293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0411 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1459  dihydroxyacetone kinase  79.86 
 
 		 589 aa  907    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478575  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  70.08 
 
 		 598 aa  795    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2047  dihydroxyacetone kinase  73.41 
 
 		 612 aa  846    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0411  dihydroxyacetone kinase  100 
 
 		 588 aa  1174    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1639  Dak kinase  67.58 
 
 		 333 aa  461  9.999999999999999e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0196246  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0651  Glycerone kinase  63.77 
 
 		 334 aa  441  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0661746  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1809  dihydroxyacetone kinase family protein  71.99 
 
 		 334 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.331719  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1340  Glycerone kinase  68.88 
 
 		 334 aa  433  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.579574  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0807  dihydroxyacetone kinase family protein  71.99 
 
 		 334 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1098  dihydroxyacetone kinase family protein  71.99 
 
 		 334 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.210139  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0460  dihydroxyacetone kinase  71.99 
 
 		 334 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.418275  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0365  dihydroxyacetone kinase, subunit I  71.99 
 
 		 334 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2071  dihydroxyacetone kinase family protein  71.99 
 
 		 334 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1796  putative kinase  71.69 
 
 		 334 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03250  Glycerone kinase  63.64 
 
 		 334 aa  425  1e-117  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000458534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2566  Glycerone kinase  64.26 
 
 		 333 aa  412  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3286  dihydroxyacetone kinase family protein  64.65 
 
 		 333 aa  406  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3419  Glycerone kinase  64.86 
 
 		 362 aa  409  1.0000000000000001e-112  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0658381  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0949  dihydroxyacetone kinase family protein  64.86 
 
 		 362 aa  409  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.181047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22060  Glycerone kinase  63.75 
 
 		 333 aa  404  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1401  Glycerone kinase  61.47 
 
 		 331 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0864848  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4069  Glycerone kinase  62.08 
 
 		 330 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1572  dihydroxyacetone kinase family protein  61.82 
 
 		 330 aa  370  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0152467  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3823  Glycerone kinase  63.33 
 
 		 330 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.386942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0356  Glycerone kinase  62.54 
 
 		 330 aa  368  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3211  Glycerone kinase  53.64 
 
 		 332 aa  355  2e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  34.47 
 
 		 583 aa  315  1.9999999999999998e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  33.62 
 
 		 583 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  33.62 
 
 		 583 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  32.82 
 
 		 583 aa  306  7e-82  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  34.13 
 
 		 583 aa  304  4.0000000000000003e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  33.79 
 
 		 583 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  32.2 
 
 		 582 aa  303  7.000000000000001e-81  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  33.62 
 
 		 583 aa  303  8.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  33.62 
 
 		 583 aa  302  9e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  33.79 
 
 		 583 aa  302  9e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2599  dihydroxyacetone kinase  34.6 
 
 		 581 aa  300  7e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  33.62 
 
 		 583 aa  299  9e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  33.45 
 
 		 583 aa  298  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2560  dihydroxyacetone kinase  34.36 
 
 		 581 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2605  dihydroxyacetone kinase  34.36 
 
 		 581 aa  298  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1919  dihydroxyacetone kinase  35.27 
 
 		 569 aa  297  5e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28690  dihydroxyacetone kinase  35.09 
 
 		 581 aa  290  6e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0302263 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2360  dihydroxyacetone kinase family protein  42.11 
 
 		 335 aa  287  2.9999999999999996e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1716  dihydroxyacetone kinase  37.69 
 
 		 569 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.631887  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0527  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase  48.93 
 
 		 333 aa  286  5.999999999999999e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  46.25 
 
 		 700 aa  286  9e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  43.37 
 
 		 694 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4753  Glycerone kinase  44.98 
 
 		 334 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0100124  normal  0.245979 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32080  dihydroxyacetone kinase  34.48 
 
 		 573 aa  284  4.0000000000000003e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530886  normal  0.42287 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  43.98 
 
 		 695 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0411  dihydroxyacetone kinase  34.02 
 
 		 587 aa  279  9e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4660  Glycerone kinase  44.38 
 
 		 334 aa  278  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49108 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0884  dihydroxyacetone kinase  34.58 
 
 		 616 aa  277  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.98 
 
 		 332 aa  274  3e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1909  Glycerone kinase  46.32 
 
 		 331 aa  273  6e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.366009  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4368  Glycerone kinase  43.48 
 
 		 333 aa  271  2e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3953  dihydroxyacetone kinase  34.59 
 
 		 587 aa  271  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  43.37 
 
 		 694 aa  267  4e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3316  Glycerone kinase  45.23 
 
 		 333 aa  266  1e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7717  dihydroxyacetone kinase  33.11 
 
 		 566 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4222  Glycerone kinase  34.83 
 
 		 576 aa  263  6.999999999999999e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4228  dihydroxyacetone kinase  35.14 
 
 		 572 aa  263  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.48 
 
 		 332 aa  261  2e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1659  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.43 
 
 		 333 aa  259  6e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.14976  normal  0.0341698 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  35.15 
 
 		 567 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  34.69 
 
 		 567 aa  257  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6137  dihydroxyacetone kinase  34.14 
 
 		 616 aa  257  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3102  dihydroxyacetone kinase  33.33 
 
 		 568 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6637  dihydroxyacetone kinase  33.56 
 
 		 566 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1547  dihydroxyacetone kinase  35.99 
 
 		 585 aa  251  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.462978  normal  0.25069 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5792  dihydroxyacetone kinase  33.84 
 
 		 569 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6157  dihydroxyacetone kinase  33.84 
 
 		 569 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0698  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.25 
 
 		 332 aa  249  8e-65  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0536678  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  43.69 
 
 		 332 aa  249  9e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6032  dihydroxyacetone kinase  33.56 
 
 		 572 aa  249  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1556  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.21 
 
 		 332 aa  248  3e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.74 
 
 		 329 aa  247  4e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2220  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  46.3 
 
 		 332 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2329  dihydroxyacetone kinase  33.1 
 
 		 567 aa  246  9e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0184  Glycerone kinase  35.5 
 
 		 612 aa  245  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000456785 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29810  dihydroxyacetone kinase  32.45 
 
 		 578 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2484  Glycerone kinase  40.69 
 
 		 335 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1342  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  45.15 
 
 		 332 aa  244  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00155435  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1361  Glycerone kinase  40 
 
 		 333 aa  241  2e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00540  dihydroxyacetone kinase  32.99 
 
 		 571 aa  241  2.9999999999999997e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4393  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.74 
 
 		 331 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0972  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.52 
 
 		 331 aa  239  6.999999999999999e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6114  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.94 
 
 		 333 aa  239  6.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.96 
 
 		 333 aa  238  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44124  predicted protein  32.98 
 
 		 580 aa  238  2e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.136016  decreased coverage  0.00988345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1101  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  40.3 
 
 		 332 aa  237  5.0000000000000005e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.550542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.27 
 
 		 333 aa  237  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3761  Dak kinase  44.89 
 
 		 327 aa  236  7e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0877  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.24 
 
 		 333 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2328  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.92 
 
 		 333 aa  235  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3297  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.01 
 
 		 330 aa  234  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1797  dihydroxyacetone kinase family protein  63.3 
 
 		 554 aa  232  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.510313  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4072  Glycerone kinase  41.67 
 
 		 619 aa  232  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.572793  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1808  dihydroxyacetone kinase family protein  63.3 
 
 		 219 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.112766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>