone kinase  39.96 
 
 
585 aa  261  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.462978  normal  0.25069 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1361  Glycerone kinase  42.81 
 
 
333 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0949  dihydroxyacetone kinase family protein  44.01 
 
 
362 aa  259  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.181047  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3419  Glycerone kinase  44.01 
 
 
362 aa  259  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0658381  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0356  Glycerone kinase  48.49 
 
 
330 aa  258  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3211  Glycerone kinase  41.41 
 
 
332 aa  258  2e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1941  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.66 
 
 
356 aa  258  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0517776 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0697  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  43.6 
 
 
327 aa  258  3e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3286  dihydroxyacetone kinase family protein  43.67 
 
 
333 aa  256  5e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1304  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.66 
 
 
356 aa  256  5e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01175  dihydroxyacetone kinase, N-terminal domain protein  39.66 
 
 
356 aa  256  6e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2448  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  39.66 
 
 
356 aa  256  6e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2426  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.66 
 
 
356 aa  256  6e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.260612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3297  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.74 
 
 
330 aa  256  6e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>