294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4222 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4222  Glycerone kinase  100 
 
 		 576 aa  1130    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2560  dihydroxyacetone kinase  63.29 
 
 		 581 aa  695    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2605  dihydroxyacetone kinase  63.29 
 
 		 581 aa  695    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2599  dihydroxyacetone kinase  63.12 
 
 		 581 aa  692    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0884  dihydroxyacetone kinase  53.66 
 
 		 616 aa  536  1e-151  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4072  Glycerone kinase  51.86 
 
 		 619 aa  528  1e-148  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.572793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0411  dihydroxyacetone kinase  54.95 
 
 		 587 aa  520  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28690  dihydroxyacetone kinase  52.18 
 
 		 581 aa  511  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0302263 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3102  dihydroxyacetone kinase  53.33 
 
 		 568 aa  504  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1919  dihydroxyacetone kinase  52.96 
 
 		 569 aa  501  1e-140  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3953  dihydroxyacetone kinase  54.25 
 
 		 587 aa  497  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2647  dihydroxyacetone kinase  51.73 
 
 		 567 aa  473  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0184  Glycerone kinase  54.39 
 
 		 612 aa  464  1e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000456785 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00540  dihydroxyacetone kinase  50.97 
 
 		 571 aa  456  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29810  dihydroxyacetone kinase  50.86 
 
 		 578 aa  458  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4228  dihydroxyacetone kinase  52.12 
 
 		 572 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1547  dihydroxyacetone kinase  55.34 
 
 		 585 aa  438  1e-121  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.462978  normal  0.25069 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32080  dihydroxyacetone kinase  48.78 
 
 		 573 aa  407  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530886  normal  0.42287 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2484  Glycerone kinase  53.31 
 
 		 335 aa  338  9.999999999999999e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  30.58 
 
 		 582 aa  288  1e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  32.08 
 
 		 583 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  31.56 
 
 		 583 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  31.56 
 
 		 583 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  31.85 
 
 		 583 aa  282  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  32.02 
 
 		 583 aa  282  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  34.74 
 
 		 598 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  31.68 
 
 		 583 aa  280  6e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  31.96 
 
 		 583 aa  278  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  31.51 
 
 		 583 aa  278  2e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  31.68 
 
 		 583 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  31.51 
 
 		 583 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  31.57 
 
 		 583 aa  274  4.0000000000000004e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6637  dihydroxyacetone kinase  37.28 
 
 		 566 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1459  dihydroxyacetone kinase  34.8 
 
 		 589 aa  271  2.9999999999999997e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478575  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2329  dihydroxyacetone kinase  37.5 
 
 		 567 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5792  dihydroxyacetone kinase  36.79 
 
 		 569 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6157  dihydroxyacetone kinase  36.79 
 
 		 569 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7717  dihydroxyacetone kinase  36.35 
 
 		 566 aa  264  3e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2047  dihydroxyacetone kinase  34.93 
 
 		 612 aa  262  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0411  dihydroxyacetone kinase  34.3 
 
 		 588 aa  261  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6137  dihydroxyacetone kinase  37 
 
 		 616 aa  261  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4753  Glycerone kinase  42.69 
 
 		 334 aa  261  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0100124  normal  0.245979 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4660  Glycerone kinase  42.69 
 
 		 334 aa  259  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49108 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2248  dihydroxyacetone kinase  37.91 
 
 		 616 aa  256  8e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.36027  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2108  dihydroxyacetone kinase  37.74 
 
 		 570 aa  256  9e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6032  dihydroxyacetone kinase  36.72 
 
 		 572 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2053  dihydroxyacetone kinase  37.35 
 
 		 570 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1001  dihydroxyacetone kinase  37.18 
 
 		 570 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0484962  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1716  dihydroxyacetone kinase  36.1 
 
 		 569 aa  246  8e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.631887  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2360  dihydroxyacetone kinase family protein  37.54 
 
 		 335 aa  241  2e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  39.16 
 
 		 694 aa  237  5.0000000000000005e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  40.48 
 
 		 700 aa  237  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4368  Glycerone kinase  40.52 
 
 		 333 aa  236  7e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0527  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase  42.73 
 
 		 333 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  38.97 
 
 		 694 aa  235  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  38.81 
 
 		 695 aa  234  3e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5514  dihydroxyacetone kinase  35.69 
 
 		 544 aa  233  6e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.84095 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0779  Glycerone kinase  34.81 
 
 		 546 aa  233  7.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.86082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0620  Glycerone kinase  46.65 
 
 		 336 aa  231  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44124  predicted protein  35.37 
 
 		 580 aa  229  8e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.136016  decreased coverage  0.00988345 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4393  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  39.58 
 
 		 331 aa  229  1e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5133  dihydroxyacetone kinase  35.16 
 
 		 544 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5222  dihydroxyacetone kinase  35.16 
 
 		 544 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.829392 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1639  Dak kinase  37.91 
 
 		 333 aa  226  8e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0196246  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  34.66 
 
 		 567 aa  226  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0651  Glycerone kinase  38.79 
 
 		 334 aa  224  3e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0661746  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1401  Glycerone kinase  40.24 
 
 		 331 aa  224  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0864848  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2220  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.11 
 
 		 332 aa  223  6e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.9 
 
 		 332 aa  223  6e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  35.06 
 
 		 567 aa  223  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  37.84 
 
 		 329 aa  223  7e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0697  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  40.95 
 
 		 327 aa  218  2.9999999999999998e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2566  Glycerone kinase  39.63 
 
 		 333 aa  217  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.99 
 
 		 333 aa  216  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.1 
 
 		 333 aa  216  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1909  Glycerone kinase  40.06 
 
 		 331 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.366009  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.47 
 
 		 332 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4101  Glycerone kinase  33.93 
 
 		 544 aa  215  1.9999999999999998e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3286  dihydroxyacetone kinase family protein  40.3 
 
 		 333 aa  213  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3419  Glycerone kinase  40.61 
 
 		 362 aa  213  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0658381  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0949  dihydroxyacetone kinase family protein  40.61 
 
 		 362 aa  213  9e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.181047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1342  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.09 
 
 		 332 aa  213  9e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00155435  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  38.51 
 
 		 332 aa  213  1e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4000  Glycerone kinase  36.65 
 
 		 560 aa  213  1e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0457364  normal  0.30561 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1361  Glycerone kinase  38.58 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22060  Glycerone kinase  39.33 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0081  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  37.88 
 
 		 331 aa  211  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1556  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  37.8 
 
 		 332 aa  209  1e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  35.99 
 
 		 364 aa  207  3e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03250  Glycerone kinase  36.42 
 
 		 334 aa  207  3e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000458534  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3316  Glycerone kinase  38.28 
 
 		 333 aa  207  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0356  Glycerone kinase  41.9 
 
 		 330 aa  207  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1359  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  35.29 
 
 		 369 aa  206  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3211  Glycerone kinase  38.41 
 
 		 332 aa  205  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01175  dihydroxyacetone kinase, N-terminal domain protein  35.39 
 
 		 356 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2448  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  35.39 
 
 		 356 aa  204  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1304  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  35.39 
 
 		 356 aa  204  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2426  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  35.39 
 
 		 356 aa  204  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.260612 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01185  hypothetical protein  35.39 
 
 		 356 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.898254  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1346  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  35.11 
 
 		 356 aa  204  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>