190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1361 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A1361  Glycerone kinase  100 
 
 
333 aa  667    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4660  Glycerone kinase  50.6 
 
 
334 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.49108 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4753  Glycerone kinase  49.7 
 
 
334 aa  314  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0100124  normal  0.245979 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3825  Glycerone kinase  46.48 
 
 
695 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0322545  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1064  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  48.62 
 
 
332 aa  305  9.000000000000001e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.471952  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4071  Glycerone kinase  46.97 
 
 
694 aa  302  7.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1025  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  48.18 
 
 
332 aa  291  8e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000362358  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2056  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  45.87 
 
 
329 aa  289  4e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.265436  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1909  Glycerone kinase  47.22 
 
 
331 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.366009  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4368  Glycerone kinase  46.57 
 
 
333 aa  288  7e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1570  dihydroxyacetone kinase family protein  47.27 
 
 
694 aa  288  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0904773  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1403  Glycerone kinase  47.58 
 
 
700 aa  285  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.411748  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0698  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.99 
 
 
332 aa  285  8e-76  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0536678  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0877  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  48.01 
 
 
333 aa  280  2e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1342  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  48.79 
 
 
332 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00155435  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0972  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  45.87 
 
 
331 aa  278  8e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.203846  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1639  Dak kinase  43.44 
 
 
333 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0196246  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2360  dihydroxyacetone kinase family protein  43.03 
 
 
335 aa  273  4.0000000000000004e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0527  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase  46.2 
 
 
333 aa  272  6e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1262  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.12 
 
 
332 aa  271  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2220  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  47.87 
 
 
332 aa  268  1e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  42.81 
 
 
582 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4393  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  43.65 
 
 
331 aa  266  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.838317  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3126  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  44.68 
 
 
331 aa  265  1e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.76772  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0356  Glycerone kinase  46.2 
 
 
330 aa  263  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3297  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  44.51 
 
 
330 aa  263  3e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2484  Glycerone kinase  43.56 
 
 
335 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2328  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  44.38 
 
 
333 aa  261  8e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0081  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.49 
 
 
331 aa  261  1e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1766  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.07 
 
 
333 aa  261  1e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.471951 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1556  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.72 
 
 
332 aa  259  4e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4109  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  45.43 
 
 
330 aa  259  4e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.987034  normal  0.0344371 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0335  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  46.95 
 
 
333 aa  259  5.0000000000000005e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1650  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.26 
 
 
329 aa  258  1e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  41.9 
 
 
583 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  41.9 
 
 
583 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  42.51 
 
 
583 aa  257  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2044  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.16 
 
 
333 aa  257  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799824  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  43.03 
 
 
598 aa  256  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0706  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  42.33 
 
 
327 aa  255  7e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.598011  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  41.59 
 
 
583 aa  255  9e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3316  Glycerone kinase  43.07 
 
 
333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0620  Glycerone kinase  45.9 
 
 
336 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1401  Glycerone kinase  40.24 
 
 
331 aa  253  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0864848  normal  0.637354 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1457  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  46.65 
 
 
331 aa  252  6e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.217396  normal  0.856558 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23900  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  44.21 
 
 
331 aa  250  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0662069  normal  0.453933 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  41.59 
 
 
583 aa  248  7e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  41.9 
 
 
583 aa  248  8e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  41.9 
 
 
583 aa  248  8e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  41.28 
 
 
583 aa  248  9e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  41.59 
 
 
583 aa  248  1e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0172  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  46.04 
 
 
333 aa  248  1e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0651  Glycerone kinase  39.22 
 
 
334 aa  247  2e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0661746  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  41.59 
 
 
583 aa  248  2e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1080  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.67 
 
 
325 aa  247  2e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3915  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.38 
 
 
333 aa  246  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.708801  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  41.59 
 
 
583 aa  246  4e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1659  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  39.58 
 
 
333 aa  246  4e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.14976  normal  0.0341698 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03250  Glycerone kinase  39.81 
 
 
334 aa  246  4.9999999999999997e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000458534  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32080  dihydroxyacetone kinase  41.21 
 
 
573 aa  246  4.9999999999999997e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530886  normal  0.42287 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1359  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.32 
 
 
369 aa  244  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1304  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.32 
 
 
356 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1346  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.03 
 
 
356 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01175  dihydroxyacetone kinase, N-terminal domain protein  39.32 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2448  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  39.32 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4782  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.89 
 
 
355 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.797257 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01185  hypothetical protein  39.32 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.898254  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2426  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.32 
 
 
356 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.260612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1101  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.69 
 
 
332 aa  243  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.550542  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1941  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.03 
 
 
356 aa  243  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0517776 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1458  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  43.94 
 
 
333 aa  242  5e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5631  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.1 
 
 
329 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.735758  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29380  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  41.72 
 
 
332 aa  241  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1459  dihydroxyacetone kinase  42.12 
 
 
589 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.478575  normal  0.373423 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2616  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  41.77 
 
 
333 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0611237  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6364  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.43 
 
 
329 aa  239  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0674086  normal  0.470329 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1716  dihydroxyacetone kinase  43.32 
 
 
569 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.631887  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4069  Glycerone kinase  41.25 
 
 
330 aa  238  9e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3286  dihydroxyacetone kinase family protein  38.81 
 
 
333 aa  238  9e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3419  Glycerone kinase  38.81 
 
 
362 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0658381  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2566  Glycerone kinase  39.58 
 
 
333 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882581  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2074  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.05 
 
 
364 aa  238  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.71364  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0949  dihydroxyacetone kinase family protein  38.81 
 
 
362 aa  238  1e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.181047  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6114  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  42.55 
 
 
333 aa  237  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22060  Glycerone kinase  38.79 
 
 
333 aa  237  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4072  Glycerone kinase  41.64 
 
 
619 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.572793  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2582  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  36.99 
 
 
354 aa  236  3e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2009  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.15 
 
 
354 aa  236  3e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.324635 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1572  dihydroxyacetone kinase family protein  40.92 
 
 
330 aa  236  4e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0152467  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2201  dihydroxyacetone kinase, DhaK subunit  36.62 
 
 
331 aa  235  8e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000263646  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1178  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  37.01 
 
 
354 aa  235  9e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.516671  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0411  dihydroxyacetone kinase  40.55 
 
 
587 aa  233  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0960  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.94 
 
 
329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0101892  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1104  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  39.94 
 
 
329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0673  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.98 
 
 
322 aa  232  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.384752  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0688  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  40.98 
 
 
322 aa  232  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.03804  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  41.99 
 
 
567 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2345  dihydroxyacetone kinase subunit DhaK  38.79 
 
 
320 aa  231  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28690  dihydroxyacetone kinase  40.06 
 
 
581 aa  230  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0302263 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0697  dihydroxyacetone kinase DhaK, subunit 1  41.77 
 
 
327 aa  231  2e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>